68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A3114 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C3161  putative addiction module antidote protein, family  100 
 
 
95 aa  190  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522134  normal  0.0866726 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3114  putative addiction module antidote protein, family  100 
 
 
95 aa  190  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00986416  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3096  putative addiction module antidote protein, family  97.89 
 
 
95 aa  185  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000273876  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0979  CC2985 family addiction module antidote protein  90.36 
 
 
83 aa  148  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.819659  normal  0.593839 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2373  CC2985 family addiction module antidote protein  90.36 
 
 
98 aa  148  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1152  putative addiction module antidote protein, CC2985 family  90.36 
 
 
98 aa  148  3e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.622534  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3456  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  76.92 
 
 
86 aa  131  3e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4216  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  73.42 
 
 
86 aa  125  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.802046  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6083  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  42.31 
 
 
81 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0758428  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1516  addiction module antidote protein  42.17 
 
 
82 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.542717  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1795  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  42.17 
 
 
82 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.792091  normal  0.0311976 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5139  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  42.31 
 
 
81 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.776288 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1560  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  37.97 
 
 
80 aa  63.2  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4231  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  40.51 
 
 
81 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.371092  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0986  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  44.59 
 
 
83 aa  60.8  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0710  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  38.55 
 
 
89 aa  60.5  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0441596  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1160  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  37.97 
 
 
83 aa  60.1  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00620029 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0025  transcriptional regulator  47.06 
 
 
85 aa  60.1  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.591857 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4798  transcriptional regulator  37.04 
 
 
106 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00706632  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6189  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  38.36 
 
 
82 aa  57.4  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.330303 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3830  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  35 
 
 
81 aa  57  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.582275 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2396  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  35 
 
 
81 aa  57  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.379983 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0116  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  45.31 
 
 
80 aa  56.2  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0124  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  45.31 
 
 
80 aa  56.2  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6369  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  36.99 
 
 
82 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.547419 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00623  predicted transcriptional regulator  45.45 
 
 
80 aa  55.1  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.685731  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0442  CC2985 family addiction module antidote protein  42.25 
 
 
80 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0490  putative addiction module antidote protein, CC2985 family  42.25 
 
 
80 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11988  hypothetical protein  40.54 
 
 
83 aa  52  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2215  transcriptional regulator  47.62 
 
 
86 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.340179  normal  0.767767 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0594  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  38.67 
 
 
91 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.165994 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3216  CC2985 family addiction module antidote protein  40.62 
 
 
87 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4672  putative addiction module antidote protein, CC2985 family  40.62 
 
 
87 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0287  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  39.44 
 
 
79 aa  50.1  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0078  hypothetical protein  39.08 
 
 
80 aa  50.1  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0005  CC2985 family addiction module antidote protein  34.62 
 
 
80 aa  48.1  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.182538 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5395  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  38.16 
 
 
85 aa  47  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.808179  normal  0.0137087 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4209  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  38.57 
 
 
86 aa  46.6  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2354  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  46.48 
 
 
90 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0572  hypothetical protein  36.51 
 
 
94 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0521089  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2830  transcriptional regulator  36.07 
 
 
85 aa  45.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3722  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  44.83 
 
 
96 aa  45.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000176838  normal  0.422089 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6482  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  36.07 
 
 
88 aa  45.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.216447  normal  0.763821 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1324  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  41.67 
 
 
83 aa  45.4  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.179973 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2012  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  39.66 
 
 
87 aa  44.3  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1929  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  39.66 
 
 
87 aa  44.3  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.139901  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1988  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  39.66 
 
 
87 aa  44.3  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0290888  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60040  hypothetical protein  45.76 
 
 
90 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000786845  hitchhiker  0.00000000572352 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4524  addiction module antidote family protein  45.76 
 
 
90 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.529015  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3093  helix-turn-helix protein, CopG  29.41 
 
 
84 aa  43.5  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3156  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  37.29 
 
 
82 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.291032 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3225  hypothetical protein  38.89 
 
 
88 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000332578 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3027  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  35 
 
 
85 aa  42.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1300  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  30.88 
 
 
83 aa  42.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5432  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  37.1 
 
 
89 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1569  KluA  33.87 
 
 
131 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000021473  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2031  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  30.88 
 
 
87 aa  42  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0700  transcription regulator  35.53 
 
 
80 aa  41.2  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.41093  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1503  hypothetical protein  34.38 
 
 
86 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000588383  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3466  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  43.59 
 
 
86 aa  41.6  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.187433  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0093  hypothetical protein  34.38 
 
 
86 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113068  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0064  hypothetical protein  34.21 
 
 
97 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000734159  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0075  KluA  34.21 
 
 
97 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0076  hypothetical protein  34.38 
 
 
86 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000349525  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4793  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  37.29 
 
 
81 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.540186  normal  0.317968 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1220  hypothetical protein  33.78 
 
 
86 aa  40.4  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000222291  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0335  transcription regulator  39.34 
 
 
99 aa  40.4  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000170849  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01564  predicted transcriptional regulators containing the CopG/Arc/MetJ DNA-binding domain  43.1 
 
 
86 aa  40.4  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.730888  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>