39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_5432 on replicon NC_010727
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010727  Mpop_5432  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  100 
 
 		 89 aa  174  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1046  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 80 aa  82  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5298  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  51.95 
 
 		 84 aa  80.1  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.803296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3093  helix-turn-helix protein, CopG  49.44 
 
 		 84 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4222  hypothetical protein  48.24 
 
 		 88 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.138741 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7136  hypothetical protein  48.78 
 
 		 97 aa  76.6  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1735  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  46.34 
 
 		 82 aa  71.2  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2088  transcriptional regulator  44.71 
 
 		 85 aa  67.8  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0268696  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1511  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  42.86 
 
 		 81 aa  64.3  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.416754 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3027  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  48.44 
 
 		 85 aa  63.2  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01196  helix-turn-helix protein, CopG  39.02 
 
 		 76 aa  62.4  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1324  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 83 aa  60.5  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.179973 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2745  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  38.46 
 
 		 83 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.698152 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2884  transcriptional regulator  44.19 
 
 		 83 aa  55.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.579696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5158  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  52.38 
 
 		 77 aa  55.1  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.491967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2489  putative transcriptional regulator, CopG/Arc/MetJ family  39.74 
 
 		 83 aa  53.9  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.75624  normal  0.124302 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06880  hypothetical protein  30.12 
 
 		 79 aa  53.5  0.0000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.613488  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2127  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 78 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.114302  normal  0.153 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2652  hypothetical protein  46.51 
 
 		 78 aa  52.4  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5523  addiction module antidote family protein  46.51 
 
 		 107 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3749  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  65.62 
 
 		 81 aa  52.4  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.359793  normal  0.747078 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4630  hypothetical protein  44.26 
 
 		 104 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0887651 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3568  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.951393  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3206  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  35.42 
 
 		 86 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0460524 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2938  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  42.5 
 
 		 76 aa  47.4  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6479  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  41.86 
 
 		 79 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.853863 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3161  putative addiction module antidote protein, family  37.1 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522134  normal  0.0866726 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3114  putative addiction module antidote protein, family  37.1 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00986416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2373  CC2985 family addiction module antidote protein  37.1 
 
 		 98 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02722  hypothetical protein  33.33 
 
 		 55 aa  42  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1152  putative addiction module antidote protein, CC2985 family  37.1 
 
 		 98 aa  42  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.622534  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4216  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 86 aa  42  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.802046  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3456  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  33.87 
 
 		 86 aa  41.6  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0979  CC2985 family addiction module antidote protein  37.1 
 
 		 83 aa  42  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.819659  normal  0.593839 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3066  hypothetical protein  41.46 
 
 		 88 aa  40.8  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0287  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  29.17 
 
 		 79 aa  41.2  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2661  hypothetical protein  41.46 
 
 		 85 aa  40.4  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5139  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  38.33 
 
 		 81 aa  40.4  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.776288 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0726  putative transcriptional regulator, CopG/Arc/MetJ family  33.33 
 
 		 82 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0763324 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>