54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2830 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2830  transcriptional regulator  100 
 
 
85 aa  163  8e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6482  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  71.08 
 
 
88 aa  116  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.216447  normal  0.763821 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3156  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  58.67 
 
 
82 aa  86.3  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.291032 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3466  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  57.33 
 
 
86 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.187433  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3225  hypothetical protein  44.83 
 
 
88 aa  62  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000332578 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4672  putative addiction module antidote protein, CC2985 family  36.25 
 
 
87 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3216  CC2985 family addiction module antidote protein  36.25 
 
 
87 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2354  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  43.37 
 
 
90 aa  54.3  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4209  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  37.8 
 
 
86 aa  54.7  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2012  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  38.75 
 
 
87 aa  52  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1929  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  38.75 
 
 
87 aa  52  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.139901  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1988  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  38.75 
 
 
87 aa  52  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0290888  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0594  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  55.1 
 
 
91 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.165994 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0124  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  44.9 
 
 
80 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0116  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  44.9 
 
 
80 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0490  putative addiction module antidote protein, CC2985 family  35 
 
 
80 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0442  CC2985 family addiction module antidote protein  35 
 
 
80 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0078  hypothetical protein  46.94 
 
 
80 aa  48.5  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1516  addiction module antidote protein  39.13 
 
 
82 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.542717  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1795  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  39.13 
 
 
82 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.792091  normal  0.0311976 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0986  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  44.9 
 
 
83 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0979  CC2985 family addiction module antidote protein  39.34 
 
 
83 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.819659  normal  0.593839 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2373  CC2985 family addiction module antidote protein  39.34 
 
 
98 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1152  putative addiction module antidote protein, CC2985 family  39.34 
 
 
98 aa  47.8  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.622534  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3830  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  39.29 
 
 
81 aa  47  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.582275 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0005  CC2985 family addiction module antidote protein  43.14 
 
 
80 aa  46.6  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.182538 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2396  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  38.1 
 
 
81 aa  46.2  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.379983 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5139  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  45.65 
 
 
81 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.776288 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1707  hypothetical protein  34.62 
 
 
85 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.812427  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3456  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  37.7 
 
 
86 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3537  transcription regulator  44.78 
 
 
98 aa  45.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.539095  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3161  putative addiction module antidote protein, family  36.07 
 
 
95 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522134  normal  0.0866726 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3114  putative addiction module antidote protein, family  36.07 
 
 
95 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00986416  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2586  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  38.1 
 
 
80 aa  45.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0288657  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4798  transcriptional regulator  34.52 
 
 
106 aa  44.7  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00706632  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0025  transcriptional regulator  35.06 
 
 
85 aa  44.7  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.591857 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0160  transcriptional regulator  32.93 
 
 
98 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.160533  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6189  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  42 
 
 
82 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.330303 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0287  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  36.36 
 
 
79 aa  44.7  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6083  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  47.83 
 
 
81 aa  44.3  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0758428  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4231  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  35.37 
 
 
81 aa  44.7  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.371092  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1628  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  42.11 
 
 
82 aa  43.9  0.0008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.35476  normal  0.317062 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0572  hypothetical protein  45.28 
 
 
94 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0521089  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00623  predicted transcriptional regulator  40 
 
 
80 aa  43.9  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.685731  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6369  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  40 
 
 
82 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.547419 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3096  putative addiction module antidote protein, family  34.43 
 
 
95 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000273876  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0710  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  42.86 
 
 
89 aa  42.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0441596  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1560  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  28 
 
 
80 aa  42.4  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2417  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  40 
 
 
82 aa  40.8  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3722  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  50 
 
 
96 aa  40.8  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000176838  normal  0.422089 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1160  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  31.33 
 
 
83 aa  40.4  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00620029 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4793  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  35.29 
 
 
81 aa  40.4  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.540186  normal  0.317968 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5395  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  47.83 
 
 
85 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.808179  normal  0.0137087 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1103  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  32.26 
 
 
83 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.305268 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>