51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0160 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0160  transcriptional regulator  100 
 
 		 98 aa  191  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.160533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0594  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  59.7 
 
 		 91 aa  87.8  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.165994 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0572  hypothetical protein  47.92 
 
 		 94 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0521089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5395  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  48.05 
 
 		 85 aa  71.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.808179  normal  0.0137087 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2354  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  44.44 
 
 		 90 aa  58.5  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4209  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  48.75 
 
 		 86 aa  57.8  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3225  hypothetical protein  41.79 
 
 		 88 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000332578 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5139  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  40.79 
 
 		 81 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.776288 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2012  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  43.08 
 
 		 87 aa  55.1  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1929  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  43.08 
 
 		 87 aa  55.1  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.139901  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1988  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  43.08 
 
 		 87 aa  55.1  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0290888  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1160  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  40.26 
 
 		 83 aa  53.9  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00620029 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0710  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 89 aa  52.4  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0441596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1795  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  37.66 
 
 		 82 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.792091  normal  0.0311976 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1516  addiction module antidote protein  37.66 
 
 		 82 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.542717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2031  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  35.8 
 
 		 87 aa  50.4  0.000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0025  transcriptional regulator  43.28 
 
 		 85 aa  50.1  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.591857 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1300  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  33.75 
 
 		 83 aa  48.9  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6189  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  39.39 
 
 		 82 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.330303 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0986  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  37.35 
 
 		 83 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3537  transcription regulator  42.17 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.539095  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6369  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  38.81 
 
 		 82 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.547419 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4672  putative addiction module antidote protein, CC2985 family  42.62 
 
 		 87 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3216  CC2985 family addiction module antidote protein  42.62 
 
 		 87 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2586  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  41.33 
 
 		 80 aa  47.8  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0288657  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0116  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  42.47 
 
 		 80 aa  47  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0124  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  42.47 
 
 		 80 aa  47  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2396  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 81 aa  47  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.379983 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4793  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  37.5 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.540186  normal  0.317968 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1560  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 80 aa  46.6  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3830  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.582275 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3156  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  40 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.291032 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3061  transcription regulator  48.15 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0439063 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01564  predicted transcriptional regulators containing the CopG/Arc/MetJ DNA-binding domain  44.44 
 
 		 86 aa  46.2  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.730888  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2830  transcriptional regulator  32.93 
 
 		 85 aa  44.7  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3722  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  43.4 
 
 		 96 aa  44.3  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000176838  normal  0.422089 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11988  hypothetical protein  40.3 
 
 		 83 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0287  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  39.73 
 
 		 79 aa  44.3  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6482  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 88 aa  43.9  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.216447  normal  0.763821 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0490  putative addiction module antidote protein, CC2985 family  35.48 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0442  CC2985 family addiction module antidote protein  35.48 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2215  transcriptional regulator  35.82 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.340179  normal  0.767767 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0335  transcription regulator  35.82 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000170849  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4231  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  31.17 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.371092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6083  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0758428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4798  transcriptional regulator  38.33 
 
 		 106 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00706632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00623  predicted transcriptional regulator  40.98 
 
 		 80 aa  41.2  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.685731  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4216  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 86 aa  41.6  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.802046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60040  hypothetical protein  38.16 
 
 		 90 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000786845  hitchhiker  0.00000000572352 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4524  addiction module antidote family protein  36.84 
 
 		 90 aa  40.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.529015  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2417  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  46.15 
 
 		 82 aa  40  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>