57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0572 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0572  hypothetical protein  100 
 
 		 94 aa  184  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0521089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0594  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  59.42 
 
 		 91 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.165994 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0160  transcriptional regulator  49.37 
 
 		 98 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.160533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1160  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  40.85 
 
 		 83 aa  63.5  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00620029 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5139  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  41.67 
 
 		 81 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.776288 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11988  hypothetical protein  41.46 
 
 		 83 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0986  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  41.79 
 
 		 83 aa  57  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0710  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 89 aa  57  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0441596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1300  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  40.48 
 
 		 83 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1795  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  43.24 
 
 		 82 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.792091  normal  0.0311976 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1516  addiction module antidote protein  43.24 
 
 		 82 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.542717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5395  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  39.74 
 
 		 85 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.808179  normal  0.0137087 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2354  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  49.21 
 
 		 90 aa  54.7  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6189  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  41.94 
 
 		 82 aa  53.5  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.330303 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6083  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 81 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0758428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2031  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  39.29 
 
 		 87 aa  53.1  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6369  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  41.94 
 
 		 82 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.547419 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2396  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 81 aa  50.8  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.379983 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1988  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  43.08 
 
 		 87 aa  50.8  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0290888  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2012  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  43.08 
 
 		 87 aa  50.8  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1929  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  43.08 
 
 		 87 aa  50.8  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.139901  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3225  hypothetical protein  43.48 
 
 		 88 aa  50.4  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000332578 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3830  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 81 aa  50.4  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.582275 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4231  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  40.3 
 
 		 81 aa  49.7  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.371092  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3156  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  42.42 
 
 		 82 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.291032 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3456  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  35.82 
 
 		 86 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1560  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 80 aa  48.5  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00623  predicted transcriptional regulator  34.29 
 
 		 80 aa  48.5  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.685731  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0025  transcriptional regulator  39.29 
 
 		 85 aa  48.5  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.591857 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1628  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 82 aa  48.9  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.35476  normal  0.317062 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4793  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  45.1 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.540186  normal  0.317968 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3722  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  47.17 
 
 		 96 aa  47.4  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000176838  normal  0.422089 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4526  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 82 aa  46.6  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.234903  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0442  CC2985 family addiction module antidote protein  37.5 
 
 		 80 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0116  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  36.36 
 
 		 80 aa  45.4  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0490  putative addiction module antidote protein, CC2985 family  37.5 
 
 		 80 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4209  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  41.18 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3114  putative addiction module antidote protein, family  36.51 
 
 		 95 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00986416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3161  putative addiction module antidote protein, family  36.51 
 
 		 95 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522134  normal  0.0866726 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2586  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  42.86 
 
 		 80 aa  45.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0288657  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0124  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  36.36 
 
 		 80 aa  45.4  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2373  CC2985 family addiction module antidote protein  36.51 
 
 		 98 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1152  putative addiction module antidote protein, CC2985 family  36.51 
 
 		 98 aa  45.4  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.622534  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0979  CC2985 family addiction module antidote protein  36.51 
 
 		 83 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.819659  normal  0.593839 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0005  CC2985 family addiction module antidote protein  40.74 
 
 		 80 aa  44.3  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.182538 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2830  transcriptional regulator  45.28 
 
 		 85 aa  43.9  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0287  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  34.29 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6482  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.216447  normal  0.763821 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4798  transcriptional regulator  35.71 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00706632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3096  putative addiction module antidote protein, family  33.33 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000273876  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4672  putative addiction module antidote protein, CC2985 family  34.43 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3216  CC2985 family addiction module antidote protein  34.43 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2215  transcriptional regulator  44.64 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.340179  normal  0.767767 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3061  transcription regulator  42.59 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0439063 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2417  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  40.35 
 
 		 82 aa  42  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3537  transcription regulator  49.12 
 
 		 98 aa  42  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.539095  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2088  transcriptional regulator  35.38 
 
 		 85 aa  40.8  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0268696  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>