66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_A0078 on replicon NC_004349
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004349  SO_A0078  hypothetical protein  100 
 
 		 80 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0116  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  68.75 
 
 		 80 aa  111  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0124  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  68.75 
 
 		 80 aa  111  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0442  CC2985 family addiction module antidote protein  55 
 
 		 80 aa  90.9  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0490  putative addiction module antidote protein, CC2985 family  55 
 
 		 80 aa  90.9  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4231  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  48.1 
 
 		 81 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.371092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6083  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  46.84 
 
 		 81 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0758428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0710  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 89 aa  70.9  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0441596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00623  predicted transcriptional regulator  49.25 
 
 		 80 aa  68.2  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.685731  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1160  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  52.46 
 
 		 83 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00620029 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1795  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  43.59 
 
 		 82 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.792091  normal  0.0311976 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1516  addiction module antidote protein  43.59 
 
 		 82 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.542717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1560  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 80 aa  64.3  0.0000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4798  transcriptional regulator  50.82 
 
 		 106 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00706632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0986  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  44.16 
 
 		 83 aa  63.5  0.0000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3830  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 81 aa  62.8  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.582275 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5139  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  45.16 
 
 		 81 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.776288 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0287  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  40.28 
 
 		 79 aa  61.2  0.000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2396  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 81 aa  60.8  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.379983 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0025  transcriptional regulator  44.26 
 
 		 85 aa  60.5  0.000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.591857 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11988  hypothetical protein  50.82 
 
 		 83 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2586  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  38.96 
 
 		 80 aa  58.2  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0288657  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6189  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  42.86 
 
 		 82 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.330303 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0005  CC2985 family addiction module antidote protein  49.12 
 
 		 80 aa  58.2  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.182538 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2417  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  44.26 
 
 		 82 aa  57  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6369  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  41.27 
 
 		 82 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.547419 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3156  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  37.18 
 
 		 82 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.291032 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4209  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  44.26 
 
 		 86 aa  52  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2215  transcriptional regulator  46.77 
 
 		 86 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.340179  normal  0.767767 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4672  putative addiction module antidote protein, CC2985 family  43.55 
 
 		 87 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3161  putative addiction module antidote protein, family  39.08 
 
 		 95 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522134  normal  0.0866726 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3114  putative addiction module antidote protein, family  39.08 
 
 		 95 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00986416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0594  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  42.86 
 
 		 91 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.165994 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1152  putative addiction module antidote protein, CC2985 family  46.15 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.622534  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3216  CC2985 family addiction module antidote protein  43.55 
 
 		 87 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0979  CC2985 family addiction module antidote protein  46.15 
 
 		 83 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.819659  normal  0.593839 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2373  CC2985 family addiction module antidote protein  46.15 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6211  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  56.41 
 
 		 64 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1988  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  43.33 
 
 		 87 aa  49.3  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0290888  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1929  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  43.33 
 
 		 87 aa  49.3  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.139901  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2012  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  43.33 
 
 		 87 aa  49.3  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6482  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.216447  normal  0.763821 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2354  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  39.24 
 
 		 90 aa  48.9  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4216  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 86 aa  48.9  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.802046  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3225  hypothetical protein  40.62 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000332578 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2830  transcriptional regulator  46.94 
 
 		 85 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3096  putative addiction module antidote protein, family  46.88 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000273876  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1628  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 82 aa  46.2  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.35476  normal  0.317062 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5395  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  42.19 
 
 		 85 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.808179  normal  0.0137087 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2643  hypothetical protein  49.15 
 
 		 82 aa  45.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.921856  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3456  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  42.19 
 
 		 86 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1359  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  47.54 
 
 		 81 aa  45.1  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.126717 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3722  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  45.65 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000176838  normal  0.422089 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4526  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.234903  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4222  hypothetical protein  36.62 
 
 		 88 aa  42  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.138741 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60040  hypothetical protein  37.93 
 
 		 90 aa  41.6  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000786845  hitchhiker  0.00000000572352 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4524  addiction module antidote family protein  37.93 
 
 		 90 aa  41.6  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.529015  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1103  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  29.23 
 
 		 83 aa  41.2  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.305268 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5222  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 63 aa  40.8  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1735  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  32.86 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5182  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  50 
 
 		 91 aa  40.8  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.407541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2828  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 83 aa  40  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2756  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 83 aa  40  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0651038 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3466  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  39.53 
 
 		 86 aa  40  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.187433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2058  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 83 aa  40  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0138913  normal  0.0242142 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1315  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 83 aa  40  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.955845  normal  0.0662167 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>