40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2756 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1315  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  100 
 
 		 83 aa  166  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.955845  normal  0.0662167 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2058  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  100 
 
 		 83 aa  166  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0138913  normal  0.0242142 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2756  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  100 
 
 		 83 aa  166  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0651038 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2828  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  100 
 
 		 83 aa  166  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2377  transcription regulator  56.96 
 
 		 83 aa  87  7e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4906  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  45.33 
 
 		 90 aa  68.2  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2012  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  50.91 
 
 		 87 aa  56.2  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1929  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  50.91 
 
 		 87 aa  56.2  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.139901  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1988  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  50.91 
 
 		 87 aa  56.2  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0290888  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4672  putative addiction module antidote protein, CC2985 family  47.27 
 
 		 87 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3216  CC2985 family addiction module antidote protein  47.27 
 
 		 87 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3225  hypothetical protein  57.78 
 
 		 88 aa  52.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000332578 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2354  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  39.47 
 
 		 90 aa  51.6  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2215  transcriptional regulator  45.59 
 
 		 86 aa  50.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.340179  normal  0.767767 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2031  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  50 
 
 		 87 aa  50.1  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1300  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  48.08 
 
 		 83 aa  48.9  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4209  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  38.6 
 
 		 86 aa  47.8  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1628  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 82 aa  47.4  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.35476  normal  0.317062 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0594  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  45 
 
 		 91 aa  47  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.165994 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5222  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  48.72 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6211  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  50 
 
 		 64 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00623  predicted transcriptional regulator  33.77 
 
 		 80 aa  44.7  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.685731  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1560  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 80 aa  44.3  0.0005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3156  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  40.82 
 
 		 82 aa  42.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.291032 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2643  hypothetical protein  38.46 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.921856  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0490  putative addiction module antidote protein, CC2985 family  50 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0442  CC2985 family addiction module antidote protein  50 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5395  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  45.65 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.808179  normal  0.0137087 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0099  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  46.67 
 
 		 62 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0335  transcription regulator  35.14 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000170849  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3830  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 81 aa  40.8  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.582275 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2396  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 81 aa  40.8  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.379983 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1160  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  36.36 
 
 		 83 aa  40.8  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00620029 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5139  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  37.33 
 
 		 81 aa  40.8  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.776288 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6189  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  41.82 
 
 		 82 aa  40.4  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.330303 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2910  transcriptional regulator  40 
 
 		 84 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.206676  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1707  hypothetical protein  42.5 
 
 		 85 aa  40.4  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.812427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0116  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  35.85 
 
 		 80 aa  40  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0124  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  35.85 
 
 		 80 aa  40  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0078  hypothetical protein  36.54 
 
 		 80 aa  40  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>