25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A0093 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A1569  KluA  98.84 
 
 
131 aa  170  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000021473  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0076  hypothetical protein  100 
 
 
86 aa  170  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000349525  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0093  hypothetical protein  100 
 
 
86 aa  170  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113068  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1503  hypothetical protein  100 
 
 
86 aa  170  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000588383  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0064  hypothetical protein  100 
 
 
97 aa  169  9e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000734159  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0075  KluA  100 
 
 
97 aa  169  9e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1220  hypothetical protein  97.67 
 
 
86 aa  167  5e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000222291  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2291  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  55.13 
 
 
88 aa  85.5  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0419933  normal  0.142796 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6595  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  53.85 
 
 
89 aa  85.5  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00498827  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5834  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  56.1 
 
 
89 aa  85.9  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207589  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5510  putative transcriptional regulator, CopG/Arc/MetJ family  56.41 
 
 
89 aa  85.1  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5390  putative transcriptional regulator, CopG/Arc/MetJ family  70.91 
 
 
91 aa  82  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1995  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  57.89 
 
 
92 aa  75.1  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0305  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  57.89 
 
 
92 aa  75.1  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0432771  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2219  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  58.46 
 
 
82 aa  68.9  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.114297  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5111  putative transcriptional regulator, CopG/Arc/MetJ family  49.15 
 
 
155 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.128076  normal  0.0578974 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0774  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  44 
 
 
64 aa  48.1  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.213463 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2215  transcriptional regulator  32.14 
 
 
86 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.340179  normal  0.767767 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3456  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  37.66 
 
 
86 aa  44.3  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2884  transcriptional regulator  48.57 
 
 
83 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.579696  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1025  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  47.5 
 
 
90 aa  41.6  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3114  putative addiction module antidote protein, family  34.38 
 
 
95 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00986416  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3161  putative addiction module antidote protein, family  34.38 
 
 
95 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522134  normal  0.0866726 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5139  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  40.35 
 
 
81 aa  40.4  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.776288 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3093  helix-turn-helix protein, CopG  33.33 
 
 
84 aa  40  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>