32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2884 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2884  transcriptional regulator  100 
 
 		 83 aa  163  8e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.579696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4222  hypothetical protein  40.48 
 
 		 88 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.138741 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6479  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  42.17 
 
 		 79 aa  58.9  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.853863 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3568  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 77 aa  58.2  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.951393  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3093  helix-turn-helix protein, CopG  42.11 
 
 		 84 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5158  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  57.14 
 
 		 77 aa  57  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.491967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3206  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  50.88 
 
 		 86 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0460524 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5432  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  44.19 
 
 		 89 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5523  addiction module antidote family protein  52.27 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2938  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  49.09 
 
 		 76 aa  55.1  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2652  hypothetical protein  50 
 
 		 78 aa  55.5  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1046  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 80 aa  55.1  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2127  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  50 
 
 		 78 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.114302  normal  0.153 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2088  transcriptional regulator  45.45 
 
 		 85 aa  54.7  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0268696  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0726  putative transcriptional regulator, CopG/Arc/MetJ family  50 
 
 		 82 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0763324 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01196  helix-turn-helix protein, CopG  42.22 
 
 		 76 aa  53.1  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5298  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  37.93 
 
 		 84 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.803296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1324  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 83 aa  52  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.179973 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1511  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  43.75 
 
 		 81 aa  52  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.416754 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7136  hypothetical protein  37.93 
 
 		 97 aa  50.8  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1735  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  38.6 
 
 		 82 aa  50.1  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3027  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  45.45 
 
 		 85 aa  45.4  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6482  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.216447  normal  0.763821 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0986  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  38.89 
 
 		 83 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1220  hypothetical protein  48.57 
 
 		 86 aa  41.6  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000222291  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1503  hypothetical protein  48.57 
 
 		 86 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000588383  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0093  hypothetical protein  48.57 
 
 		 86 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113068  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5270  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  38.98 
 
 		 85 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0076  hypothetical protein  48.57 
 
 		 86 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000349525  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0064  hypothetical protein  48.57 
 
 		 97 aa  41.2  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000734159  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1569  KluA  48.57 
 
 		 131 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000021473  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0075  KluA  48.57 
 
 		 97 aa  41.2  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>