30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6479 on replicon NC_012854
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012854  Rleg_6479  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  100 
 
 
79 aa  163  8e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.853863 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2652  hypothetical protein  72.22 
 
 
78 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5523  addiction module antidote family protein  65.33 
 
 
107 aa  100  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3568  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  63.16 
 
 
77 aa  97.8  4e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.951393  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5158  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  67.12 
 
 
77 aa  96.3  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.491967  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2938  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  70.77 
 
 
76 aa  95.5  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2127  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  72.6 
 
 
78 aa  89  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.114302  normal  0.153 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2400  hypothetical protein  57.69 
 
 
132 aa  60.5  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.976103 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3027  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  45.21 
 
 
85 aa  60.5  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02722  hypothetical protein  50 
 
 
55 aa  59.7  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2884  transcriptional regulator  42.17 
 
 
83 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.579696  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6276  hypothetical protein  49.33 
 
 
102 aa  57  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0089402  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1046  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  35.44 
 
 
80 aa  53.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0726  putative transcriptional regulator, CopG/Arc/MetJ family  38.46 
 
 
82 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0763324 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2088  transcriptional regulator  37.97 
 
 
85 aa  52  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0268696  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01196  helix-turn-helix protein, CopG  30.77 
 
 
76 aa  50.4  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1324  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  39.62 
 
 
83 aa  48.9  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.179973 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3206  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  42.86 
 
 
86 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0460524 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3093  helix-turn-helix protein, CopG  47.62 
 
 
84 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5432  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  41.86 
 
 
89 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4222  hypothetical protein  40.74 
 
 
88 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.138741 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7136  hypothetical protein  53.49 
 
 
97 aa  45.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5298  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  53.49 
 
 
84 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.803296  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1735  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  35.71 
 
 
82 aa  43.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5270  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  35.53 
 
 
85 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0710  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  38.1 
 
 
89 aa  42.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0441596  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6189  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  34.62 
 
 
82 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.330303 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4231  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  36.49 
 
 
81 aa  41.6  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.371092  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1511  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  44.74 
 
 
81 aa  40.4  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.416754 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6369  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  33.33 
 
 
82 aa  40  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.547419 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>