46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1046 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1046  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  100 
 
 		 80 aa  164  4e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7136  hypothetical protein  71.25 
 
 		 97 aa  118  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3093  helix-turn-helix protein, CopG  70.13 
 
 		 84 aa  114  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5298  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  70.13 
 
 		 84 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.803296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1511  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  75.76 
 
 		 81 aa  105  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.416754 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4222  hypothetical protein  48.72 
 
 		 88 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.138741 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5432  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  48.78 
 
 		 89 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01196  helix-turn-helix protein, CopG  46.15 
 
 		 76 aa  78.2  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1735  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  50 
 
 		 82 aa  77  0.00000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2088  transcriptional regulator  44.16 
 
 		 85 aa  74.7  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0268696  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3749  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  63.33 
 
 		 81 aa  66.2  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.359793  normal  0.747078 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3027  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  48.33 
 
 		 85 aa  58.2  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1324  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 83 aa  57  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.179973 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5523  addiction module antidote family protein  37.5 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5158  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  57.14 
 
 		 77 aa  55.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.491967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3568  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 77 aa  55.5  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.951393  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2884  transcriptional regulator  32.47 
 
 		 83 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.579696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2127  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  53.49 
 
 		 78 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.114302  normal  0.153 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2745  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  37.18 
 
 		 83 aa  53.9  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.698152 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3206  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  40 
 
 		 86 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0460524 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2652  hypothetical protein  53.49 
 
 		 78 aa  53.5  0.0000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6479  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  35.44 
 
 		 79 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.853863 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2938  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  52.5 
 
 		 76 aa  52.8  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2489  putative transcriptional regulator, CopG/Arc/MetJ family  35.06 
 
 		 83 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.75624  normal  0.124302 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06880  hypothetical protein  29.73 
 
 		 79 aa  47.4  0.00007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.613488  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6369  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  33.78 
 
 		 82 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.547419 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0726  putative transcriptional regulator, CopG/Arc/MetJ family  32 
 
 		 82 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0763324 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6189  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  34.25 
 
 		 82 aa  44.3  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.330303 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3066  hypothetical protein  45.45 
 
 		 88 aa  43.9  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2661  hypothetical protein  37.93 
 
 		 85 aa  43.9  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0005  CC2985 family addiction module antidote protein  28.99 
 
 		 80 aa  43.9  0.0008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.182538 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0986  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  30.56 
 
 		 83 aa  43.5  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2586  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  29.41 
 
 		 80 aa  43.5  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0288657  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00623  predicted transcriptional regulator  26.47 
 
 		 80 aa  43.5  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.685731  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0025  transcriptional regulator  33.93 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.591857 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1824  hypothetical protein  43.18 
 
 		 84 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.291634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4672  putative addiction module antidote protein, CC2985 family  33.33 
 
 		 87 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3216  CC2985 family addiction module antidote protein  33.33 
 
 		 87 aa  41.6  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0710  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 89 aa  41.6  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0441596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3498  hypothetical protein  43.18 
 
 		 84 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.402745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4209  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  32.76 
 
 		 86 aa  40.8  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3810  hypothetical protein  40.91 
 
 		 84 aa  40.8  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4524  addiction module antidote family protein  48.65 
 
 		 90 aa  40.4  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.529015  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60040  hypothetical protein  48.65 
 
 		 90 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000786845  hitchhiker  0.00000000572352 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3830  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 81 aa  40.4  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.582275 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2396  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 81 aa  40.4  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.379983 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>