12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3066 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3066  hypothetical protein  100 
 
 		 88 aa  175  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1824  hypothetical protein  90.36 
 
 		 84 aa  155  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.291634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3498  hypothetical protein  87.95 
 
 		 84 aa  150  5e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.402745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3810  hypothetical protein  85.54 
 
 		 84 aa  149  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2661  hypothetical protein  74.7 
 
 		 85 aa  125  1.0000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1046  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 80 aa  43.9  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1511  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  48.84 
 
 		 81 aa  43.5  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.416754 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2088  transcriptional regulator  33.8 
 
 		 85 aa  43.5  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0268696  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3093  helix-turn-helix protein, CopG  45.45 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4222  hypothetical protein  39.34 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.138741 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5432  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  41.46 
 
 		 89 aa  40.8  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1735  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  39.58 
 
 		 82 aa  40.4  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>