25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1012 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1012  CopG family transcriptional regulator  100 
 
 		 122 aa  247  4e-65  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.632842 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2084  CopG family transcriptional regulator  63.11 
 
 		 122 aa  176  9e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.140571 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1284  CopG family transcriptional regulator  64.75 
 
 		 122 aa  175  2e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1834  CopG family transcriptional regulator  63.11 
 
 		 122 aa  174  5e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000112819 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0124  CopG family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 130 aa  62  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.647828  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1643  CopG family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000269216 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0606  putative transcriptional regulator, CopG family  27.43 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3947  nickel responsive regulator  27.43 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1656  CopG family transcriptional regulator  22.95 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0772  nickel responsive regulator  25.66 
 
 		 139 aa  46.2  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2980  nickel responsive regulator  25.66 
 
 		 139 aa  45.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2239  CopG family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 140 aa  45.1  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.849236  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0842  CopG family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 151 aa  44.7  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.514267  normal  0.251181 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3562  nickel responsive regulator  28.45 
 
 		 139 aa  44.3  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2090  nickel responsive regulator  24.78 
 
 		 139 aa  44.3  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000414666  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1768  putative transcriptional regulator, CopG family  23.68 
 
 		 135 aa  44.3  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.123509  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0162  CopG family transcriptional regulator  23.01 
 
 		 139 aa  43.9  0.0007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00610  predicted transcriptional regulator with CopG/Arc/MetJ DNA-binding domain protein and metal-binding domain protein  27.69 
 
 		 140 aa  43.9  0.0007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0616517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0494  nickel responsive regulator  25.66 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0193  nickel responsive regulator  25.44 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0129549  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3628  nickel responsive regulator  27.59 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1718  transcriptional regulator NikR, CopG family  22.32 
 
 		 133 aa  41.2  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2003  putative transcriptional regulator, CopG family  26.96 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000417208  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0662  nickel responsive regulator  24.32 
 
 		 140 aa  40.8  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0229415  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0488  CopG family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 134 aa  40.4  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.632627  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>