25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1834 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_1834  CopG family transcriptional regulator  100 
 
 		 122 aa  249  9.000000000000001e-66  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000112819 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1284  CopG family transcriptional regulator  82.79 
 
 		 122 aa  218  1.9999999999999999e-56  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2084  CopG family transcriptional regulator  60.66 
 
 		 122 aa  176  1e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.140571 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1012  CopG family transcriptional regulator  63.11 
 
 		 122 aa  174  5e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.632842 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0124  CopG family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.647828  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1664  nickel responsive regulator  28.79 
 
 		 141 aa  51.2  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0929  nickel responsive regulator  28.79 
 
 		 141 aa  50.8  0.000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1017  nickel responsive regulator  28.79 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0842  CopG family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 151 aa  47.8  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.514267  normal  0.251181 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1643  CopG family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 140 aa  47.8  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000269216 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1201  nickel responsive regulator  28.03 
 
 		 141 aa  47.4  0.00006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2003  putative transcriptional regulator, CopG family  30.43 
 
 		 134 aa  47.4  0.00006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000417208  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0606  putative transcriptional regulator, CopG family  30.36 
 
 		 140 aa  47  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0355  nickel responsive regulator  26.77 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000375481  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1897  nickel responsive regulator  27.03 
 
 		 137 aa  45.1  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1182  nickel responsive regulator  26.52 
 
 		 141 aa  44.7  0.0005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0162  CopG family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 139 aa  44.3  0.0006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1397  putative transcriptional regulator, CopG family  25.93 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.640554  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1768  putative transcriptional regulator, CopG family  24.79 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.123509  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0488  CopG family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.632627  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0870  nickel-responsive regulator  24.81 
 
 		 138 aa  41.6  0.004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0193  nickel responsive regulator  24.78 
 
 		 143 aa  41.2  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0129549  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0164  transcriptional regulator NikR, CopG family  26.55 
 
 		 172 aa  41.2  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.200645  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1100  NikR nickel binding protein  24.35 
 
 		 137 aa  40.4  0.007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0934  nickel responsive regulator  25.64 
 
 		 140 aa  40.4  0.009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>