139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0329 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0329  phosphodiesterase, MJ0936 family  100 
 
 
172 aa  347  3e-95  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0779553  normal  0.0229363 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1793  phosphodiesterase, MJ0936 family  49.7 
 
 
172 aa  167  8e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.696685  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0338  phosphodiesterase, MJ0936 family  48.82 
 
 
175 aa  161  3e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0825  phosphodiesterase, MJ0936 family  45.24 
 
 
167 aa  139  2e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1836  phosphodiesterase, MJ0936 family  43.27 
 
 
170 aa  133  1e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2035  hypothetical protein  34.76 
 
 
186 aa  95.1  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.14713  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2058  phosphodiesterase, MJ0936 family  42.34 
 
 
168 aa  90.9  8e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.52538e-11 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2834  phosphodiesterase, MJ0936 family  41.3 
 
 
179 aa  82.4  3e-15  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  2.07557e-06  normal  0.0308654 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1346  phosphodiesterase, MJ0936 family  42.86 
 
 
167 aa  80.5  1e-14  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00939202  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02370  phosphoesterase, MJ0936 family  40.14 
 
 
178 aa  79.3  2e-14  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.569795  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0186  phosphodiesterase  31.25 
 
 
179 aa  79.3  2e-14  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1198  phosphodiesterase  38.64 
 
 
182 aa  79  3e-14  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.244677  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5609  phosphodiesterase  39.39 
 
 
168 aa  78.6  4e-14  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749126  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7192  phosphodiesterase, MJ0936 family  37.23 
 
 
167 aa  76.6  2e-13  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5066  phosphodiesterase  36.54 
 
 
172 aa  76.6  2e-13  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5359  phosphodiesterase  39.39 
 
 
172 aa  76.3  2e-13  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4978  hypothetical protein  36.54 
 
 
172 aa  76.6  2e-13  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.703942  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3196  phosphodiesterase, MJ0936 family  38.85 
 
 
164 aa  75.9  3e-13  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.352937  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1850  phosphodiesterase, MJ0936 family  37.65 
 
 
164 aa  75.1  4e-13  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.447532 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1503  phosphoesterase  33.14 
 
 
168 aa  74.7  5e-13  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.8023e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6302  phosphodiesterase  34.76 
 
 
177 aa  74.7  7e-13  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.317374  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1360  hypothetical protein  31.91 
 
 
176 aa  73.9  9e-13  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.021826  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2125  phosphodiesterase  32.41 
 
 
158 aa  69.7  2e-11  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000700609 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1514  phosphodiesterase, MJ0936 family  39.1 
 
 
210 aa  68.2  6e-11  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.163158 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0028  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.93 
 
 
182 aa  65.1  4e-10  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.54449  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03300  phosphoesterase protein  33.59 
 
 
151 aa  64.7  6e-10  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.620314  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0370  phosphodiesterase  34.57 
 
 
164 aa  64.3  7e-10  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  1.32589e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0076  phosphodiesterase  31.43 
 
 
163 aa  62.8  2e-09  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3191  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.21 
 
 
161 aa  62.4  3e-09  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1380  phosphodiesterase  26.81 
 
 
171 aa  62.4  3e-09  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2682  phosphodiesterase  32.45 
 
 
162 aa  62  4e-09  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0319017  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0745  phosphodiesterase  30 
 
 
163 aa  61.6  5e-09  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.751272  normal  0.75862 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0811  phosphodiesterase  30.08 
 
 
155 aa  61.2  6e-09  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0289  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.07 
 
 
170 aa  60.8  8e-09  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08250  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.21 
 
 
186 aa  60.1  2e-08  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0345  phosphodiesterase, MJ0936 family  38.35 
 
 
162 aa  59.3  3e-08  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.24583 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1173  phosphodiesterase  30 
 
 
163 aa  58.9  3e-08  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.111939  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2317  phosphodiesterase  35.29 
 
 
174 aa  58.9  3e-08  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179128  normal  0.0832015 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0456  phosphodiesterase  30.28 
 
 
181 aa  58.5  4e-08  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1628  phosphodiesterase  30.95 
 
 
190 aa  58.2  5e-08  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1441  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.21 
 
 
150 aa  58.5  5e-08  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0531917  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1477  phosphodiesterase  35.25 
 
 
148 aa  58.5  5e-08  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0059  hypothetical protein  34.25 
 
 
160 aa  58.5  5e-08  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03780  phosphoesterase, MJ0936 family  34.85 
 
 
157 aa  58.5  5e-08  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00356209  normal  0.195847 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2607  phosphodiesterase  32.24 
 
 
168 aa  58.2  5e-08  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  1.99018e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0641  phosphodiesterase  27.81 
 
 
185 aa  58.2  6e-08  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.558734  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4206  phosphodiesterase  31.3 
 
 
152 aa  57.8  7e-08  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1322  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.82 
 
 
167 aa  57  1e-07  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.473634  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2598  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.06 
 
 
169 aa  57.4  1e-07  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1949  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.57 
 
 
178 aa  57.4  1e-07  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0118303  normal  0.874816 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2580  phosphodiesterase  30.07 
 
 
161 aa  56.2  2e-07  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1529  hypothetical protein  33.59 
 
 
154 aa  56.2  2e-07  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.145823  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3064  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.81 
 
 
196 aa  56.6  2e-07  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109166  normal  0.620123 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13528  hypothetical protein  36.23 
 
 
163 aa  55.8  3e-07  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0455  hypothetical protein  29.41 
 
 
157 aa  55.8  3e-07  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0517  phosphodiesterase  25.49 
 
 
171 aa  55.5  4e-07  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.745546  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1357  hypothetical protein  31.82 
 
 
173 aa  55.1  5e-07  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2238  Ser/Thr protein phosphatase family protein  30 
 
 
156 aa  55.1  5e-07  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  7.39352e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1322  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.63 
 
 
165 aa  54.3  9e-07  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0695947  normal  0.0513289 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1550  phosphodiesterase  28.79 
 
 
180 aa  53.9  1e-06  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2013  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.82 
 
 
163 aa  53.5  1e-06  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.995963  normal  0.0956817 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1401  hypothetical protein  32.14 
 
 
167 aa  53.5  1e-06  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2626  phosphodiesterase, MJ0936 family  30 
 
 
162 aa  53.1  2e-06  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.655099 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0437  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.19 
 
 
167 aa  53.1  2e-06  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0543  phosphodiesterase  30.43 
 
 
172 aa  53.5  2e-06  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.10472  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1245  phosphodiesterase  24.84 
 
 
171 aa  53.1  2e-06  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0636  putative phosphoesterase  30.54 
 
 
167 aa  53.1  2e-06  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  6.10703e-10  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1391  phosphodiesterase  24.84 
 
 
171 aa  53.1  2e-06  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2498  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.41 
 
 
157 aa  53.1  2e-06  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0714523  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0810  phosphodiesterase  26.95 
 
 
164 aa  52.8  3e-06  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0304  hypothetical protein  30.72 
 
 
173 aa  52.4  3e-06  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.251513  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0395  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.24 
 
 
176 aa  52.4  3e-06  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3036  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.55 
 
 
164 aa  52.4  3e-06  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0852  phosphodiesterase, MJ0936 family  36.88 
 
 
163 aa  52  4e-06  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1510  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.09 
 
 
159 aa  52  4e-06  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0679  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.99 
 
 
162 aa  52  4e-06  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.488967 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0694  phosphodiesterase  26.09 
 
 
158 aa  51.6  6e-06  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0718  phosphodiesterase  26.09 
 
 
158 aa  51.6  6e-06  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.205538  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1492  phosphodiesterase  29.61 
 
 
160 aa  51.6  6e-06  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953223  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4232  phosphoesterase  29.94 
 
 
167 aa  50.8  8e-06  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  1.22501e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4584  phosphoesterase, putative  30.54 
 
 
167 aa  50.8  8e-06  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  5.07537e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4599  putative phosphoesterase  29.94 
 
 
167 aa  51.2  8e-06  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  1.19915e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4619  putative phosphoesterase  30.54 
 
 
167 aa  50.8  8e-06  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  2.89782e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04590  hypothetical protein  29.77 
 
 
157 aa  50.8  9e-06  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4323  phosphodiesterase  29.17 
 
 
167 aa  50.8  9e-06  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000918011  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2534  Ser/Thr protein phosphatase family protein  28.67 
 
 
156 aa  50.4  1e-05  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  5.90014e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1164  putative phosphodiesterase (yfcE)  30.14 
 
 
154 aa  50.8  1e-05  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0444  hypothetical protein  29.77 
 
 
157 aa  50.8  1e-05  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4569  putative phosphoesterase  29.94 
 
 
167 aa  50.1  2e-05  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4713  phosphoesterase  29.94 
 
 
167 aa  50.1  2e-05  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  2.14333e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4375  phosphoesterase  29.94 
 
 
167 aa  50.1  2e-05  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  5.41697e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4216  phosphoesterase  29.94 
 
 
167 aa  50.1  2e-05  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.40819e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0138  hypothetical protein  23.87 
 
 
166 aa  49.7  2e-05  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03090  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.82 
 
 
160 aa  49.7  2e-05  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1397  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.35 
 
 
166 aa  49.3  3e-05  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1598  hypothetical protein  30.22 
 
 
173 aa  48.5  4e-05  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2552  phosphodiesterase  29.94 
 
 
156 aa  48.5  4e-05  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0760667  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1506  hypothetical protein  33.58 
 
 
173 aa  47.8  7e-05  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2256  phosphodiesterase  24.81 
 
 
153 aa  47.8  8e-05  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2257  phosphodiesterase  26.39 
 
 
184 aa  47  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>