211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1121 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A0415  glycoside hydrolase 15-like protein  53.39 
 
 
624 aa  651    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3132  glycoside hydrolase 15-related  59.66 
 
 
598 aa  741    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1816  glycoside hydrolase 15-related  60.07 
 
 
596 aa  737    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0235  glycoside hydrolase 15-related  57.07 
 
 
599 aa  698    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.794837  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1528  glycoside hydrolase 15-related  53.11 
 
 
593 aa  642    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0006  glycoside hydrolase 15-related  75.89 
 
 
595 aa  927    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.780753 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0525  glycoside hydrolase 15-related  52.37 
 
 
606 aa  635    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.262384 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1121  glycoside hydrolase 15-related  100 
 
 
595 aa  1221    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0307  glycoside hydrolase 15-related  54.08 
 
 
603 aa  653    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0356  glycoside hydrolase 15-related  52.71 
 
 
620 aa  634  1e-180  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3154  glycoside hydrolase 15-related  55.93 
 
 
593 aa  631  1e-179  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0986  glycoside hydrolase 15-related  51.95 
 
 
640 aa  628  1e-178  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04868  glycosyl hydrolase, family 15  55.14 
 
 
592 aa  624  1e-177  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3916  glycoside hydrolase 15-related  51.24 
 
 
618 aa  616  1e-175  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.267662 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3791  hypothetical protein  52.28 
 
 
598 aa  617  1e-175  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000380463 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4211  glycoside hydrolase 15-related protein  51.1 
 
 
657 aa  610  1e-173  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.775495  normal  0.475845 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1018  glycoside hydrolase 15-related  50.51 
 
 
589 aa  605  9.999999999999999e-173  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0623694  normal  0.517609 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3609  glycoside hydrolase 15-related  52.2 
 
 
598 aa  606  9.999999999999999e-173  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.359556 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0518  glycoside hydrolase 15-related  50.34 
 
 
606 aa  603  1.0000000000000001e-171  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3025  glycoside hydrolase 15-related  52.96 
 
 
597 aa  598  1e-170  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0502  glycoside hydrolase 15-related  50.17 
 
 
606 aa  600  1e-170  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.830994  normal  0.0194391 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3614  glycoside hydrolase 15-related  52.62 
 
 
597 aa  595  1e-168  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.633662  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1778  glycoside hydrolase 15-related  50.08 
 
 
598 aa  589  1e-167  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.743693  normal  0.0628922 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1504  glycoside hydrolase 15-related  48.31 
 
 
594 aa  560  1e-158  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4023  glycoside hydrolase 15-related  40.03 
 
 
593 aa  436  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000792533  normal  0.121588 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0399  glucoamylase-related protein, trehalase  39.46 
 
 
593 aa  419  1e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.216447  normal  0.225256 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2230  glycoside hydrolase 15-related  37.71 
 
 
594 aa  415  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.904069 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5958  glycoside hydrolase 15-related protein  37.09 
 
 
586 aa  317  5e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.0449084 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1406  glycoside hydrolase 15-related protein  35.6 
 
 
601 aa  307  3e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.334429 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0096  glycoside hydrolase 15-related  34.72 
 
 
600 aa  305  2.0000000000000002e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.258248  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1340  glycoside hydrolase 15-related  34.75 
 
 
623 aa  302  1e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0183  glycoside hydrolase 15-related protein  34.93 
 
 
605 aa  301  2e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2362  glycoside hydrolase 15-related  35.67 
 
 
611 aa  300  4e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.897643  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1345  hypothetical protein  33.72 
 
 
598 aa  299  9e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1405  glycoside hydrolase 15-related  33.82 
 
 
623 aa  298  2e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.059685 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2242  glycoside hydrolase 15-related  35.67 
 
 
609 aa  298  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.55211 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3442  glycoside hydrolase 15-related protein  34.5 
 
 
597 aa  297  5e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3391  glycoside hydrolase 15-related  35.25 
 
 
617 aa  296  8e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5665  glycoside hydrolase 15-like protein  35.17 
 
 
609 aa  295  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3193  glycoside hydrolase 15-related  36.42 
 
 
621 aa  296  1e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0954  glycoside hydrolase 15-related  35.38 
 
 
609 aa  295  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1458  hypothetical protein  33.5 
 
 
619 aa  295  2e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.412179 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2346  glycoside hydrolase 15-related  35.17 
 
 
609 aa  295  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171606  normal  0.0180735 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3220  glycoside hydrolase 15-related  33.33 
 
 
602 aa  295  2e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2323  glycoside hydrolase 15-related  35.17 
 
 
609 aa  295  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3314  glycoside hydrolase 15-related  35.78 
 
 
617 aa  295  2e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2133  glycoside hydrolase 15-related protein  33.77 
 
 
602 aa  294  3e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136877  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0982  glycoside hydrolase 15-related protein  34.72 
 
 
611 aa  293  5e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1711  glycoside hydrolase 15-related  35 
 
 
609 aa  292  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.45918  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2741  glycoside hydrolase 15-related protein  32.28 
 
 
625 aa  291  2e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2497  glycoside hydrolase 15-related  34.27 
 
 
596 aa  288  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0866572  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02887  glycosyl hydrolase, family 15  34.67 
 
 
599 aa  288  2e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1617  glycoside hydrolase  31.86 
 
 
612 aa  288  2.9999999999999996e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1927  glycosy hydrolase family protein  34.92 
 
 
610 aa  287  4e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.16927  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1340  glycoside hydrolase family protein  34.92 
 
 
610 aa  287  4e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1028  glycosy hydrolase family protein  34.92 
 
 
610 aa  287  4e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111338  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0838  glycosy hydrolase family protein  34.92 
 
 
610 aa  287  4e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1181  glycosy hydrolase family protein  34.92 
 
 
610 aa  287  4e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1189  glycosy hydrolase family protein  34.92 
 
 
610 aa  287  4e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.9496  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0311  glycosy hydrolase family protein  34.92 
 
 
610 aa  287  4e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0900  glycoside hydrolase 15-related  34.26 
 
 
613 aa  286  5e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2309  glycoside hydrolase 15-like protein  32.72 
 
 
627 aa  286  7e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.451271  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3307  hypothetical protein  35.16 
 
 
626 aa  286  9e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0974  glycosy hydrolase family protein  34.92 
 
 
665 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4035  glycoside hydrolase 15-related  34.06 
 
 
611 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2309  glycoside hydrolase 15-related  35.04 
 
 
617 aa  285  2.0000000000000002e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.557542 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4175  glycoside hydrolase 15-related  32.55 
 
 
593 aa  285  2.0000000000000002e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0491982  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4178  glycoside hydrolase 15-related  33.94 
 
 
602 aa  283  5.000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1238  glycoside hydrolase 15-like protein  34.88 
 
 
616 aa  283  6.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428683  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1955  glycoside hydrolase 15-related protein  35.13 
 
 
598 aa  283  8.000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.172599 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0740  glycoside hydrolase 15-related  34.67 
 
 
594 aa  281  2e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000780754 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3331  glycoside hydrolase 15-related  35.88 
 
 
601 aa  280  6e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.487654 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3972  glycoside hydrolase 15-related  34.51 
 
 
594 aa  280  7e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.855212  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2873  glycoside hydrolase 15-related  33.88 
 
 
608 aa  279  9e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.637072  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2637  glycoside hydrolase 15-related  32.89 
 
 
612 aa  279  1e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.872982  normal  0.317086 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3739  glycoside hydrolase 15-related  33.88 
 
 
613 aa  278  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.788382  normal  0.163243 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2505  glycoside hydrolase 15-related  34.22 
 
 
602 aa  278  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368575  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1239  glycoside hydrolase 15-related  34.33 
 
 
626 aa  278  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2418  glycoside hydrolase 15-related  34.22 
 
 
602 aa  277  3e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3320  glycoside hydrolase 15-related  34.77 
 
 
610 aa  277  3e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.147589 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1262  glycoside hydrolase 15-related  32.06 
 
 
599 aa  276  6e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.212074  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2221  glycoside hydrolase 15-related  33.87 
 
 
629 aa  276  8e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.47464  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2156  glycoside hydrolase 15-related  33.82 
 
 
624 aa  275  1.0000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.168386  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5016  glycoside hydrolase 15-related  33.72 
 
 
620 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346719  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1143  glycoside hydrolase 15-related  32.57 
 
 
627 aa  276  1.0000000000000001e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0212491 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4963  glycoside hydrolase 15-related  33.44 
 
 
619 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0703179  normal  0.140371 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1442  glycoside hydrolase 15-related  33.44 
 
 
600 aa  275  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.833593  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6570  glycoside hydrolase 15-related  34.22 
 
 
592 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0304  glycoside hydrolase 15-related protein  34.31 
 
 
636 aa  275  2.0000000000000002e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4500  glycoside hydrolase 15-related  33.28 
 
 
619 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1271  glycoside hydrolase 15-related protein  34.28 
 
 
594 aa  275  2.0000000000000002e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3218  glycoside hydrolase 15-related protein  34.32 
 
 
629 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6284  glycoside hydrolase 15-related  34.39 
 
 
592 aa  274  3e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00160036 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0662  glycoside hydrolase 15-related  32.45 
 
 
599 aa  275  3e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.98691  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0874  glycoside hydrolase 15-related protein  34.82 
 
 
645 aa  274  4.0000000000000004e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.219987  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2304  glycoside hydrolase 15-related  33.77 
 
 
629 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.275031 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1889  glycoside hydrolase 15-related  34.15 
 
 
628 aa  273  6e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.510271 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4840  glycoside hydrolase 15-related  32.46 
 
 
635 aa  273  6e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0898211  normal  0.818713 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1839  glycoside hydrolase 15-like protein  32.66 
 
 
609 aa  272  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1886  glycoside hydrolase 15-like protein  32.18 
 
 
601 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.177282  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>