More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0075 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_0075  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 
218 aa  434  1e-121  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  66.51 
 
 
218 aa  298  4e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0623  ArsR family transcriptional regulator  61.32 
 
 
223 aa  261  4e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128738 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  59.43 
 
 
221 aa  255  4e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1102  ArsR family transcriptional regulator  51.42 
 
 
228 aa  229  3e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.780057  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2862  ArsR family transcriptional regulator  52.51 
 
 
224 aa  223  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0382  ArsR family transcriptional regulator  52.51 
 
 
224 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1758  ArsR family transcriptional regulator  52.51 
 
 
224 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.99053  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1571  ArsR family transcriptional regulator  52.51 
 
 
224 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.543844  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2905  ArsR family transcriptional regulator  51.14 
 
 
224 aa  222  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562518  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0425  ArsR family transcriptional regulator  53.27 
 
 
230 aa  222  4e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1222  ArsR family transcriptional regulator  52.05 
 
 
224 aa  221  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4453  ArsR family transcriptional regulator  49.3 
 
 
233 aa  220  9.999999999999999e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2736  ArsR family transcriptional regulator  49.53 
 
 
227 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635873  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1961  transcriptional regulator, ArsR family  51.42 
 
 
222 aa  219  3e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172252  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1278  ArsR family transcriptional regulator  50.93 
 
 
231 aa  215  2.9999999999999998e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.180316 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  48.39 
 
 
222 aa  215  5e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3257  rhodanese domain-containing protein  51.4 
 
 
221 aa  212  3.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0639581  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3128  ArsR family transcriptional regulator  48.58 
 
 
223 aa  211  5.999999999999999e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141213  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  47.3 
 
 
226 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11691  transcriptional regulator  49.76 
 
 
218 aa  209  3e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.393301 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3468  rhodanese domain-containing protein  51.87 
 
 
221 aa  207  8e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.572814  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3240  regulatory protein, ArsR  50 
 
 
221 aa  204  6e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.135637  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1715  transcriptional regulator, ArsR family  50.47 
 
 
221 aa  204  8e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0183  transcriptional regulator, ArsR family  47.87 
 
 
227 aa  202  5e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4328  ArsR family transcriptional regulator  46.7 
 
 
235 aa  198  5e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0812017  normal  0.0670515 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4097  ArsR family transcriptional regulator  46.7 
 
 
235 aa  198  5e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.896356  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4173  ArsR family transcriptional regulator  46.7 
 
 
235 aa  198  5e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801909  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3468  transcriptional activator domain-containing protein  48.82 
 
 
223 aa  191  1e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3283  ArsR family transcriptional regulator  44.08 
 
 
226 aa  185  4e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3937  ArsR family transcriptional regulator  44.34 
 
 
219 aa  175  4e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.364905 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2180  ArsR family transcriptional regulator  40.2 
 
 
218 aa  175  6e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1363  ArsR family transcriptional regulator  43.27 
 
 
227 aa  174  6e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0092  rhodanese-like protein  44.07 
 
 
184 aa  174  9.999999999999999e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000022207  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0462  ArsR family transcriptional regulator  44.5 
 
 
253 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10329  ArsR family transcriptional regulator  44.34 
 
 
226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2739  ArsR family transcriptional regulator  42.4 
 
 
220 aa  171  5.999999999999999e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0533498  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0756  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 
222 aa  170  2e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.213263  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3427  ArsR family transcriptional regulator  40.38 
 
 
234 aa  167  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.299912  normal  0.0245638 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2204  transcriptional regulator, ArsR family  41.28 
 
 
221 aa  165  5e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.345359  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2126  ArsR family transcriptional regulator  42.92 
 
 
221 aa  165  5e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.436052  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2101  ArsR family transcriptional regulator  40.32 
 
 
189 aa  159  3e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0912  transcription regulator ArsR  36.68 
 
 
219 aa  151  8e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1172  transcriptional regulator, ArsR family  40.28 
 
 
232 aa  145  4.0000000000000006e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2179  ArsR family transcriptional regulator  55.77 
 
 
124 aa  121  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2038  rhodanese domain-containing protein  55.77 
 
 
124 aa  121  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0356  rhodanese domain-containing protein  46.43 
 
 
114 aa  109  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0237  Rhodanese domain protein  38.33 
 
 
128 aa  86.7  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3032  Rhodanese domain protein  35.94 
 
 
136 aa  75.5  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00401141  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  37.89 
 
 
189 aa  70.1  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2147  Rhodanese domain protein  39.53 
 
 
138 aa  70.5  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  39.22 
 
 
133 aa  68.6  0.00000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  35.85 
 
 
123 aa  68.6  0.00000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  41.94 
 
 
145 aa  68.2  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1508  Rhodanese domain protein  52.73 
 
 
207 aa  67.4  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2883  rhodanese domain-containing protein  37.89 
 
 
172 aa  67.4  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.8077  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  34.07 
 
 
247 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1523  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.48 
 
 
550 aa  66.6  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.861068  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  38.95 
 
 
189 aa  67  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6932  beta-lactamase domain protein  40.74 
 
 
470 aa  67.4  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3285  Rhodanese domain protein  29.55 
 
 
136 aa  67.4  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.654327  normal  0.0818449 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0334  rhodanese-like protein  29.29 
 
 
137 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206424  normal  0.623131 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1703  Rhodanese domain protein  40 
 
 
167 aa  66.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000369251 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1543  transcription regulator protein  45.88 
 
 
121 aa  65.9  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0436972 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  31.47 
 
 
471 aa  65.9  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0714  putative transmembrane protein  35.96 
 
 
138 aa  65.1  0.0000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.274241  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  39.18 
 
 
120 aa  65.1  0.0000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2184  phage shock protein E  34.68 
 
 
129 aa  65.1  0.0000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0017776  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1130  rhodanese-related sulfurtransferase  34.62 
 
 
146 aa  65.1  0.0000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  38.04 
 
 
269 aa  64.7  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1410  transcriptional regulator, ArsR family  43.75 
 
 
107 aa  64.7  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0060  transcription regulator ArsR  45 
 
 
227 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2435  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 
107 aa  64.7  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.285599  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1000  putative sulfurtransferase  34.62 
 
 
124 aa  64.7  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.308152  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5106  rhodanese domain-containing protein  29.29 
 
 
137 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4736  rhodanese domain-containing protein  37.93 
 
 
144 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.705468  normal  0.163303 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4381  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
110 aa  63.2  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.606402  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2523  rhodanese-related sulfurtransferase  36.73 
 
 
170 aa  63.2  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000271872  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5055  rhodanese domain-containing protein  27.27 
 
 
137 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162705  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2014  transcriptional regulator, ArsR family  46.91 
 
 
121 aa  62.8  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.413816  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0131  Rhodanese domain protein  38.1 
 
 
116 aa  62.8  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.189011  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5266  transcriptional regulator, ArsR family  36.59 
 
 
368 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2983  transcriptional regulator, ArsR family  38.61 
 
 
125 aa  62.8  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000400163  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4928  rhodanese domain-containing protein  27.27 
 
 
137 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.84511  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1706  transcriptional regulator, ArsR family  46.91 
 
 
121 aa  62.4  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.09956  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3521  ArsR family transcriptional regulator  36.59 
 
 
368 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4153  transcriptional regulator, ArsR family  47.37 
 
 
119 aa  62.4  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161785  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0410  rhodanese domain-containing protein  27.27 
 
 
137 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.692094 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1792  rhodanese-like protein  33.94 
 
 
177 aa  62  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2261  rhodanese domain-containing protein  28.3 
 
 
279 aa  62  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0533  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45.61 
 
 
568 aa  62  0.000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.913571  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0022  Rhodanese domain-containing protein  33.98 
 
 
122 aa  61.6  0.000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  42.62 
 
 
136 aa  61.6  0.000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4967  transcriptional regulator, ArsR family  48.65 
 
 
124 aa  61.6  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  37.29 
 
 
317 aa  61.6  0.000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3119  beta-lactamase domain protein  30.39 
 
 
463 aa  61.6  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0418  Rhodanese domain protein  35.29 
 
 
112 aa  61.6  0.000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  31.78 
 
 
121 aa  60.8  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1861  Rhodanese domain protein  25 
 
 
454 aa  61.2  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0008  rhodanese-like protein  35.35 
 
 
380 aa  61.2  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.612514 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>