More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1704 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2067  recombination factor protein RarA  82.3 
 
 		 440 aa  746    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792002  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2447  recombination factor protein RarA  79.05 
 
 		 434 aa  695    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  82.83 
 
 		 441 aa  743    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1770  recombination factor protein RarA  78.57 
 
 		 434 aa  689    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220644 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  74.76 
 
 		 435 aa  657    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2242  recombination factor protein RarA  73.21 
 
 		 448 aa  654    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00131552  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1704  recombination factor protein RarA  100 
 
 		 435 aa  886    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  62.06 
 
 		 432 aa  559  1e-158  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1284  recombination factor protein RarA  57.51 
 
 		 443 aa  502  1e-141  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2614  recombination factor protein RarA  55.48 
 
 		 447 aa  491  9.999999999999999e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2133  recombination factor protein RarA  56.75 
 
 		 459 aa  490  1e-137  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1785  recombination factor protein RarA  52.5 
 
 		 447 aa  484  1e-135  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.295244  hitchhiker  0.00333986 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0976  AAA ATPase central domain protein  55.34 
 
 		 423 aa  475  1e-133  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12030  recombination factor protein RarA  52.51 
 
 		 450 aa  469  1.0000000000000001e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3121  recombination factor protein RarA  52.51 
 
 		 485 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3401  AAA ATPase central domain protein  52.7 
 
 		 463 aa  466  9.999999999999999e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1192  recombination factor protein RarA  54.89 
 
 		 445 aa  467  9.999999999999999e-131  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.211083  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0767  recombination factor protein RarA  58.35 
 
 		 437 aa  462  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.764171  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0767  recombination factor protein RarA  58.35 
 
 		 437 aa  462  1e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0323  AAA ATPase central domain protein  54.86 
 
 		 458 aa  464  1e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0617  recombination factor protein RarA  54.91 
 
 		 432 aa  462  1e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907625  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0730  recombination factor protein RarA  59.04 
 
 		 437 aa  462  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.44453  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0855  recombination factor protein RarA  52.3 
 
 		 451 aa  464  1e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1091  ATPase, AAA family  53.5 
 
 		 457 aa  464  1e-129  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1119  recombination factor protein RarA  53.27 
 
 		 457 aa  459  9.999999999999999e-129  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1656  recombination factor protein RarA  51.82 
 
 		 441 aa  461  9.999999999999999e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000573735  hitchhiker  0.00861976 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3807  recombination factor protein RarA  53.12 
 
 		 505 aa  458  9.999999999999999e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.921575 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2002  recombination factor protein RarA  53.67 
 
 		 447 aa  461  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24410  recombination factor protein RarA  53.54 
 
 		 439 aa  459  9.999999999999999e-129  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1309  recombination factor protein RarA  53.27 
 
 		 457 aa  457  1e-127  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163372  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1695  recombination factor protein RarA  54.07 
 
 		 444 aa  457  1e-127  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.173001 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2041  recombination factor protein RarA  55.47 
 
 		 435 aa  456  1e-127  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0774  recombination factor protein RarA  58.94 
 
 		 444 aa  453  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0591315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0112  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  52.21 
 
 		 739 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1672  recombination factor protein RarA  53.44 
 
 		 447 aa  452  1.0000000000000001e-126  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.339813 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1885  recombination factor protein RarA  53.74 
 
 		 447 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3121  recombination factor protein RarA  54.02 
 
 		 459 aa  454  1.0000000000000001e-126  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0192623  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1103  recombination factor protein RarA  51.86 
 
 		 434 aa  447  1.0000000000000001e-124  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1103  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  51.26 
 
 		 726 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000432194  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0537  AAA ATPase central domain protein  51.04 
 
 		 432 aa  445  1.0000000000000001e-124  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4002  recombination factor protein RarA  53.12 
 
 		 441 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336552 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0626  recombination factor protein RarA  52.72 
 
 		 453 aa  442  1e-123  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432966  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1710  recombination factor protein RarA  52.38 
 
 		 461 aa  442  1e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0515171  normal  0.565725 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0953  recombination factor protein RarA  52.52 
 
 		 446 aa  443  1e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1831  recombination factor protein RarA  52.89 
 
 		 441 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272086  hitchhiker  0.00967825 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0184  AAA ATPase central domain protein  52.22 
 
 		 426 aa  441  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.858304 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3406  recombination factor protein RarA  52.66 
 
 		 441 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.355862 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2458  recombination factor protein RarA  51.56 
 
 		 445 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00926335  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1076  recombination factor protein RarA  50.21 
 
 		 544 aa  440  9.999999999999999e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2743  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  51.56 
 
 		 731 aa  438  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3607  recombination factor protein RarA  52.66 
 
 		 441 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889053 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1440  recombination factor protein RarA  52 
 
 		 426 aa  439  9.999999999999999e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2386  recombination factor protein RarA  51.26 
 
 		 440 aa  435  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010148 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0502  recombination factor protein RarA  50.68 
 
 		 444 aa  437  1e-121  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0383176  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3347  ATPase, AAA family  51.49 
 
 		 440 aa  433  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22534  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1416  recombination factor protein RarA  51.42 
 
 		 447 aa  433  1e-120  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.680205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1040  recombination factor protein RarA  53.54 
 
 		 429 aa  433  1e-120  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.405947  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0027  AAA ATPase central domain protein  54.23 
 
 		 459 aa  433  1e-120  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.797145 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1782  recombination factor protein RarA  53.81 
 
 		 435 aa  430  1e-119  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0410  recombination factor protein RarA  52.03 
 
 		 425 aa  429  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.108672  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3177  recombination factor protein RarA  51.38 
 
 		 440 aa  430  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0569954 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2129  recombination factor protein RarA  50.84 
 
 		 443 aa  429  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000081607  normal  0.0213472 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2022  recombination factor protein RarA  51.08 
 
 		 443 aa  429  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000134258  hitchhiker  0.0000234257 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1061  recombination factor protein RarA  50.34 
 
 		 441 aa  431  1e-119  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.327503  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2481  recombination factor protein RarA  50.6 
 
 		 443 aa  431  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000627884  hitchhiker  0.00000452551 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2595  recombination factor protein RarA  50.81 
 
 		 441 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0016  recombination factor protein RarA  49.77 
 
 		 441 aa  427  1e-118  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.901386  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2590  recombination factor protein RarA  51.43 
 
 		 422 aa  425  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000937072  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28200  recombination factor protein RarA  51.5 
 
 		 441 aa  425  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.866353  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2436  recombination factor protein RarA  51.54 
 
 		 447 aa  425  1e-118  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.203785  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3583  recombination factor protein RarA  50.47 
 
 		 437 aa  426  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000174356  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30320  recombination factor protein RarA  50.58 
 
 		 441 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1936  recombination factor protein RarA  50.47 
 
 		 432 aa  427  1e-118  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.160058  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0997  recombination factor protein RarA  51.31 
 
 		 447 aa  423  1e-117  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0155118  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00896  recombination protein  51.31 
 
 		 447 aa  423  1e-117  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.203608  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2751  AAA ATPase central domain protein  51.31 
 
 		 447 aa  423  1e-117  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000101047  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2009  recombination factor protein RarA  50 
 
 		 443 aa  422  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107159  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2308  recombination factor protein RarA  49.52 
 
 		 445 aa  423  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0732  recombination factor protein RarA  52.02 
 
 		 457 aa  422  1e-117  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2228  recombination factor protein RarA  51.31 
 
 		 447 aa  423  1e-117  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.331515  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00903  hypothetical protein  51.31 
 
 		 447 aa  423  1e-117  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.227866  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0967  recombination factor protein RarA  51.31 
 
 		 447 aa  422  1e-117  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.17279  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1054  recombination factor protein RarA  51.31 
 
 		 447 aa  423  1e-117  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0434989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2405  recombination factor protein RarA  52.18 
 
 		 420 aa  422  1e-117  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2193  recombination factor protein RarA  49.4 
 
 		 443 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000160471  normal  0.268912 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1965  recombination factor protein RarA  48.92 
 
 		 443 aa  422  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00069227  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16380  Recombination protein MgsA  52.47 
 
 		 461 aa  422  1e-117  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.8867  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2213  recombination factor protein RarA  49.16 
 
 		 443 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000293647  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1548  recombination factor protein RarA  51.31 
 
 		 444 aa  424  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.892659  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0967  recombination factor protein RarA  51.07 
 
 		 447 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0751258  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1061  recombination factor protein RarA  51.07 
 
 		 447 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3584  recombination factor protein RarA  51.27 
 
 		 441 aa  421  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.1367  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01799  recombination factor protein RarA  50.83 
 
 		 451 aa  420  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3797  recombination factor protein RarA  51.29 
 
 		 427 aa  418  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1341  recombination factor protein RarA  52.26 
 
 		 440 aa  419  1e-116  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0553369  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1401  recombination factor protein RarA  53.48 
 
 		 451 aa  419  1e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1393  recombination factor protein RarA  50.12 
 
 		 427 aa  419  1e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2052  recombination factor protein RarA  48.92 
 
 		 443 aa  421  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00508723  hitchhiker  0.000142667 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0996  recombination factor protein RarA  51.07 
 
 		 447 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1076  recombination factor protein RarA  51.07 
 
 		 447 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>