More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_5006 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_5006  CheW protein  100 
 
 		 147 aa  284  2.9999999999999996e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1792  CheW protein  58.82 
 
 		 140 aa  154  5.0000000000000005e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.666694 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3603  CheW protein  56.83 
 
 		 139 aa  151  4e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861446  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1525  CheW protein  54.01 
 
 		 152 aa  143  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.361906  normal  0.649363 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4225  CheW protein  47.18 
 
 		 151 aa  134  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.497298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0315  putative CheW protein  59.02 
 
 		 146 aa  130  5e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0805582  normal  0.229425 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2324  CheW protein  55.88 
 
 		 144 aa  129  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2003  CheW protein  51.08 
 
 		 140 aa  122  2e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0578815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30980  CheW protein  46.04 
 
 		 139 aa  120  5e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1907  CheW domain protein  44.27 
 
 		 170 aa  114  6e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.96206  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1818  CheW protein  42.54 
 
 		 166 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2562  CheW protein  42.64 
 
 		 167 aa  105  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.424252  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1873  CheW protein  42.54 
 
 		 166 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.101354  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3677  CheW-like protein  42.54 
 
 		 156 aa  104  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.340799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3919  CheW protein  42.22 
 
 		 167 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0521  CheW-like protein  38.52 
 
 		 156 aa  98.2  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.77009 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  35.42 
 
 		 159 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  35.42 
 
 		 159 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  34.85 
 
 		 167 aa  97.4  5e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  38.21 
 
 		 164 aa  95.1  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3802  CheW protein  38.81 
 
 		 164 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4246  CheW protein  38.81 
 
 		 164 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  35.56 
 
 		 159 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  34.81 
 
 		 159 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  34.81 
 
 		 159 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  34.81 
 
 		 159 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  34.81 
 
 		 159 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  36.55 
 
 		 159 aa  93.6  8e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.35 
 
 		 164 aa  93.2  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  35.71 
 
 		 159 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3375  CheW protein  37.78 
 
 		 156 aa  93.2  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0270944  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  36.3 
 
 		 164 aa  92.4  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  35.61 
 
 		 159 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1692  CheW protein  40.94 
 
 		 169 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.135374  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1135  CheW protein  36.76 
 
 		 145 aa  90.9  5e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  30.88 
 
 		 164 aa  90.5  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  31.51 
 
 		 162 aa  90.9  6e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  28.26 
 
 		 148 aa  90.5  6e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  35.56 
 
 		 163 aa  90.5  7e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0989  CheW protein  35.29 
 
 		 149 aa  90.1  9e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0659  CheW protein  38.89 
 
 		 161 aa  90.1  9e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.575233  normal  0.716686 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  32.35 
 
 		 168 aa  89.7  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  31.82 
 
 		 170 aa  89.4  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  38.64 
 
 		 163 aa  89.4  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1144  CheW-like protein  32.21 
 
 		 184 aa  89  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.990234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  33.33 
 
 		 161 aa  89  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6558  CheW protein  35.14 
 
 		 157 aa  89.4  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.675554 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  32.84 
 
 		 163 aa  89.4  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0525  CheW protein  37.12 
 
 		 157 aa  89  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.936934 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3800  CheW protein  28.67 
 
 		 176 aa  89  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1810  CheW protein  40.94 
 
 		 159 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.000143406  normal  0.276017 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0869  CheW protein  35.56 
 
 		 149 aa  88.6  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1713  CheW protein  40.16 
 
 		 159 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  32.68 
 
 		 163 aa  88.6  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1530  CheW domain-containing protein  40.94 
 
 		 159 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0843757 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4837  CheW protein  40.16 
 
 		 169 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.55891  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  35.37 
 
 		 159 aa  88.2  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  34.81 
 
 		 164 aa  87.8  4e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2991  putative CheW protein  35.71 
 
 		 169 aa  87.8  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.5403  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  34.81 
 
 		 164 aa  87.8  5e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  37.82 
 
 		 165 aa  87  7e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  36.03 
 
 		 162 aa  87  7e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  34.07 
 
 		 161 aa  87  8e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2476  CheW protein  34.01 
 
 		 185 aa  86.7  9e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100144  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  33.82 
 
 		 168 aa  86.7  9e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  36.15 
 
 		 147 aa  86.3  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2314  CheW protein  30.37 
 
 		 165 aa  86.3  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2572  CheW protein  34.53 
 
 		 185 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1142  purine-binding chemotaxis protein CheW  34.29 
 
 		 164 aa  85.5  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0223438  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2421  CheW protein  32.14 
 
 		 178 aa  85.9  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1319  CheW protein  32.62 
 
 		 179 aa  85.9  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.783186  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  31.61 
 
 		 165 aa  85.9  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0334  CheW protein  37.76 
 
 		 169 aa  85.5  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  33.11 
 
 		 161 aa  85.5  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  30 
 
 		 163 aa  85.9  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  31.16 
 
 		 159 aa  85.9  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  34.07 
 
 		 164 aa  85.5  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  31.61 
 
 		 165 aa  85.9  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  34.07 
 
 		 164 aa  85.1  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1106  CheW protein  34.29 
 
 		 164 aa  85.1  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4034  CheW protein  40 
 
 		 172 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.488441  normal  0.598337 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0809  CheW protein  30.15 
 
 		 163 aa  84.7  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  35.29 
 
 		 163 aa  84.7  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  34.07 
 
 		 164 aa  85.1  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  34.07 
 
 		 164 aa  85.1  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  34.07 
 
 		 164 aa  85.1  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  35.94 
 
 		 518 aa  85.1  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  34.07 
 
 		 164 aa  85.1  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  36.3 
 
 		 158 aa  84.7  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  35.29 
 
 		 158 aa  84.7  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  32.84 
 
 		 163 aa  84.7  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  34.07 
 
 		 164 aa  84.7  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  34.07 
 
 		 164 aa  84.3  5e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  34.07 
 
 		 164 aa  84.3  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  34.07 
 
 		 164 aa  84.3  5e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  33.33 
 
 		 164 aa  84.3  5e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  34.07 
 
 		 174 aa  84.3  5e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  34.07 
 
 		 164 aa  84.3  5e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1381  CheW protein  33.81 
 
 		 181 aa  84  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.916051  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  34.07 
 
 		 163 aa  84  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>