More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3747 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3747  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 514 aa  1030    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3993  AMP-dependent synthetase and ligase  59.54 
 
 		 524 aa  602  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.968795  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1515  AMP-dependent synthetase and ligase  57.48 
 
 		 515 aa  580  1e-164  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00288915  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1538  AMP-dependent synthetase and ligase  57.48 
 
 		 515 aa  580  1e-164  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3816  AMP-dependent synthetase and ligase  54.44 
 
 		 518 aa  546  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0163789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3720  AMP-dependent synthetase and ligase  54.25 
 
 		 518 aa  544  1e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.189603  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  54.37 
 
 		 516 aa  541  1e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4080  AMP-dependent synthetase and ligase  53.09 
 
 		 518 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.656205  normal  0.161644 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5827  AMP-dependent synthetase and ligase  50.39 
 
 		 518 aa  517  1.0000000000000001e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.671788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  51.25 
 
 		 520 aa  511  1e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5438  AMP-dependent synthetase and ligase  49.42 
 
 		 515 aa  511  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4758  AMP-dependent synthetase and ligase  50.67 
 
 		 518 aa  504  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4826  AMP-dependent synthetase and ligase  48.46 
 
 		 520 aa  483  1e-135  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0178748  normal  0.551416 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4691  AMP-dependent synthetase and ligase  52.43 
 
 		 502 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1133  AMP-dependent synthetase and ligase  48.16 
 
 		 518 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.508244  normal  0.50206 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1595  AMP-dependent synthetase and ligase  47.4 
 
 		 519 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0661  AMP-binding enzyme family protein  42.34 
 
 		 520 aa  424  1e-117  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5763  AMP-dependent synthetase and ligase  46.38 
 
 		 500 aa  400  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1367  AMP-dependent synthetase and ligase  43.49 
 
 		 502 aa  364  3e-99  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.439129  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0102  AMP-dependent synthetase and ligase  42.2 
 
 		 520 aa  352  8e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1964  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.33 
 
 		 525 aa  347  3e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132088  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1868  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.27 
 
 		 525 aa  344  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.205754 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0115  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.36 
 
 		 556 aa  344  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.36 
 
 		 556 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.356608  normal  0.265858 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0124  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.36 
 
 		 556 aa  344  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.514213  normal  0.109541 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  43.79 
 
 		 511 aa  343  4e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  42.29 
 
 		 525 aa  340  5e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1660  AMP-dependent synthetase and ligase  39.13 
 
 		 523 aa  337  2.9999999999999997e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104845  normal  0.559317 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2924  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.2 
 
 		 526 aa  335  7.999999999999999e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.42655 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3600  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.51 
 
 		 525 aa  334  2e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.887287  normal  0.975846 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3514  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.39 
 
 		 525 aa  334  3e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270509  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5944  AMP-dependent synthetase and ligase  40.94 
 
 		 532 aa  332  1e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420174  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3565  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.61 
 
 		 526 aa  327  3e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011282  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1604  AMP-dependent synthetase and ligase  40.67 
 
 		 540 aa  327  3e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1676  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.66 
 
 		 526 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.591328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  40.28 
 
 		 503 aa  326  7e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  42.33 
 
 		 509 aa  325  8.000000000000001e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141316  normal  0.236103 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0131  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.22 
 
 		 570 aa  325  1e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10167  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.66 
 
 		 554 aa  325  1e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1865  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.06 
 
 		 519 aa  324  2e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.975513  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1211  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.53 
 
 		 527 aa  323  5e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5140  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.48 
 
 		 525 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24744  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0714  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.54 
 
 		 579 aa  320  3e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  40.55 
 
 		 1043 aa  320  3e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4353  AMP-dependent synthetase and ligase  40.57 
 
 		 517 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2323  AMP-dependent synthetase and ligase  36.72 
 
 		 511 aa  317  5e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1605  AMP-dependent synthetase and ligase  37.74 
 
 		 526 aa  316  6e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3975  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.73 
 
 		 530 aa  316  7e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.251646  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4181  AMP-dependent synthetase and ligase  38.49 
 
 		 527 aa  314  1.9999999999999998e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4684  AMP-dependent synthetase and ligase  39.88 
 
 		 526 aa  313  4.999999999999999e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5034  AMP-dependent synthetase and ligase  40.19 
 
 		 517 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5826  AMP-dependent synthetase and ligase  40.19 
 
 		 517 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  39.72 
 
 		 520 aa  313  5.999999999999999e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4616  AMP-dependent synthetase and ligase  40.28 
 
 		 518 aa  311  2e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.892742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3204  O-succinylbenzoate-CoA ligase  42.97 
 
 		 517 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.716175  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3215  O-succinylbenzoate-CoA ligase  42.97 
 
 		 517 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0554015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3266  O-succinylbenzoate-CoA ligase  42.97 
 
 		 517 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.10141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0970  AMP-dependent synthetase and ligase  38.46 
 
 		 520 aa  306  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5271  AMP-dependent synthetase and ligase  39.35 
 
 		 541 aa  304  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.675059 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4595  AMP-dependent synthetase and ligase  35.77 
 
 		 525 aa  301  2e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  36.58 
 
 		 509 aa  300  4e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2032  AMP-dependent synthetase and ligase  38.89 
 
 		 551 aa  297  3e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.367958 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1724  AMP-dependent synthetase and ligase  35.93 
 
 		 515 aa  296  4e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0701995  normal  0.167784 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4202  acyl-CoA synthetase  39.92 
 
 		 534 aa  295  1e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.269622  hitchhiker  0.00584314 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1837  AMP-dependent synthetase and ligase  37.28 
 
 		 518 aa  293  6e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.963932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0752  AMP-binding domain protein  35.18 
 
 		 576 aa  291  1e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1614  AMP-dependent synthetase and ligase  39.76 
 
 		 509 aa  292  1e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4107  AMP-dependent synthetase and ligase  39.55 
 
 		 519 aa  291  2e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.102419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3158  AMP-dependent synthetase and ligase  36.45 
 
 		 515 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1025  AMP-dependent synthetase and ligase  35.27 
 
 		 528 aa  290  3e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6394  AMP-dependent synthetase and ligase  37.48 
 
 		 517 aa  290  3e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178832  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.91 
 
 		 514 aa  291  3e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4472  AMP-dependent synthetase and ligase  37.7 
 
 		 517 aa  290  4e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.52 
 
 		 512 aa  289  8e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0737  AMP-dependent synthetase and ligase  38.03 
 
 		 522 aa  288  1e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188702  normal  0.517642 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0814  AMP-dependent synthetase and ligase  36.8 
 
 		 508 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  36.51 
 
 		 520 aa  288  2e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2246  AMP-dependent synthetase and ligase  34.74 
 
 		 517 aa  288  2e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000334479  hitchhiker  6.92492e-16 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  35.32 
 
 		 521 aa  286  5e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7494  acyl-CoA synthetase  36.18 
 
 		 521 aa  286  5e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.489378  normal  0.204527 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  34.9 
 
 		 525 aa  286  5.999999999999999e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  34.65 
 
 		 559 aa  286  7e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0894  acyl-CoA synthetase  36.11 
 
 		 520 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.493906  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1225  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.96 
 
 		 519 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.399435  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0300  acyl-CoA synthetase  36.31 
 
 		 537 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0309  acyl-CoA synthetase  36.31 
 
 		 537 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0319  acyl-CoA synthetase  36.31 
 
 		 537 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.43856 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2522  AMP-dependent synthetase and ligase  36.25 
 
 		 534 aa  283  4.0000000000000003e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  35.5 
 
 		 512 aa  283  5.000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  34.39 
 
 		 662 aa  282  8.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  34.42 
 
 		 549 aa  282  9e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0843  acyl-CoA synthetase  36.38 
 
 		 513 aa  282  1e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.333452  normal  0.193709 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5309  AMP-dependent synthetase and ligase  37.42 
 
 		 517 aa  282  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1666  AMP-dependent synthetase and ligase  35.26 
 
 		 518 aa  282  1e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144653  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4674  acyl-CoA synthetase  36.47 
 
 		 531 aa  281  2e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3129  AMP-dependent synthetase and ligase  35.59 
 
 		 534 aa  281  2e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4891  AMP-dependent synthetase and ligase  35.77 
 
 		 520 aa  281  2e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.862065  normal  0.74496 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2038  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  35.67 
 
 		 565 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0682  AMP-dependent synthetase and ligase  34.03 
 
 		 530 aa  281  3e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3704  AMP-dependent synthetase and ligase  35.67 
 
 		 515 aa  280  4e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0990866  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>