More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1520 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
634 aa  1259  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.125308  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0334  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.26 
 
 
492 aa  361  2e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.091816  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4312  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 
640 aa  302  2e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0857  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.6 
 
 
698 aa  257  4e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0897898 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0839  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.27 
 
 
1207 aa  230  5e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1934  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.35 
 
 
1015 aa  219  2e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.452261  normal  0.114848 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3503  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 
1043 aa  212  1e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3858  PAS sensor protein  27.77 
 
 
797 aa  211  4e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1227  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.02 
 
 
1229 aa  211  4e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  36.51 
 
 
1629 aa  208  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2420  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.73 
 
 
933 aa  207  6e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42243  hitchhiker  3.59369e-05 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4104  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.22 
 
 
557 aa  205  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0461305 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4311  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.66 
 
 
1291 aa  205  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.02 
 
 
1326 aa  200  6e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.56 
 
 
770 aa  196  1e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2015  putative PAS/PAC sensor protein  31.29 
 
 
1119 aa  195  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  6.73901e-05 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1434  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.83 
 
 
1186 aa  194  5e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1704  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.48 
 
 
1168 aa  194  5e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 
885 aa  193  8e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0212  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.5 
 
 
953 aa  192  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4463  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.87 
 
 
839 aa  193  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3648  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.82 
 
 
1237 aa  188  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.289797  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1031  histidine kinase  42.5 
 
 
617 aa  187  5e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.97 
 
 
612 aa  185  2e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0530317 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 
979 aa  186  2e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.366427 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.3 
 
 
944 aa  184  4e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0007  sensory box histidine kinase  36.89 
 
 
762 aa  184  6e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2947  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.81 
 
 
503 aa  184  6e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 
584 aa  184  6e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.65 
 
 
1060 aa  182  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2941  putative PAS/PAC sensor protein  29.13 
 
 
1169 aa  181  3e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.725686  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3673  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.81 
 
 
638 aa  179  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.230801  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.56 
 
 
584 aa  179  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2295  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 
905 aa  178  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6390  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.13 
 
 
770 aa  178  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.186908 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22580  signal transduction histidine kinase  34.69 
 
 
576 aa  177  5e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.162219  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0414  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  25.62 
 
 
581 aa  177  6e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  30.32 
 
 
1028 aa  176  1e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.101634 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5642  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.6 
 
 
768 aa  176  1e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.203801 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3458  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.81 
 
 
958 aa  176  1e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1628  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 
1026 aa  175  2e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.677715  normal  0.19967 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1688  PAS sensor protein  27.85 
 
 
823 aa  175  3e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4825  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.29 
 
 
799 aa  174  5e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.976806  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.41 
 
 
640 aa  174  5e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3370  PAS sensor protein  26.98 
 
 
713 aa  173  8e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.277761  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0010  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.88 
 
 
508 aa  173  9e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0502065  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 
911 aa  172  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0780  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.42 
 
 
774 aa  172  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00413354  normal  0.0431838 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.98 
 
 
589 aa  171  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3771  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.69 
 
 
1039 aa  170  8e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  1.91257e-05 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1160  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.43 
 
 
829 aa  169  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.380489 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3159  sensory box histidine kinase/response regulator  31.33 
 
 
771 aa  169  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.882119  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  33.09 
 
 
537 aa  168  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7014  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.21 
 
 
781 aa  169  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1113  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.81 
 
 
1042 aa  169  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2725  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.71 
 
 
568 aa  169  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0210  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.29 
 
 
708 aa  169  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 
489 aa  168  3e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6454  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.24 
 
 
768 aa  167  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2361  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.52 
 
 
1560 aa  167  4e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1375  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.24 
 
 
768 aa  167  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.397027  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3213  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 
778 aa  167  7e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5419  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.73 
 
 
713 aa  167  7e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3124  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.88 
 
 
1374 aa  167  8e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.957955  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2107  histidine kinase  30.34 
 
 
598 aa  166  1e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1289  sensory box histidine kinase/response regulator  31.14 
 
 
772 aa  166  1e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1000  sensory box histidine kinase/response regulator  31.14 
 
 
771 aa  166  1e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4313  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.13 
 
 
965 aa  166  1e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.975749 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2264  sensory box histidine kinase/response regulator  31.14 
 
 
771 aa  166  1e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.87596  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03428  PAS signal transduction protein  28.71 
 
 
962 aa  166  1e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0142  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.67 
 
 
421 aa  166  1e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00283134  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3030  sensory box histidine kinase/response regulator  32.94 
 
 
771 aa  166  1e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1979  sensory box histidine kinase/response regulator  31.14 
 
 
771 aa  166  1e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1854  histidine kinase  34.45 
 
 
1111 aa  166  2e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.131557  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2209  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.98 
 
 
399 aa  165  2e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.71 
 
 
1010 aa  166  2e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 
719 aa  166  2e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.688425  normal  0.99318 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 
604 aa  165  3e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  1.97924e-10  normal  0.403449 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4852  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 
884 aa  164  4e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2025  two component sensor histidine kinase  30.15 
 
 
613 aa  164  4e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.199641  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.05 
 
 
819 aa  164  4e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000597485  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.33 
 
 
916 aa  164  4e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0534  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.34 
 
 
697 aa  164  5e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.608337  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0249  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.12 
 
 
484 aa  164  5e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1130  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.01 
 
 
748 aa  164  5e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1618  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.01 
 
 
711 aa  164  5e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.11 
 
 
1002 aa  164  6e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0008  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.81 
 
 
755 aa  164  6e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.865749 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2140  fused multi-sensor protein  32.45 
 
 
882 aa  163  7e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.236911  normal  0.359885 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.65 
 
 
1069 aa  164  7e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21630  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 
594 aa  163  8e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.43993e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1379  sensory box histidine kinase/response regulator  32.71 
 
 
769 aa  163  8e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.364148  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0010  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.29 
 
 
511 aa  163  9e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.97 
 
 
639 aa  162  1e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.97 
 
 
639 aa  162  2e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1987  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.18 
 
 
577 aa  162  2e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0782  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.4 
 
 
584 aa  161  3e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.95 
 
 
637 aa  161  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6046  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.78 
 
 
768 aa  161  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.479069  normal  0.26296 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1430  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.49 
 
 
737 aa  161  3e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.224344 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>