More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1809 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1809  putative signal-transduction protein with CBS domains  100 
 
 		 478 aa  976    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2620  putative signal transduction protein with CBS domains  51.16 
 
 		 480 aa  487  1e-136  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0774627  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1394  putative signal-transduction protein with CBS domains  37.82 
 
 		 485 aa  326  6e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.332611  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1296  hypothetical protein  33.83 
 
 		 601 aa  258  1e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.922257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1543  putative signal-transduction protein with CBS domains  31.21 
 
 		 600 aa  252  9.000000000000001e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00292919  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2007  CBS domain-containing protein  33.71 
 
 		 623 aa  245  9.999999999999999e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232416  decreased coverage  0.00139706 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1022  cyclic nucleotide-binding protein  32.22 
 
 		 613 aa  245  1.9999999999999999e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3932  CBS domain-containing protein  33.41 
 
 		 623 aa  245  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.177243  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3713  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  33.11 
 
 		 613 aa  241  2e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000235103  unclonable  0.0000000288509 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2052  cyclic nucleotide-binding protein  31.14 
 
 		 663 aa  238  1e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.19282 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0575  signal transduction protein  34.18 
 
 		 606 aa  238  2e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.513215  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0554  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  32.92 
 
 		 637 aa  238  2e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2228  cyclic nucleotide-binding protein  34.18 
 
 		 606 aa  237  3e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.480608  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1584  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  33.76 
 
 		 606 aa  232  1e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0450512 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1863  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  31.57 
 
 		 625 aa  232  1e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0994673  normal  0.46863 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2835  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 615 aa  232  1e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00609535 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2478  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  32.01 
 
 		 642 aa  231  2e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00776763 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0873  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.9 
 
 		 605 aa  231  2e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.563434  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4954  CBS domain-containing protein  30.41 
 
 		 624 aa  231  3e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2113  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  31.95 
 
 		 644 aa  229  1e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1751  cyclic nucleotide-binding protein  32.43 
 
 		 615 aa  228  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2856  CBS domain-containing protein  31.51 
 
 		 620 aa  228  3e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1576  cyclic nucleotide-binding protein  31.28 
 
 		 620 aa  228  3e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132625 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0506  CBS domain-containing protein  33.4 
 
 		 606 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.413474  normal  0.25412 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2430  signal-transduction protein  32.68 
 
 		 565 aa  226  7e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.15974  normal  0.429408 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1119  signal-transduction protein  30.54 
 
 		 615 aa  226  9e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1515  cyclic nucleotide-binding protein  31.06 
 
 		 620 aa  225  1e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0149843 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1582  cyclic nucleotide-binding protein  31.06 
 
 		 620 aa  225  1e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0380043 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1712  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  31.56 
 
 		 615 aa  224  3e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  hitchhiker  0.00000133647 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2357  cyclic nucleotide-binding protein  31.78 
 
 		 615 aa  224  3e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2672  signal-transduction protein  31.56 
 
 		 615 aa  224  4e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2751  CBS domain-containing protein  31.56 
 
 		 615 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0342062 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2637  signal-transduction protein  31.56 
 
 		 615 aa  223  6e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1524  CBS domain-containing protein  32.23 
 
 		 618 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2369  cyclic nucleotide-binding protein  31.53 
 
 		 615 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1548  cyclic nucleotide-binding protein  32.82 
 
 		 615 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1043  cyclic nucleotide-binding protein  30.27 
 
 		 624 aa  222  9.999999999999999e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0267  cyclic nucleotide-binding protein  30.36 
 
 		 625 aa  221  1.9999999999999999e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0537  CBS domain-containing protein  30.77 
 
 		 609 aa  220  3.9999999999999997e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0769  hypothetical protein  29.54 
 
 		 574 aa  219  1e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.463827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1025  cyclic nucleotide-binding protein  30.02 
 
 		 645 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1697  CBS domain-containing protein  32.12 
 
 		 615 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3158  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.72 
 
 		 596 aa  215  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.664732  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3783  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.65 
 
 		 603 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.612784  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0264  signal protein  31.13 
 
 		 614 aa  213  3.9999999999999995e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0770  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30 
 
 		 603 aa  212  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.461269  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3667  cyclic nucleotide-binding protein  31.29 
 
 		 606 aa  212  1e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.773951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0818  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  30 
 
 		 603 aa  212  1e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.410169  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1615  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  31.8 
 
 		 636 aa  212  2e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22370  hypothetical protein  33.92 
 
 		 599 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000015085 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0634  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.58 
 
 		 604 aa  211  3e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0507059  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2583  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  29.23 
 
 		 648 aa  210  4e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0822  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  29.79 
 
 		 603 aa  210  4e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2504  cyclic nucleotide-binding protein  30.24 
 
 		 628 aa  209  6e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1892  hypothetical protein  33.92 
 
 		 599 aa  209  9e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2002  cyclic nucleotide-binding protein  30.11 
 
 		 641 aa  209  1e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5110  signal-transduction protein  30.68 
 
 		 485 aa  208  2e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0910  hypothetical protein  28.72 
 
 		 637 aa  208  2e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.529281  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4553  cyclic nucleotide-binding protein  30.4 
 
 		 603 aa  208  2e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.984926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0629  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.12 
 
 		 667 aa  207  4e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4030  CBS domain-containing protein  30.61 
 
 		 641 aa  206  6e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.210383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2693  hypothetical protein  30.61 
 
 		 607 aa  206  6e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01888  hypothetical protein  28.96 
 
 		 629 aa  205  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1849  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  30.41 
 
 		 633 aa  205  1e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0316  putative signal transduction protein with CBS domains  30.77 
 
 		 576 aa  206  1e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3274  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  31.42 
 
 		 596 aa  205  1e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.877425  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1568  cyclic nucleotide-binding protein  30.77 
 
 		 634 aa  205  2e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0699  CBS domain-containing protein  28.42 
 
 		 625 aa  204  4e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0116377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3836  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  30.42 
 
 		 601 aa  203  5e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4338  CBS domain-containing protein  28.6 
 
 		 618 aa  203  5e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02457  hypothetical protein  26.71 
 
 		 626 aa  203  6e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4152  signal-transduction protein  30.15 
 
 		 486 aa  202  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.729428 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2504  CBS domain-containing protein  31.44 
 
 		 612 aa  201  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000127678 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0903  cyclic nucleotide-binding protein  28.69 
 
 		 638 aa  201  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0051  cyclic nucleotide-binding protein  27.58 
 
 		 629 aa  201  3e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003141  Signal transduction protein  28.51 
 
 		 629 aa  200  3.9999999999999996e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1453  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.46 
 
 		 604 aa  200  5e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2831  putative nucleotidyltransferases  30.82 
 
 		 610 aa  200  5e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00167  cyclic nucleotide binding protein  30.96 
 
 		 608 aa  198  2.0000000000000003e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3695  cyclic nucleotide-binding protein  30.4 
 
 		 603 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3753  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  29.38 
 
 		 601 aa  197  3e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.53341  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4543  CBS domain-containing protein  28.12 
 
 		 639 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.661781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0090  CBS signal-transduction protein  28.94 
 
 		 629 aa  197  5.000000000000001e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.382061 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0100  putative cyclic nucleotide binding protein  28.42 
 
 		 626 aa  197  5.000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1635  cyclic nucleotide-binding/CBS/putative nucleotidyltransferase  26.78 
 
 		 646 aa  196  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.5663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0827  protein of unknown function DUF294 nucleotidyltransferase putative  28.48 
 
 		 601 aa  196  1e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000971693  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003608  Signal transduction protein  26.06 
 
 		 626 aa  195  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0302  signal-transduction protein  27.37 
 
 		 648 aa  194  2e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0354  CBS domain-containing protein  30.61 
 
 		 645 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.466174 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0380  CBS domain-containing protein  30.61 
 
 		 645 aa  193  5e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.488205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002201  predicted signal-transduction protein  29.91 
 
 		 561 aa  192  7e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3348  putative nucleotidyltransferase  29.01 
 
 		 646 aa  192  1e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.351645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0382  CBS domain-containing protein  29.35 
 
 		 645 aa  190  5e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.263171 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1034  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  29.39 
 
 		 660 aa  189  5.999999999999999e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0124015 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4848  CBS domain-containing protein  29.98 
 
 		 645 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.602391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0046  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  30.46 
 
 		 605 aa  189  9e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5185  cyclic nucleotide-binding (cNMP-bd) protein  30.51 
 
 		 646 aa  189  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255954  normal  0.285696 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0978  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.19 
 
 		 635 aa  189  1e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.082367  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3131  cyclic nucleotide-binding domain (cNMP-BD) protein  28.57 
 
 		 633 aa  188  1e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3557  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  30.13 
 
 		 605 aa  188  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>