More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3198 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_3198  signal peptide peptidase SppA, 36K type  100 
 
 		 313 aa  612  9.999999999999999e-175  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.216895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0102  S49 family peptidase  37.99 
 
 		 326 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0059  peptidase S49, SppA  37.04 
 
 		 327 aa  209  4e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0430254  normal  0.117031 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0068  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.99 
 
 		 326 aa  208  7e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0824847  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0166  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.36 
 
 		 323 aa  209  7e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0154  signal peptide peptidase SppA  42.38 
 
 		 331 aa  206  3e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0149  signal peptide peptidase SppA  42.38 
 
 		 331 aa  206  3e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.415563  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0044  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.46 
 
 		 316 aa  202  8e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.316268  normal  0.230689 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0396  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.77 
 
 		 325 aa  202  9e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.302309  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0060  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.19 
 
 		 316 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0067  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.11 
 
 		 325 aa  196  5.000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0020  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.68 
 
 		 319 aa  196  6e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184229 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0639  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.57 
 
 		 321 aa  192  9e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0663368 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0236  signal peptide peptidase SppA, 36K type  45.26 
 
 		 296 aa  191  1e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0147104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3671  signal peptide peptidase A  38.46 
 
 		 322 aa  191  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0193  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.99 
 
 		 326 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.116765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2500  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.7 
 
 		 321 aa  187  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2197  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.67 
 
 		 321 aa  187  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.321393  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2929  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.85 
 
 		 324 aa  186  3e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.359605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2329  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.86 
 
 		 383 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2220  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.6 
 
 		 323 aa  182  5.0000000000000004e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.205102  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0205  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.46 
 
 		 322 aa  181  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0219029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0180  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.46 
 
 		 321 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.589969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2445  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.56 
 
 		 320 aa  179  4e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.534538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0122  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.01 
 
 		 321 aa  179  8e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1881  signal peptide peptidase SppA, 67K type  49.17 
 
 		 298 aa  177  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971573  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0508  signal peptide peptidase A  45.21 
 
 		 280 aa  177  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0143  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34 
 
 		 324 aa  176  4e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1703  signal peptide peptidase SppA, 36K type  50.49 
 
 		 297 aa  176  7e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1234  signal peptide peptidase SppA, 36K type  47.03 
 
 		 260 aa  167  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0052  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.19 
 
 		 296 aa  166  5e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0148  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.65 
 
 		 314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0067  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.89 
 
 		 274 aa  162  1e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1750  signal peptide peptidase A  43.24 
 
 		 301 aa  159  6e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0148  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.82 
 
 		 296 aa  157  2e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000244919  normal  0.445804 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2551  signal peptide peptidase SppA, 36K type  43.81 
 
 		 295 aa  157  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.210829  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2179  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.22 
 
 		 299 aa  155  9e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2714  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37 
 
 		 336 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2497  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.58 
 
 		 295 aa  152  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.609347  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0401  signal peptide peptidase SppA  31.46 
 
 		 288 aa  151  1e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2285  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.87 
 
 		 298 aa  150  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.693274  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1702  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.45 
 
 		 327 aa  150  3e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000021867  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0618  signal peptide peptidase A  31.46 
 
 		 288 aa  150  4e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0403  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.1 
 
 		 272 aa  149  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.469925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0394  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.1 
 
 		 272 aa  149  5e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0725  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.69 
 
 		 335 aa  149  8e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2494  signal peptide peptidase A  30.8 
 
 		 272 aa  148  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0799  signal peptide peptidase A  38.42 
 
 		 269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16541  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  38.42 
 
 		 269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5345  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.44 
 
 		 274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13811  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  39.2 
 
 		 269 aa  145  7.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.99906  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1281  signal peptide peptidase A  38.69 
 
 		 269 aa  143  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2434  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.05 
 
 		 382 aa  142  7e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270678  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1689  signal peptide peptidase A  35.47 
 
 		 273 aa  142  7e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1521  signal peptide peptidase A  38.39 
 
 		 316 aa  142  7e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.290741  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2346  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.05 
 
 		 382 aa  142  7e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13521  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  36.32 
 
 		 269 aa  142  8e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13731  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  38.69 
 
 		 269 aa  142  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06151  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  36.45 
 
 		 270 aa  141  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0720976 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4753  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.8 
 
 		 270 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0127167  hitchhiker  0.0000000108216 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3180  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.72 
 
 		 313 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448923  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0409  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.94 
 
 		 308 aa  139  7.999999999999999e-32  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.927346  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0423  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.79 
 
 		 339 aa  138  8.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1916  signal peptide peptidase A  37.8 
 
 		 270 aa  138  1e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0697  signal peptide peptidase A  42.46 
 
 		 340 aa  138  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1781  peptidase S49, SppA  37.62 
 
 		 270 aa  136  4e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3060  signal peptide peptidase SppA, 67K type  41.54 
 
 		 625 aa  136  4e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2291  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.69 
 
 		 366 aa  136  5e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1980  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.28 
 
 		 299 aa  136  5e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000026819  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12671  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  37.44 
 
 		 269 aa  136  5e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000540358 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2255  signal peptide peptidase SppA  33 
 
 		 273 aa  135  8e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.221521  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09290  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.76 
 
 		 376 aa  132  6.999999999999999e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.123416 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2159  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.29 
 
 		 338 aa  132  7.999999999999999e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.0023667  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2119  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.86 
 
 		 290 aa  131  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  unclonable  0.00000986804 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1421  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.79 
 
 		 326 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000360798  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0392  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.33 
 
 		 311 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.163931  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2415  periplasmic serine proteases (ClpP class)  32.13 
 
 		 297 aa  131  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.025979  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0522  signal peptide peptidase SppA, 67K type  41.52 
 
 		 626 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0583  signal peptide peptidase A  36.13 
 
 		 273 aa  129  6e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3085  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.82 
 
 		 348 aa  128  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1089  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.15 
 
 		 350 aa  127  2.0000000000000002e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00447762  hitchhiker  0.000000000000025278 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1850  protease 4  42.69 
 
 		 618 aa  125  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0115674  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1425  protease 4  42.69 
 
 		 622 aa  125  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.107145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2021  protease 4  42.69 
 
 		 618 aa  125  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124959  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2221  signal peptide peptidase SppA, 67K type  41.18 
 
 		 661 aa  125  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.431319 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1866  protease 4  42.69 
 
 		 618 aa  125  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235233  decreased coverage  0.00000640053 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0867  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.49 
 
 		 595 aa  125  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0715  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.97 
 
 		 290 aa  124  2e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1197  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.47 
 
 		 282 aa  124  2e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2394  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.14 
 
 		 342 aa  124  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3112  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.66 
 
 		 293 aa  124  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2486  protease 4  42.26 
 
 		 618 aa  123  5e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.944254  normal  0.176457 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2235  protease IV  38.54 
 
 		 633 aa  123  5e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1150  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.77 
 
 		 293 aa  122  7e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01735  protease IV (signal peptide peptidase)  42.11 
 
 		 618 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0080246  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1876  signal peptide peptidase SppA, 67K type  42.11 
 
 		 618 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00501003  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2145  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.02 
 
 		 633 aa  121  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01723  hypothetical protein  42.11 
 
 		 618 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0152845  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1990  protease 4  42.11 
 
 		 618 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0152485  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0032  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.85 
 
 		 371 aa  120  3e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.557774  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>