More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3038 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_3038  30S ribosomal protein S6  100 
 
 		 161 aa  319  9.000000000000001e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.59116  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1512  30S ribosomal protein S6  64.42 
 
 		 158 aa  203  1e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.589185  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2512  30S ribosomal protein S6  54.84 
 
 		 126 aa  135  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0414  30S ribosomal protein S6  53.77 
 
 		 160 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1352  30S ribosomal protein S6  48.53 
 
 		 132 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0105388  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3361  ribosomal protein S6  52.88 
 
 		 155 aa  128  4.0000000000000003e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2303  30S ribosomal protein S6  50 
 
 		 151 aa  126  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5421  30S ribosomal protein S6  52.88 
 
 		 154 aa  125  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0549173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3487  30S ribosomal protein S6  49.31 
 
 		 158 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289777  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3118  30S ribosomal protein S6  52.83 
 
 		 152 aa  124  5e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.158791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3942  30S ribosomal protein S6  49.06 
 
 		 151 aa  124  5e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.262713 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4310  30S ribosomal protein S6  49.06 
 
 		 151 aa  124  5e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0751589 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4637  30S ribosomal protein S6  49.53 
 
 		 134 aa  124  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.329942  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2590  30S ribosomal protein S6  49.53 
 
 		 134 aa  124  7e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4417  30S ribosomal protein S6  49.06 
 
 		 151 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.316855 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2464  30S ribosomal protein S6  51.64 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1416  30S ribosomal protein S6  55.05 
 
 		 120 aa  121  4e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1900  30S ribosomal protein S6  49.53 
 
 		 122 aa  120  6e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2296  30S ribosomal protein S6  51.89 
 
 		 168 aa  120  8e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.220775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0898  30S ribosomal protein S6  50 
 
 		 146 aa  118  3e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0179425 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3815  30S ribosomal protein S6  52.88 
 
 		 153 aa  118  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.247483  normal  0.0901852 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1916  30S ribosomal protein S6  50.96 
 
 		 148 aa  117  4.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.136895  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0741  30S ribosomal protein S6  46.09 
 
 		 145 aa  117  7e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429444  normal  0.125363 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2186  30S ribosomal protein S6  48.11 
 
 		 117 aa  116  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1772  30S ribosomal protein S6  49.11 
 
 		 135 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.468472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0139  30S ribosomal protein S6  49.11 
 
 		 132 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2985  30S ribosomal protein S6  50.96 
 
 		 160 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.620365 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0569  30S ribosomal protein S6  52.38 
 
 		 151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1212  30S ribosomal protein S6  52.21 
 
 		 117 aa  115  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.134172  normal  0.709191 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0494  30S ribosomal protein S6  44.96 
 
 		 136 aa  115  3e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2355  30S ribosomal protein S6  50.96 
 
 		 147 aa  115  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22878  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0461  30S ribosomal protein S6  51.43 
 
 		 156 aa  115  3.9999999999999997e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0455  30S ribosomal protein S6  51.43 
 
 		 148 aa  114  5e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0189276  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1691  30S ribosomal protein S6  51.92 
 
 		 139 aa  114  5e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1197  30S ribosomal protein S6  46.73 
 
 		 155 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.358566  normal  0.0253087 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1054  30S ribosomal protein S6  46.73 
 
 		 155 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.285791 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1622  30S ribosomal protein S6  50 
 
 		 117 aa  113  8.999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0541746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1520  30S ribosomal protein S6  47.17 
 
 		 153 aa  113  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.162884  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1045  30S ribosomal protein S6  48.11 
 
 		 117 aa  112  3e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.146697 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0891  30S ribosomal protein S6  50 
 
 		 131 aa  111  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194189  normal  0.483607 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0695  30S ribosomal protein S6  40.38 
 
 		 109 aa  96.3  2e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.308714  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0308  30S ribosomal protein S6  39.42 
 
 		 109 aa  95.9  2e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.389439  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0220  ribosomal protein S6  38.36 
 
 		 156 aa  80.9  0.000000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1364  ribosomal protein S6  39.64 
 
 		 114 aa  81.3  0.000000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.151938  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1326  SSU ribosomal protein S6P  39.6 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24985  normal  0.887492 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2525  ribosomal protein S6  40.66 
 
 		 95 aa  79  0.00000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.863645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1951  30S ribosomal protein S6  36.44 
 
 		 125 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.380092  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3561  30S ribosomal protein S6  40.66 
 
 		 96 aa  76.6  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.642829 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1383  ribosomal protein S6  38.46 
 
 		 142 aa  77  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.760847  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2824  30S ribosomal protein S6  36.84 
 
 		 134 aa  75.9  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.254018  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2446  30S ribosomal protein S6  36.84 
 
 		 134 aa  75.9  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045402 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1526  30S ribosomal protein S6  36.75 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.153289  normal  0.214349 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2133  SSU ribosomal protein S6P  41.76 
 
 		 96 aa  76.3  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2462  SSU ribosomal protein S6P  36.19 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309208 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3891  30S ribosomal protein S6  41.3 
 
 		 101 aa  74.7  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.202922 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4664  SSU ribosomal protein S6P  39.36 
 
 		 96 aa  73.9  0.0000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.663648  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23360  ribosomal protein S6  37.23 
 
 		 95 aa  73.9  0.0000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.28748e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4120  30S ribosomal protein S6  40.22 
 
 		 101 aa  73.9  0.0000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3669  30S ribosomal protein S6  34.65 
 
 		 128 aa  72.8  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0796579  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3700  ribosomal protein S6  42.7 
 
 		 97 aa  73.2  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31780  SSU ribosomal protein S6P  38.04 
 
 		 96 aa  72.4  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2038  30S ribosomal protein S6  36.22 
 
 		 136 aa  72  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.421442  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2006  30S ribosomal protein S6  35.58 
 
 		 124 aa  72  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0888  SSU ribosomal protein S6P  35.59 
 
 		 135 aa  72.4  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0428  30S ribosomal protein S6  33.64 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.531029 
 
 
-
 
NC_002950  PG0595  30S ribosomal protein S6  38.54 
 
 		 117 aa  71.2  0.000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1243  30S ribosomal protein S6  36.63 
 
 		 122 aa  71.2  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0890507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1182  30S ribosomal protein S6  36.63 
 
 		 122 aa  71.2  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0492029  normal  0.220406 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4355  30S ribosomal protein S6  35.79 
 
 		 95 aa  70.9  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0758  30S ribosomal protein S6  36.36 
 
 		 129 aa  70.9  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000104725  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37810  SSU ribosomal protein S6P  39.56 
 
 		 95 aa  70.9  0.000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.188789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0420  30S ribosomal protein S6  34.65 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000077892  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1307  30S ribosomal protein S6  35.58 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3784  30S ribosomal protein S6  35.4 
 
 		 130 aa  70.5  0.000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3639  30S ribosomal protein S6  35.4 
 
 		 130 aa  70.5  0.000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0683  30S ribosomal protein S6  35.4 
 
 		 130 aa  70.5  0.000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1216  30S ribosomal protein S6  33.66 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0128  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 98 aa  70.5  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443622  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2138  ribosomal protein S6  36.84 
 
 		 95 aa  70.1  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000043387  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4844  ribosomal protein S6  39.33 
 
 		 96 aa  70.1  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0446  30S ribosomal protein S6  36.21 
 
 		 132 aa  70.1  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453306 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2105  30S ribosomal protein S6  35.29 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.312011  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4181  ribosomal protein S6  39.56 
 
 		 96 aa  68.9  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3419  ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 133 aa  69.3  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.797124  normal  0.172954 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9357  30S ribosomal protein S6  37.36 
 
 		 96 aa  68.9  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03778  30S ribosomal protein S6  34.65 
 
 		 133 aa  68.6  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2978  30S ribosomal protein S6  32.58 
 
 		 95 aa  68.9  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000894429  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2656  30S ribosomal protein S6  32.58 
 
 		 95 aa  68.9  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000485291  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1979  30S ribosomal protein S6  33.66 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.102092 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2589  30S ribosomal protein S6  34.19 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.782476 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2830  30S ribosomal protein S6  35.4 
 
 		 121 aa  68.6  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5229  30S ribosomal protein S6  35.96 
 
 		 120 aa  68.2  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3592  30S ribosomal protein S6  35.4 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.518893  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3435  30S ribosomal protein S6  35.4 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0120822  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1783  30S ribosomal protein S6  33.66 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2386  30S ribosomal protein S6  36.84 
 
 		 137 aa  67.8  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1811  30S ribosomal protein S6  33.66 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.844657  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1786  30S ribosomal protein S6  29.66 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.58345  normal  0.226907 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2456  30S ribosomal protein S6  29.66 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0929827  normal  0.188014 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1874  30S ribosomal protein S6  33.66 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>