135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1917 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1917  protein of unknown function YGGT  100 
 
 		 102 aa  196  1.0000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.951257  normal  0.340645 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0989  protein of unknown function YGGT  51.19 
 
 		 114 aa  84.3  6e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3527  hypothetical protein  53.42 
 
 		 99 aa  79  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12787  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1992  YGGT family protein  53.97 
 
 		 96 aa  77.8  0.00000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1918  YGGT family protein  53.97 
 
 		 194 aa  77  0.00000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2655  protein of unknown function YGGT  47.56 
 
 		 101 aa  76.3  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0666885  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4076  protein of unknown function YGGT  51.16 
 
 		 96 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3782  protein of unknown function YGGT  51.16 
 
 		 103 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.402098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4038  protein of unknown function YGGT  50 
 
 		 96 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.5468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0508  protein of unknown function YGGT  44.87 
 
 		 96 aa  74.3  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.842199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0057  protein of unknown function YGGT  44.3 
 
 		 96 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4152  hypothetical protein  52.38 
 
 		 96 aa  71.2  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4027  protein of unknown function YGGT  49.21 
 
 		 96 aa  70.9  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.483363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4761  protein of unknown function YGGT  39.36 
 
 		 106 aa  70.1  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.211635 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3706  protein of unknown function YGGT  43.48 
 
 		 103 aa  68.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.535312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0271  hypothetical protein  47.44 
 
 		 96 aa  68.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4464  protein of unknown function YGGT  55.93 
 
 		 100 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.338351 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3938  protein of unknown function YGGT  49.28 
 
 		 95 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0478  hypothetical protein  42.86 
 
 		 96 aa  65.9  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3372  protein of unknown function YGGT  51.72 
 
 		 96 aa  65.9  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0327  yggt family protein  43.68 
 
 		 97 aa  65.5  0.0000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2973  protein of unknown function YGGT  45.83 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0607  protein of unknown function YGGT  42.86 
 
 		 96 aa  65.5  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2870  protein of unknown function YGGT  50 
 
 		 101 aa  64.3  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0388606 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3568  protein of unknown function YGGT  50 
 
 		 96 aa  62.8  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0053  protein of unknown function YGGT  47.44 
 
 		 99 aa  61.2  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.941254 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0341  protein of unknown function YGGT  41.18 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3096  protein of unknown function YGGT  39.47 
 
 		 102 aa  59.7  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.669144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0419  protein of unknown function YGGT  43.08 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2879  protein of unknown function YGGT  45.9 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.147865 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3629  protein of unknown function YGGT  49.28 
 
 		 95 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0692  protein of unknown function YGGT  40 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1370  protein of unknown function YGGT  50.94 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0110  hypothetical protein  41.54 
 
 		 119 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0365579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0018  protein of unknown function YGGT  36.84 
 
 		 95 aa  53.9  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.292831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1360  hypothetical protein  36.84 
 
 		 101 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0028  protein of unknown function YGGT  36.84 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.242413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1237  protein of unknown function YGGT  38.71 
 
 		 89 aa  53.1  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.371486  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3299  protein of unknown function YGGT  47.27 
 
 		 99 aa  52  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3609  protein of unknown function YGGT  39.13 
 
 		 189 aa  51.6  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3358  protein of unknown function YGGT  45.59 
 
 		 188 aa  50.8  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0016989 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1212  protein of unknown function YGGT  35.8 
 
 		 182 aa  50.1  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0177861 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0149  protein of unknown function YGGT  39.56 
 
 		 100 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.041214 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1665  protein of unknown function YGGT  41.57 
 
 		 99 aa  50.1  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.905288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0534  protein of unknown function YGGT  29.73 
 
 		 194 aa  48.9  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1971  protein of unknown function YGGT  37.18 
 
 		 84 aa  48.9  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.188366 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4032  protein of unknown function YGGT  35.48 
 
 		 184 aa  48.5  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886825 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4199  protein of unknown function YGGT  36.9 
 
 		 186 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.7106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4087  protein of unknown function YGGT  36.9 
 
 		 186 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.300525  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3452  hypothetical protein  38.67 
 
 		 184 aa  48.5  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0294828  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0011  hypothetical protein  38.46 
 
 		 185 aa  48.1  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3335  protein of unknown function YGGT  36.14 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.982716 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0541  membrane protein, related to K+ transport  37.18 
 
 		 184 aa  48.1  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.182958  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0261  YGGT family protein  38.46 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.634053  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0438  protein of unknown function YGGT  38.46 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000112129 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3999  ylmG protein  31.58 
 
 		 87 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000449706  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3725  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 		 87 aa  47.8  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00556578  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0933  protein of unknown function YGGT  52.63 
 
 		 85 aa  47.8  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0945487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1125  protein of unknown function YGGT  38.1 
 
 		 182 aa  47.4  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000165213  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1242  ylmG protein  32.1 
 
 		 87 aa  47  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000199997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2172  hypothetical protein  37.63 
 
 		 100 aa  47  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0505653  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02782  predicted inner membrane protein  40.62 
 
 		 188 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.104199  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0743  protein of unknown function YGGT  40.62 
 
 		 188 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1166  protein of unknown function YGGT  46.55 
 
 		 105 aa  46.2  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866748  hitchhiker  0.00575832 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4255  YGGT family protein  40.62 
 
 		 188 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.809329  normal  0.660406 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1696  protein of unknown function YGGT  42.22 
 
 		 100 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.471282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0947  protein of unknown function YGGT  38.57 
 
 		 192 aa  46.6  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.618723  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3112  YGGT family protein  40.62 
 
 		 188 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3296  YGGT family protein  40.62 
 
 		 188 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3054  protein of unknown function YGGT  42.5 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.649035  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0762  protein of unknown function YGGT  40.62 
 
 		 188 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000437553 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3094  YGGT family protein  40.62 
 
 		 188 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000274597 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02745  hypothetical protein  40.62 
 
 		 188 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.090594  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3384  YGGT family protein  40.62 
 
 		 188 aa  46.6  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0866  YGGT family protein  36.71 
 
 		 104 aa  45.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3943  ylmG protein  32.1 
 
 		 87 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00794391  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3749  ylmG protein  32.1 
 
 		 87 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0442014  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3640  hypothetical protein  32.1 
 
 		 87 aa  45.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138235  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3657  hypothetical protein  32.1 
 
 		 87 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.516535  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4037  hypothetical protein  32.1 
 
 		 87 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000926366  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0339  protein of unknown function YGGT  40.58 
 
 		 192 aa  45.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0956  protein of unknown function YGGT  30.23 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00321355  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1362  protein of unknown function YGGT  45 
 
 		 86 aa  46.2  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03580  hypothetical protein  37.18 
 
 		 182 aa  46.2  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3912  ylmG protein  32.1 
 
 		 87 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000638636 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1230  protein of unknown function YGGT  36.9 
 
 		 182 aa  45.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000825612  normal  0.409234 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3950  ylmG protein  33.33 
 
 		 87 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361919  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0758  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 		 184 aa  45.4  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0405  protein of unknown function YGGT  39.58 
 
 		 97 aa  45.1  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.97811  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3655  protein of unknown function YGGT  40.32 
 
 		 199 aa  44.7  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1165  protein of unknown function YGGT  37.04 
 
 		 105 aa  44.7  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000835508  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1838  protein of unknown function YGGT  34.52 
 
 		 183 aa  44.7  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2547  protein of unknown function YGGT  30.38 
 
 		 87 aa  43.9  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167983  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5573  hypothetical protein  33.72 
 
 		 187 aa  42.7  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364539  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2862  protein of unknown function YGGT  34.57 
 
 		 182 aa  43.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0177844  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3042  hypothetical protein  38.46 
 
 		 180 aa  43.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.390306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1135  protein of unknown function YGGT  35.87 
 
 		 182 aa  43.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000824226  normal  0.525534 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0140  YggT family membrane protein  37.5 
 
 		 184 aa  43.5  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00236591 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0415  protein of unknown function YGGT  46.77 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000337721  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1492  protein of unknown function YGGT  38.89 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290091  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>