145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0077 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0077  transcriptional regulator, CarD family  100 
 
 		 196 aa  392  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.449378  hitchhiker  0.00491109 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3091  CarD family transcriptional regulator  52.23 
 
 		 266 aa  171  5.999999999999999e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0786  transcriptional regulator  49.34 
 
 		 170 aa  155  4e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.000100342  normal  0.0526342 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2296  CarD family transcriptional regulator  47.2 
 
 		 169 aa  154  8e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0000229013  normal  0.715869 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0576  CarD family transcriptional regulator  49.37 
 
 		 169 aa  152  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  unclonable  0.0000000000504519  unclonable  0.0000000218406 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2425  CarD family transcriptional regulator  47.56 
 
 		 169 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.0000259686  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1089  CarD family transcriptional regulator  47.56 
 
 		 169 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0349811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1557  CarD family transcriptional regulator  47.56 
 
 		 169 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0486007  normal  0.568097 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1825  CarD family transcriptional regulator  50.7 
 
 		 169 aa  152  4e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  unclonable  0.00000000000495809  normal  0.361852 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3308  CarD family transcriptional regulator  49.33 
 
 		 172 aa  149  3e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000178714  normal  0.0560372 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3880  transcription factor CarD  48.3 
 
 		 196 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.260556  normal  0.0799721 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1718  transcriptional regulator, CarD family  50 
 
 		 197 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4190  transcriptional regulator, CarD family  47.62 
 
 		 196 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.627659  normal  0.224383 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3537  CarD family transcriptional regulator  48.75 
 
 		 172 aa  145  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.92305  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4337  transcriptional regulator, CarD family  48.55 
 
 		 198 aa  145  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139184  normal  0.529688 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4805  CarD family transcriptional regulator  49.29 
 
 		 197 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0268969  hitchhiker  0.000256244 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0124  CarD family transcriptional regulator  46.79 
 
 		 174 aa  143  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3708  CarD family transcriptional regulator  48.55 
 
 		 201 aa  142  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.378672 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0278  transcription factor CarD  48.94 
 
 		 432 aa  142  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.197745 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4112  CarD family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 170 aa  142  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00258914  normal  0.616295 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4143  transcriptional regulator, CarD family  47.14 
 
 		 190 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239678  normal  0.0810654 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0412  transcription factor CarD  47.52 
 
 		 283 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.595911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3112  CarD family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 189 aa  140  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.0000522164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3814  transcriptional regulator, CarD family  47.14 
 
 		 190 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0247  CarD family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 175 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.246568 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0548  CarD family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 365 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.300109  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7543  CarD family transcriptional regulator  46.54 
 
 		 278 aa  139  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.330727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0489  transcriptional regulator, CarD family  48.23 
 
 		 278 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0551  CarD family transcriptional regulator  48.23 
 
 		 429 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0207185  normal  0.0758016 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0187  CarD family transcriptional regulator  48.55 
 
 		 206 aa  139  3.9999999999999997e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.160759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4352  transcriptional regulator CarD family  47.86 
 
 		 223 aa  137  7.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1766  transcriptional regulator, putative  46.43 
 
 		 191 aa  137  8.999999999999999e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.000100794  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1702  putative transcriptional regulator  46.43 
 
 		 191 aa  137  8.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000176532  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0507  CarD family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 259 aa  137  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0122387  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0079  CarD family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 165 aa  136  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1134  CarD family transcriptional regulator  42.95 
 
 		 193 aa  136  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000250032  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1694  CarD family transcriptional regulator  44.03 
 
 		 350 aa  136  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335809  normal  0.132221 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1371  transcriptional regulator, CarD family  42.04 
 
 		 456 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.401785 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3379  CarD family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 190 aa  135  4e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000818177  n/a   
 
 
 
NC_010581  Bind_3138  CarD family transcriptional regulator  43.97 
 
 		 368 aa  130  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0123  CarD family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 192 aa  122  4e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2821  CarD family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 188 aa  92.4  4e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000911518  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3655  CarD family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 159 aa  89  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000563805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0185  CarD family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 158 aa  88.2  6e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164199  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0104  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 161 aa  88.2  7e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0970  transcription factor CarD  32.08 
 
 		 162 aa  87.8  9e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0421613  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0601  transcriptional regulator, CarD family  33.12 
 
 		 162 aa  84.3  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.251005  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1271  CarD family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 171 aa  83.2  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0355661  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2498  CarD family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 171 aa  83.2  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.860997  hitchhiker  0.00028149 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2592  transcriptional regulator, CarD family  35.71 
 
 		 171 aa  83.2  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0112448  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2685  transcriptional regulator, CarD family  35.71 
 
 		 171 aa  83.2  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.000114953  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2489  CarD family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 158 aa  82.4  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00883814  normal  0.0681247 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0184  CarD family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 158 aa  83.2  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000461905  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0164  transcriptional regulator, CarD family  34.53 
 
 		 161 aa  82  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.475576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4522  transcriptional regulator, CarD family  33.33 
 
 		 162 aa  82  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.76792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4740  CarD family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 162 aa  81.3  0.000000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4826  CarD family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 162 aa  81.3  0.000000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.652741  normal  0.999363 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5126  CarD family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 162 aa  81.3  0.000000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.593452 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13616  transcription factor  33.12 
 
 		 162 aa  81.3  0.000000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.392977 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5340  CarD family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 162 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1444  CarD family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 162 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.250117 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4319  transcriptional regulator, CarD family  33.1 
 
 		 160 aa  80.9  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2907  CarD family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 160 aa  79.7  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2940  CarD family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 158 aa  79  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1687  transcriptional regulator, CarD family  32.85 
 
 		 171 aa  78.6  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.613225  normal  0.385121 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1561  CarD family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 171 aa  78.6  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0294353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0842  transcriptional regulator, CarD family  33.77 
 
 		 174 aa  78.6  0.00000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000502927  normal  0.471539 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0259  transcriptional regulator, CarD family  31.65 
 
 		 158 aa  78.2  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000116082  normal  0.0229238 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0751  transcriptional_regulator  34.03 
 
 		 197 aa  78.2  0.00000000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.024387  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0676  transcriptional regulator, CarD family  35.61 
 
 		 176 aa  77.8  0.00000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000000026469  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0364  transcriptional regulator, CarD family  31.47 
 
 		 162 aa  76.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.376987  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0392  transcriptional regulator, CarD family  30.28 
 
 		 158 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000362697  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0399  transcriptional regulator, CarD family  31.54 
 
 		 159 aa  75.5  0.0000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00433509  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0703  transcriptional regulator, CarD family  29.79 
 
 		 160 aa  75.1  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0540347  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0501  CarD family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 163 aa  75.1  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35090  transcriptional regulator, CarD family  29.25 
 
 		 163 aa  73.9  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.86286 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0963  CarD family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 160 aa  73.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00900  transcriptional regulator, CarD family  28.78 
 
 		 176 aa  73.6  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  8.92061e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0773  transcriptional regulator, CarD family  29.17 
 
 		 160 aa  72.4  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.164526  normal  0.216229 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0490  transcriptional regulator, CarD family  31.47 
 
 		 171 aa  72.4  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00257809 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03720  transcriptional regulator, CarD family  26.24 
 
 		 160 aa  72.4  0.000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3388  CarD family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 159 aa  72  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4447  CarD family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 164 aa  71.6  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.948938  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1901  transcriptional regulator, CarD family  29.71 
 
 		 159 aa  71.6  0.000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.488949  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4833  transcriptional regulator, CarD family  29.63 
 
 		 164 aa  71.6  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2959  transcriptional regulator, CarD family  27.08 
 
 		 160 aa  71.6  0.000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4857  CarD family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 164 aa  71.2  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4851  transcriptional regulator, CarD family  30.61 
 
 		 164 aa  71.2  0.000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.906261  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0598  CarD-like protein  31.94 
 
 		 198 aa  71.2  0.000000000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.80876 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03770  transcriptional regulator, CarD family  28.06 
 
 		 160 aa  70.9  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0832449  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0898  transcriptional regulator, CarD family  28.87 
 
 		 160 aa  70.9  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00538334 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4465  CarD family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 164 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31820  transcriptional regulator, CarD family  28.47 
 
 		 160 aa  70.5  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4255  CarD family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 160 aa  69.7  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0726  CarD family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 160 aa  70.1  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0852  transcriptional regulator, CarD family  26.24 
 
 		 160 aa  70.1  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0362  CarD family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 160 aa  69.7  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0755625  hitchhiker  0.00187432 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0651  transcriptional regulator, CarD family  29.37 
 
 		 160 aa  70.1  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.058243  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0663  transcriptional regulator, CarD family  27.34 
 
 		 160 aa  69.7  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.471723  hitchhiker  0.000789071 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4827  transcriptional regulator, CarD family  30.34 
 
 		 164 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>