156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_31820 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_31820  transcriptional regulator, CarD family  100 
 
 		 160 aa  317  3.9999999999999996e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2959  transcriptional regulator, CarD family  93.12 
 
 		 160 aa  301  3.0000000000000004e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2077  transcriptional regulator, CarD family  93.12 
 
 		 161 aa  300  8.000000000000001e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.90671  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0773  transcriptional regulator, CarD family  92.5 
 
 		 160 aa  296  6e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.164526  normal  0.216229 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0898  transcriptional regulator, CarD family  88.12 
 
 		 160 aa  286  7e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00538334 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0663  transcriptional regulator, CarD family  93.75 
 
 		 160 aa  279  9e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.471723  hitchhiker  0.000789071 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09270  transcriptional regulator, CarD family  86.25 
 
 		 160 aa  277  4e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0726  CarD family transcriptional regulator  85 
 
 		 160 aa  275  2e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0852  transcriptional regulator, CarD family  85 
 
 		 160 aa  275  2e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0651  transcriptional regulator, CarD family  81.25 
 
 		 160 aa  263  5e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.058243  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0703  transcriptional regulator, CarD family  82.5 
 
 		 160 aa  264  5e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0540347  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0364  transcriptional regulator, CarD family  81.25 
 
 		 162 aa  263  7e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.376987  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4255  CarD family transcriptional regulator  81.25 
 
 		 160 aa  262  1e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0362  CarD family transcriptional regulator  81.25 
 
 		 160 aa  262  1e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0755625  hitchhiker  0.00187432 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03720  transcriptional regulator, CarD family  81.88 
 
 		 160 aa  261  2e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2907  CarD family transcriptional regulator  81.25 
 
 		 160 aa  259  6.999999999999999e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0501  CarD family transcriptional regulator  80 
 
 		 163 aa  259  6.999999999999999e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13616  transcription factor  80 
 
 		 162 aa  259  8.999999999999999e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.392977 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35090  transcriptional regulator, CarD family  80.38 
 
 		 163 aa  258  3e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.86286 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1444  CarD family transcriptional regulator  79.38 
 
 		 162 aa  258  3e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.250117 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0963  CarD family transcriptional regulator  79.38 
 
 		 160 aa  258  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5340  CarD family transcriptional regulator  78.75 
 
 		 162 aa  256  6e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4740  CarD family transcriptional regulator  79.38 
 
 		 162 aa  256  8e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4826  CarD family transcriptional regulator  79.38 
 
 		 162 aa  256  8e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.652741  normal  0.999363 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5126  CarD family transcriptional regulator  79.38 
 
 		 162 aa  256  8e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.593452 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4319  transcriptional regulator, CarD family  78.12 
 
 		 160 aa  253  7e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0866  transcriptional regulator, CarD family  78.75 
 
 		 160 aa  253  1.0000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.795809 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03770  transcriptional regulator, CarD family  80.38 
 
 		 160 aa  251  3e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0832449  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4040  CarD family transcriptional regulator  78.26 
 
 		 161 aa  250  6e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0601  transcriptional regulator, CarD family  76.25 
 
 		 162 aa  248  2e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.251005  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0078  CarD family transcriptional regulator  83.12 
 
 		 160 aa  248  3e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.805764 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8145  transcriptional regulator, CarD family  81.25 
 
 		 160 aa  239  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4262  transcription factor CarD  72.78 
 
 		 161 aa  238  2.9999999999999997e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.102192 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4692  CarD family transcriptional regulator  72.78 
 
 		 161 aa  238  2.9999999999999997e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.372756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0970  transcription factor CarD  70 
 
 		 162 aa  238  2.9999999999999997e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0421613  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0142  transcriptional regulator, CarD family  71.7 
 
 		 161 aa  231  3e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.432895  normal  0.208842 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0598  CarD-like protein  60.51 
 
 		 198 aa  182  2.0000000000000003e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.80876 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0751  transcriptional_regulator  56.05 
 
 		 197 aa  170  6.999999999999999e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.024387  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0184  CarD family transcriptional regulator  50.32 
 
 		 158 aa  167  6e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000461905  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1901  transcriptional regulator, CarD family  53.46 
 
 		 159 aa  160  6e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.488949  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00900  transcriptional regulator, CarD family  46.79 
 
 		 176 aa  159  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  8.92061e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0185  CarD family transcriptional regulator  47.77 
 
 		 158 aa  155  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164199  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2489  CarD family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 158 aa  151  2.9999999999999998e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00883814  normal  0.0681247 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0164  transcriptional regulator, CarD family  44.94 
 
 		 161 aa  151  2.9999999999999998e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.475576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0259  transcriptional regulator, CarD family  45.86 
 
 		 158 aa  150  8e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000116082  normal  0.0229238 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2940  CarD family transcriptional regulator  41.4 
 
 		 158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0340  transcriptional regulator, CarD family  42.31 
 
 		 159 aa  144  7.0000000000000006e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.18012  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1687  transcriptional regulator, CarD family  45.62 
 
 		 171 aa  140  5e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.613225  normal  0.385121 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0399  transcriptional regulator, CarD family  46.54 
 
 		 159 aa  140  8e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00433509  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0392  transcriptional regulator, CarD family  42.68 
 
 		 158 aa  136  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000362697  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0173  transcriptional regulator, CarD family  38.85 
 
 		 159 aa  131  3.9999999999999996e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3388  CarD family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 159 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0553  CarD family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 186 aa  111  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.106892 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4857  CarD family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 164 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4851  transcriptional regulator, CarD family  33.33 
 
 		 164 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.906261  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4833  transcriptional regulator, CarD family  33.33 
 
 		 164 aa  111  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4447  CarD family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 164 aa  111  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.948938  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4465  CarD family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 164 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3655  CarD family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 159 aa  109  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000563805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1271  CarD family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 171 aa  107  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0355661  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2592  transcriptional regulator, CarD family  33.54 
 
 		 171 aa  107  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0112448  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2685  transcriptional regulator, CarD family  33.54 
 
 		 171 aa  107  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.000114953  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0104  putative transcriptional regulator  36.91 
 
 		 161 aa  106  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2498  CarD family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 171 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.860997  hitchhiker  0.00028149 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4522  transcriptional regulator, CarD family  36.48 
 
 		 162 aa  106  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.76792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0409  transcriptional regulator, CarD family  34.62 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4827  transcriptional regulator, CarD family  33.97 
 
 		 164 aa  104  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3335  CarD family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 158 aa  103  9e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.512684  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4546  CarD family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3676  CarD family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 158 aa  101  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1560  transcriptional regulator, CarD family  32.24 
 
 		 158 aa  100  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.879343  normal  0.22005 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1245  transcriptional regulator, CarD family  33.75 
 
 		 168 aa  99.4  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000622315  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2821  CarD family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 188 aa  99.4  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000911518  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1065  CarD family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 153 aa  99  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0695746  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3756  transcriptional regulator, CarD family  32.24 
 
 		 158 aa  99.4  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3658  transcriptional regulator, CarD family  32.24 
 
 		 158 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3438  CarD family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 158 aa  98.6  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.270269  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3350  CarD family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 158 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3708  CarD family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 158 aa  98.6  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.672649  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2124  transcriptional regulator, CarD family  36.08 
 
 		 161 aa  98.6  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0696719  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4967  CarD family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 148 aa  97.1  8e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0352786  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4611  CarD family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 153 aa  97.1  9e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3401  CarD family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 158 aa  96.7  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3681  transcriptional regulator, CarD family  31.58 
 
 		 158 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0786327  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2880  CarD family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 158 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2164  transcriptional regulator, CarD family  30.26 
 
 		 153 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3244  CarD family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 155 aa  90.9  6e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0247  CarD family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 175 aa  84.7  5e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.246568 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0124  CarD family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 174 aa  82.8  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3537  CarD family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 172 aa  81.3  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.92305  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3201  transcriptional regulator, CarD family  31.87 
 
 		 174 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0676  transcriptional regulator, CarD family  32.5 
 
 		 176 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000000026469  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2290  transcriptional regulator, putative  28.29 
 
 		 208 aa  78.6  0.00000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0842  transcriptional regulator, CarD family  30.63 
 
 		 174 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000502927  normal  0.471539 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0786  transcriptional regulator  31.65 
 
 		 170 aa  77.8  0.00000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.000100342  normal  0.0526342 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1561  CarD family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 171 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0294353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0490  transcriptional regulator, CarD family  30.43 
 
 		 171 aa  77  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00257809 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0548  CarD family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 365 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.300109  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2296  CarD family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 169 aa  76.3  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0000229013  normal  0.715869 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3308  CarD family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 172 aa  75.1  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000178714  normal  0.0560372 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>