151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0104 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0104  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 161 aa  324  3e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1271  CarD family transcriptional regulator  52.53 
 
 		 171 aa  171  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0355661  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2592  transcriptional regulator, CarD family  52.53 
 
 		 171 aa  171  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0112448  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2685  transcriptional regulator, CarD family  52.53 
 
 		 171 aa  171  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.000114953  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2498  CarD family transcriptional regulator  51.27 
 
 		 171 aa  165  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.860997  hitchhiker  0.00028149 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3655  CarD family transcriptional regulator  51.66 
 
 		 159 aa  164  5e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000563805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2821  CarD family transcriptional regulator  42.14 
 
 		 188 aa  154  6e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000911518  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0185  CarD family transcriptional regulator  47.2 
 
 		 158 aa  147  4e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164199  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4522  transcriptional regulator, CarD family  43.4 
 
 		 162 aa  141  4e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.76792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0184  CarD family transcriptional regulator  45.34 
 
 		 158 aa  141  4e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000461905  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0842  transcriptional regulator, CarD family  44.38 
 
 		 174 aa  140  6e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000502927  normal  0.471539 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2489  CarD family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 158 aa  136  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00883814  normal  0.0681247 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0164  transcriptional regulator, CarD family  44.44 
 
 		 161 aa  135  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.475576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1561  CarD family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 171 aa  134  5e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0294353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0259  transcriptional regulator, CarD family  45.06 
 
 		 158 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000116082  normal  0.0229238 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2129  CarD family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 171 aa  131  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000417327  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0490  transcriptional regulator, CarD family  41.25 
 
 		 171 aa  130  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00257809 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00900  transcriptional regulator, CarD family  40 
 
 		 176 aa  127  4.0000000000000003e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  8.92061e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0340  transcriptional regulator, CarD family  38.75 
 
 		 159 aa  127  7.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.18012  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0676  transcriptional regulator, CarD family  38.51 
 
 		 176 aa  125  3e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000000026469  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2940  CarD family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 158 aa  124  7e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35090  transcriptional regulator, CarD family  38.67 
 
 		 163 aa  121  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.86286 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1455  transcriptional regulator, CarD family  42.25 
 
 		 171 aa  120  9e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000871292  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0392  transcriptional regulator, CarD family  37.5 
 
 		 158 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000362697  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0364  transcriptional regulator, CarD family  38 
 
 		 162 aa  118  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.376987  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03720  transcriptional regulator, CarD family  37.33 
 
 		 160 aa  117  7e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0601  transcriptional regulator, CarD family  38.51 
 
 		 162 aa  116  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.251005  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1444  CarD family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 162 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.250117 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0651  transcriptional regulator, CarD family  37.58 
 
 		 160 aa  116  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.058243  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4740  CarD family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4826  CarD family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.652741  normal  0.999363 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5340  CarD family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5126  CarD family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.593452 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0501  CarD family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 163 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13616  transcription factor  36 
 
 		 162 aa  114  5e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.392977 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09270  transcriptional regulator, CarD family  38.78 
 
 		 160 aa  114  6e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4255  CarD family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4040  CarD family transcriptional regulator  38.99 
 
 		 161 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0362  CarD family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0755625  hitchhiker  0.00187432 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0399  transcriptional regulator, CarD family  42.14 
 
 		 159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00433509  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0124  CarD family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 174 aa  112  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0278  transcription factor CarD  38.82 
 
 		 432 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.197745 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0173  transcriptional regulator, CarD family  35 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0898  transcriptional regulator, CarD family  37.34 
 
 		 160 aa  112  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00538334 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2880  CarD family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 158 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2907  CarD family transcriptional regulator  38.12 
 
 		 160 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0970  transcription factor CarD  34.44 
 
 		 162 aa  111  4.0000000000000004e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0421613  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0703  transcriptional regulator, CarD family  38.75 
 
 		 160 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0540347  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0726  CarD family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 160 aa  111  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0852  transcriptional regulator, CarD family  37.91 
 
 		 160 aa  111  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0489  transcriptional regulator, CarD family  37.82 
 
 		 278 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0786  transcriptional regulator  38.71 
 
 		 170 aa  111  5e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.000100342  normal  0.0526342 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7543  CarD family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 278 aa  110  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.330727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2164  transcriptional regulator, CarD family  37.09 
 
 		 153 aa  110  6e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0412  transcription factor CarD  36.77 
 
 		 283 aa  110  8.000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.595911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0078  CarD family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 160 aa  110  8.000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.805764 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3388  CarD family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 159 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4319  transcriptional regulator, CarD family  38.75 
 
 		 160 aa  110  9e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4857  CarD family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 164 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0963  CarD family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 160 aa  109  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1065  CarD family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 153 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0695746  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1901  transcriptional regulator, CarD family  38.73 
 
 		 159 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.488949  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0773  transcriptional regulator, CarD family  37.97 
 
 		 160 aa  110  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.164526  normal  0.216229 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4851  transcriptional regulator, CarD family  35.8 
 
 		 164 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.906261  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0866  transcriptional regulator, CarD family  35.81 
 
 		 160 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.795809 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4447  CarD family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 164 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.948938  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4833  transcriptional regulator, CarD family  35.8 
 
 		 164 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4262  transcription factor CarD  34.59 
 
 		 161 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.102192 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4692  CarD family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 161 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.372756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4805  CarD family transcriptional regulator  40 
 
 		 197 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0268969  hitchhiker  0.000256244 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4465  CarD family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 164 aa  108  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2425  CarD family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 169 aa  108  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.0000259686  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0142  transcriptional regulator, CarD family  36.18 
 
 		 161 aa  108  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.432895  normal  0.208842 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1089  CarD family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 169 aa  108  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0349811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1557  CarD family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 169 aa  108  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0486007  normal  0.568097 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3676  CarD family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 158 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4337  transcriptional regulator, CarD family  39.29 
 
 		 198 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139184  normal  0.529688 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1718  transcriptional regulator, CarD family  39.29 
 
 		 197 aa  107  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0551  CarD family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 429 aa  107  5e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0207185  normal  0.0758016 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1687  transcriptional regulator, CarD family  35.92 
 
 		 171 aa  107  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.613225  normal  0.385121 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3537  CarD family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 172 aa  107  7.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.92305  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0576  CarD family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 169 aa  107  9.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  unclonable  0.0000000000504519  unclonable  0.0000000218406 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1825  CarD family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 169 aa  107  9.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  unclonable  0.00000000000495809  normal  0.361852 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0247  CarD family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 175 aa  106  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.246568 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4143  transcriptional regulator, CarD family  36.54 
 
 		 190 aa  106  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239678  normal  0.0810654 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31820  transcriptional regulator, CarD family  36.91 
 
 		 160 aa  106  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2077  transcriptional regulator, CarD family  36.91 
 
 		 161 aa  106  1e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.90671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3880  transcription factor CarD  38.57 
 
 		 196 aa  106  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.260556  normal  0.0799721 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3335  CarD family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 158 aa  106  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.512684  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3814  transcriptional regulator, CarD family  36.54 
 
 		 190 aa  106  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4190  transcriptional regulator, CarD family  38.57 
 
 		 196 aa  106  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.627659  normal  0.224383 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3438  CarD family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 158 aa  105  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.270269  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3401  CarD family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 158 aa  105  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3350  CarD family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 158 aa  105  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0548  CarD family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 365 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.300109  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3708  CarD family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 201 aa  105  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.378672 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3681  transcriptional regulator, CarD family  36.42 
 
 		 158 aa  105  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0786327  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2959  transcriptional regulator, CarD family  36.08 
 
 		 160 aa  106  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03770  transcriptional regulator, CarD family  35.22 
 
 		 160 aa  105  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0832449  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1560  transcriptional regulator, CarD family  35.76 
 
 		 158 aa  106  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.879343  normal  0.22005 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>