147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3201 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3201  transcriptional regulator, CarD family  100 
 
 		 174 aa  352  2e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2124  transcriptional regulator, CarD family  55.9 
 
 		 161 aa  188  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0696719  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0184  CarD family transcriptional regulator  43.31 
 
 		 158 aa  130  1.0000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000461905  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3244  CarD family transcriptional regulator  45.06 
 
 		 155 aa  129  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0185  CarD family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 158 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164199  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0392  transcriptional regulator, CarD family  40.62 
 
 		 158 aa  125  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000362697  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0259  transcriptional regulator, CarD family  42.14 
 
 		 158 aa  124  6e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000116082  normal  0.0229238 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4857  CarD family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4851  transcriptional regulator, CarD family  37.89 
 
 		 164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.906261  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2489  CarD family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 158 aa  119  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00883814  normal  0.0681247 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4465  CarD family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 164 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4447  CarD family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 164 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.948938  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00900  transcriptional regulator, CarD family  38.89 
 
 		 176 aa  116  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  8.92061e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4833  transcriptional regulator, CarD family  37.27 
 
 		 164 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3388  CarD family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 159 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0164  transcriptional regulator, CarD family  39.38 
 
 		 161 aa  114  6.9999999999999995e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.475576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0340  transcriptional regulator, CarD family  40.54 
 
 		 159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.18012  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4546  CarD family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2940  CarD family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 158 aa  108  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1065  CarD family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 153 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0695746  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3335  CarD family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 158 aa  106  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.512684  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0409  transcriptional regulator, CarD family  38.27 
 
 		 164 aa  106  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3676  CarD family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 158 aa  104  6e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4967  CarD family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 148 aa  103  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0352786  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0173  transcriptional regulator, CarD family  35 
 
 		 159 aa  103  1e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4827  transcriptional regulator, CarD family  37.65 
 
 		 164 aa  103  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3438  CarD family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 158 aa  102  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.270269  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4611  CarD family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 153 aa  102  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3350  CarD family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 158 aa  102  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3708  CarD family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 158 aa  102  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.672649  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1560  transcriptional regulator, CarD family  35.37 
 
 		 158 aa  102  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.879343  normal  0.22005 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3658  transcriptional regulator, CarD family  36.73 
 
 		 158 aa  102  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3401  CarD family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 158 aa  101  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3681  transcriptional regulator, CarD family  36.73 
 
 		 158 aa  101  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0786327  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3756  transcriptional regulator, CarD family  35.37 
 
 		 158 aa  102  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0399  transcriptional regulator, CarD family  40.76 
 
 		 159 aa  101  6e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00433509  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2164  transcriptional regulator, CarD family  35.37 
 
 		 153 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2880  CarD family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 158 aa  97.8  8e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4740  CarD family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 162 aa  92  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4826  CarD family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 162 aa  92  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.652741  normal  0.999363 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5126  CarD family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 162 aa  92  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.593452 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1901  transcriptional regulator, CarD family  34.44 
 
 		 159 aa  91.7  5e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.488949  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35090  transcriptional regulator, CarD family  31.71 
 
 		 163 aa  89.7  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.86286 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0364  transcriptional regulator, CarD family  32.32 
 
 		 162 aa  89.7  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.376987  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5340  CarD family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 162 aa  89.4  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1444  CarD family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 162 aa  89.4  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.250117 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4319  transcriptional regulator, CarD family  31.68 
 
 		 160 aa  88.2  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13616  transcription factor  29.88 
 
 		 162 aa  88.2  6e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.392977 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1687  transcriptional regulator, CarD family  33.33 
 
 		 171 aa  88.2  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.613225  normal  0.385121 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2907  CarD family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 160 aa  87  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0104  putative transcriptional regulator  31.01 
 
 		 161 aa  86.3  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0601  transcriptional regulator, CarD family  30.49 
 
 		 162 aa  86.3  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.251005  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0501  CarD family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 163 aa  84.7  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4255  CarD family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 160 aa  84.7  6e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0362  CarD family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 160 aa  84.7  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0755625  hitchhiker  0.00187432 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0963  CarD family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 160 aa  84.7  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1245  transcriptional regulator, CarD family  29.88 
 
 		 168 aa  84.3  7e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000622315  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0651  transcriptional regulator, CarD family  31.87 
 
 		 160 aa  83.6  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.058243  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3655  CarD family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000563805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0703  transcriptional regulator, CarD family  31.87 
 
 		 160 aa  83.2  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0540347  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0866  transcriptional regulator, CarD family  31.68 
 
 		 160 aa  83.2  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.795809 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0970  transcription factor CarD  31.9 
 
 		 162 aa  82.8  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0421613  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1271  CarD family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 171 aa  80.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0355661  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2077  transcriptional regulator, CarD family  31.1 
 
 		 161 aa  80.1  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.90671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2592  transcriptional regulator, CarD family  31.87 
 
 		 171 aa  80.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0112448  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4522  transcriptional regulator, CarD family  31.91 
 
 		 162 aa  80.5  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.76792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2685  transcriptional regulator, CarD family  31.87 
 
 		 171 aa  80.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.000114953  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03720  transcriptional regulator, CarD family  28.75 
 
 		 160 aa  79.3  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0142  transcriptional regulator, CarD family  27.61 
 
 		 161 aa  80.1  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.432895  normal  0.208842 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31820  transcriptional regulator, CarD family  31.87 
 
 		 160 aa  79.7  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2959  transcriptional regulator, CarD family  31.06 
 
 		 160 aa  79.3  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4143  transcriptional regulator, CarD family  26.54 
 
 		 190 aa  78.2  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239678  normal  0.0810654 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0852  transcriptional regulator, CarD family  30.67 
 
 		 160 aa  78.2  0.00000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0726  CarD family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 160 aa  78.2  0.00000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0773  transcriptional regulator, CarD family  30.63 
 
 		 160 aa  78.2  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.164526  normal  0.216229 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2498  CarD family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 171 aa  78.2  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.860997  hitchhiker  0.00028149 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3814  transcriptional regulator, CarD family  26.54 
 
 		 190 aa  78.2  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4262  transcription factor CarD  29.94 
 
 		 161 aa  77.8  0.00000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.102192 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4692  CarD family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 161 aa  77.8  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.372756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4112  CarD family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 170 aa  77.8  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00258914  normal  0.616295 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0898  transcriptional regulator, CarD family  29.81 
 
 		 160 aa  77.4  0.00000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00538334 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3112  CarD family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 189 aa  77  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.0000522164  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0663  transcriptional regulator, CarD family  32.62 
 
 		 160 aa  76.3  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.471723  hitchhiker  0.000789071 
 
 
-
 
NC_004310  BR1766  transcriptional regulator, putative  28.14 
 
 		 191 aa  75.1  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.000100794  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3379  CarD family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 190 aa  75.5  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000818177  n/a   
 
 
 
NC_008699  Noca_4040  CarD family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 161 aa  75.5  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1702  putative transcriptional regulator  28.14 
 
 		 191 aa  75.1  0.0000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000176532  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03770  transcriptional regulator, CarD family  29.81 
 
 		 160 aa  74.7  0.0000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0832449  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4352  transcriptional regulator CarD family  27.54 
 
 		 223 aa  74.7  0.0000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1134  CarD family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 193 aa  74.3  0.0000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000250032  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09270  transcriptional regulator, CarD family  28.57 
 
 		 160 aa  74.7  0.0000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0078  CarD family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 160 aa  73.9  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.805764 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2296  CarD family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 169 aa  73.2  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0000229013  normal  0.715869 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1561  CarD family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 171 aa  73.2  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0294353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0553  CarD family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 186 aa  72.4  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.106892 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0576  CarD family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 169 aa  72.4  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  unclonable  0.0000000000504519  unclonable  0.0000000218406 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2425  CarD family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 169 aa  72  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.0000259686  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1089  CarD family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 169 aa  72  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0349811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1557  CarD family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 169 aa  72  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0486007  normal  0.568097 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2821  CarD family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 188 aa  72  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000911518  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>