More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2140 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2140  response regulator receiver  100 
 
 		 218 aa  434  1e-121  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.95288  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2950  LuxR response regulator receiver  63.08 
 
 		 221 aa  276  2e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22850  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  63.81 
 
 		 239 aa  271  5.000000000000001e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.711047 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2003  two component transcriptional regulator, LuxR family  64.73 
 
 		 219 aa  266  2e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.183245  hitchhiker  0.00373502 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4749  two component transcriptional regulator, LuxR family  62.8 
 
 		 223 aa  264  8e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3524  response regulator receiver protein  66.16 
 
 		 214 aa  264  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0390864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1910  two component transcriptional regulator, LuxR family  63.11 
 
 		 218 aa  263  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13154  two component system transcriptional regulatory protein DevR  61.79 
 
 		 217 aa  261  4e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1427  two component LuxR family transcriptional regulator  62.62 
 
 		 212 aa  259  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3035  LuxR response regulator receiver  65.87 
 
 		 223 aa  258  6e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3847  two component LuxR family transcriptional regulator  61.72 
 
 		 216 aa  256  1e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.118356  decreased coverage  0.00872558 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3505  LuxR family two component transcriptional regulator  63.13 
 
 		 213 aa  256  2e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.345096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4126  two component LuxR family transcriptional regulator  61.32 
 
 		 220 aa  254  6e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3097  two component transcriptional regulator, LuxR family  60.56 
 
 		 222 aa  253  2.0000000000000002e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.472018  normal  0.507317 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4201  two component LuxR family transcriptional regulator  62.14 
 
 		 215 aa  252  3e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4357  two component LuxR family transcriptional regulator  62.14 
 
 		 215 aa  252  3e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.171113 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0518  two component LuxR family transcriptional regulator  62.67 
 
 		 225 aa  251  5.000000000000001e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.665179 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0500  two component transcriptional regulator, LuxR family  60.91 
 
 		 226 aa  249  2e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1528  two component LuxR family transcriptional regulator  58.74 
 
 		 212 aa  243  9.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.212037  hitchhiker  0.000165031 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0190  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.77 
 
 		 219 aa  242  1.9999999999999999e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.146862  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1577  response regulator receiver  58.74 
 
 		 212 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.967001 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2449  two component LuxR family transcriptional regulator  58.37 
 
 		 211 aa  243  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0945  response regulator receiver  58.74 
 
 		 216 aa  241  3.9999999999999997e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0407172  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2258  two component LuxR family transcriptional regulator  58.17 
 
 		 224 aa  241  7e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.124896  normal  0.0124728 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4738  two component transcriptional regulator, LuxR family  60 
 
 		 233 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1076  two component LuxR family transcriptional regulator  59.9 
 
 		 228 aa  237  1e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1092  two component LuxR family transcriptional regulator  59.9 
 
 		 228 aa  237  1e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.123414  normal  0.110897 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1103  two component LuxR family transcriptional regulator  59.9 
 
 		 228 aa  237  1e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.191898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4979  two component LuxR family transcriptional regulator  59.71 
 
 		 231 aa  235  3e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.889239  normal  0.507767 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1487  two component LuxR family transcriptional regulator  58.25 
 
 		 231 aa  232  3e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0122618  normal  0.753042 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1446  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.98 
 
 		 223 aa  231  7.000000000000001e-60  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1971  two component LuxR family transcriptional regulator  57.07 
 
 		 216 aa  230  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.356635  normal  0.773651 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4145  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.89 
 
 		 216 aa  229  4e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0094  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.34 
 
 		 233 aa  226  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0277195 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2548  two component LuxR family transcriptional regulator  61.32 
 
 		 216 aa  224  7e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.971783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3253  two component LuxR family transcriptional regulator  56.31 
 
 		 213 aa  224  8e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0992  regulatory protein, LuxR  54.85 
 
 		 218 aa  222  4e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.850793  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0097  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.12 
 
 		 209 aa  221  4.9999999999999996e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142871  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4062  two component LuxR family transcriptional regulator  53.08 
 
 		 216 aa  215  5e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0448793  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6098  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.81 
 
 		 218 aa  215  5e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6933  two component LuxR family transcriptional regulator  54.15 
 
 		 244 aa  214  7e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.322421 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01100  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  52.66 
 
 		 214 aa  213  1.9999999999999998e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4820  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.28 
 
 		 218 aa  210  1e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2136  two component LuxR family transcriptional regulator  54.46 
 
 		 254 aa  210  2e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0553154  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2073  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.21 
 
 		 226 aa  206  2e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000764485 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1611  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.23 
 
 		 208 aa  172  2.9999999999999996e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.548364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.1 
 
 		 217 aa  160  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 219 aa  158  5e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5474  two component LuxR family transcriptional regulator  41.63 
 
 		 212 aa  155  4e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.344108  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0647  two component LuxR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 225 aa  154  7e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5788  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.01 
 
 		 214 aa  154  9e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.785726 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3654  two component LuxR family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 221 aa  154  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000210563  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  39.72 
 
 		 234 aa  154  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0765  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.52 
 
 		 222 aa  153  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2290  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.69 
 
 		 208 aa  152  4e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00802134  hitchhiker  0.000628596 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2087  two component LuxR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 213 aa  152  5e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0358431  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1198  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.2 
 
 		 225 aa  151  7e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1659  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.65 
 
 		 207 aa  151  8.999999999999999e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.319135  normal  0.0403017 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2171  two component LuxR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 218 aa  150  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0762379  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  37.8 
 
 		 215 aa  149  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  37.8 
 
 		 215 aa  149  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  38.28 
 
 		 215 aa  149  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  38.28 
 
 		 215 aa  149  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  38.28 
 
 		 215 aa  149  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  38.28 
 
 		 215 aa  149  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1104  two component LuxR family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 218 aa  149  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.348687  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3459  two component LuxR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 212 aa  149  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.775478  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  38.28 
 
 		 215 aa  149  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  37.8 
 
 		 215 aa  149  4e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.35 
 
 		 253 aa  149  4e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 250 aa  149  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  39.15 
 
 		 242 aa  148  5e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  40.95 
 
 		 227 aa  148  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0692  two component transcriptional regulator, LuxR family  37 
 
 		 213 aa  148  7e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3078  DNA-binding response regulator, LuxR family  35.61 
 
 		 213 aa  148  7e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000185138 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11330  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  43.5 
 
 		 224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0103975 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2293  LuxR family DNA-binding response regulator  35.61 
 
 		 211 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0801  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.51 
 
 		 227 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 237 aa  146  3e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1401  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.52 
 
 		 217 aa  146  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1020  response regulator receiver  39.61 
 
 		 218 aa  145  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.648692  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2375  DNA-binding response regulator, LuxR family  36.1 
 
 		 209 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248491  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  39.72 
 
 		 234 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2245  DNA-binding response regulator, LuxR family  35.12 
 
 		 213 aa  145  6e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2109  LuxR family DNA-binding response regulator  35.61 
 
 		 209 aa  144  8.000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2048  response regulator  35.61 
 
 		 209 aa  144  8.000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.102554  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2046  response regulator  35.61 
 
 		 209 aa  144  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2265  LuxR family DNA-binding response regulator  35.61 
 
 		 209 aa  144  8.000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.201191  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0973  two component LuxR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 216 aa  144  8.000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.255067  normal  0.404517 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2290  DNA-binding response regulator, LuxR family  35.61 
 
 		 209 aa  144  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000736213 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.53 
 
 		 225 aa  144  9e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 219 aa  144  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 231 aa  144  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0951  LuxR family two component transcriptional regulator  42.38 
 
 		 221 aa  144  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392411  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  36.84 
 
 		 215 aa  144  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1769  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.86 
 
 		 219 aa  143  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.221401  normal  0.0578747 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1701  response regulator receiver protein  42.93 
 
 		 224 aa  143  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0169479 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3262  two component LuxR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 222 aa  143  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.764026 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2872  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.1 
 
 		 218 aa  142  3e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>