290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1281 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1281  FAD-linked oxidoreductase  100 
 
 
439 aa  884    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.951079  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1521  FAD-linked oxidoreductase  54.29 
 
 
445 aa  464  1e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0567  FAD-linked oxidoreductase  49.31 
 
 
435 aa  399  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00510  FAD-linked oxidoreductase  48.74 
 
 
452 aa  367  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.740797  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4407  FAD-linked oxidoreductase  46.7 
 
 
437 aa  361  2e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.311331  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1899  FAD-linked oxidoreductase  45.87 
 
 
438 aa  360  3e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0587039  decreased coverage  0.00000156043 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1688  FAD-linked oxidoreductase  44.21 
 
 
441 aa  358  9e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00023644  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4026  FAD-linked oxidoreductase  45.24 
 
 
437 aa  355  1e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.93709 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7369  FAD-linked oxidoreductase  44.16 
 
 
434 aa  352  8.999999999999999e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0346  FAD-linked oxidoreductase  46.9 
 
 
473 aa  351  1e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18488  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1946  FAD-linked oxidoreductase  44.39 
 
 
433 aa  348  8e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0668  FAD-linked oxidoreductase  46.71 
 
 
447 aa  346  5e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.493433  hitchhiker  0.000925445 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2890  FAD-linked oxidoreductase  45.54 
 
 
432 aa  338  9e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.314064 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2304  FAD-linked oxidoreductase  41.49 
 
 
427 aa  327  3e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.613006  normal  0.539077 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31780  FAD-linked oxidoreductase  42.23 
 
 
486 aa  322  6e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546471  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0030  FAD-linked oxidoreductase  43.41 
 
 
425 aa  317  3e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6780  L-gulonolactone oxidase  42.18 
 
 
438 aa  317  3e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13140  FAD-linked oxidoreductase  40.6 
 
 
436 aa  311  1e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.828349  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4703  FAD-linked oxidoreductase  41.42 
 
 
437 aa  307  2.0000000000000002e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.553428 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11799  oxidoreductase  39.53 
 
 
428 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.983221  hitchhiker  0.000835629 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0735  oxidoreductase, FAD-binding  35.15 
 
 
437 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70563e-29 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0646  oxidoreductase, FAD-binding  34.92 
 
 
437 aa  302  7.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0680  FAD-binding oxidoreductase  34.92 
 
 
437 aa  302  7.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0591  FAD-dependent oxidoreductase  34.69 
 
 
437 aa  302  1e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0590  FAD-dependent oxidoreductase  34.69 
 
 
437 aa  301  2e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0381826  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0747  oxidoreductase, FAD-binding  34.92 
 
 
437 aa  300  3e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0807  oxidoreductase, FAD-binding  34.01 
 
 
437 aa  299  7e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.427447  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0710  oxidoreductase, FAD-binding  34.4 
 
 
438 aa  298  1e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248836  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4626  flavin-dependent dehydrogenase  34.8 
 
 
434 aa  298  1e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.278629  hitchhiker  0.000000015326 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2955  FAD-linked oxidoreductase  43.41 
 
 
475 aa  296  4e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0594  FAD-linked oxidoreductase  34.24 
 
 
437 aa  296  5e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0570  FAD-linked oxidoreductase  34.45 
 
 
437 aa  291  2e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3008  FAD-linked oxidoreductase  40.65 
 
 
470 aa  277  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562245  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1084  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.11 
 
 
445 aa  263  4e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.160228 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6103  putative oxidoreductase  34.76 
 
 
464 aa  231  3e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.46461  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1740  FAD-linked oxidoreductase  33.94 
 
 
460 aa  228  1e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.877746  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2494  FAD-linked oxidoreductase  34.02 
 
 
464 aa  228  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00941267  normal  0.521213 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70330  putative oxidoreductase  34.02 
 
 
442 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0094  FAD-linked oxidoreductase  32.02 
 
 
469 aa  212  9e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2680  FAD-linked oxidoreductase  31.51 
 
 
424 aa  206  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.845872  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2981  FAD-linked oxidoreductase  34.15 
 
 
440 aa  202  7e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.532365 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5223  oxidoreductase  29.19 
 
 
429 aa  202  9e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0322  FAD-linked oxidoreductase  30.37 
 
 
412 aa  199  6e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.34325 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3910  FAD-linked oxidoreductase  33.1 
 
 
411 aa  194  3e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3174  FAD-linked oxidoreductase  30.65 
 
 
417 aa  182  1e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.361801 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01640  D-arabinono-1,4-lactone oxidase, putative  28.28 
 
 
478 aa  179  1e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3584  FAD-linked oxidoreductase  28.67 
 
 
423 aa  178  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4040  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.02 
 
 
409 aa  176  7e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7202  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1716  FAD-linked oxidoreductase  33.1 
 
 
466 aa  171  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0745326  normal  0.233411 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5198  FAD-linked oxidoreductase  28.34 
 
 
415 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2756  FAD-linked oxidoreductase  28.57 
 
 
415 aa  161  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3361  FAD-linked oxidoreductase  27.4 
 
 
415 aa  159  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.935953  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4010  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.45 
 
 
449 aa  151  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2050  FAD-linked oxidoreductase  26.64 
 
 
439 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614884  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2565  FAD linked oxidase domain protein  27.48 
 
 
421 aa  144  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14850  D-arabinono-1,4-lactone oxidase  35.07 
 
 
246 aa  140  4.999999999999999e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00156556  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0055  FAD linked oxidase domain protein  26.7 
 
 
418 aa  131  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00836  D-Arabinono-1,4-lactone oxidase (Eurofung)  25.83 
 
 
574 aa  129  1.0000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.764968  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29560  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  29.95 
 
 
429 aa  127  3e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23292  L-galactono-1,4-lactone dehydrogenase  29.51 
 
 
572 aa  125  1e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.260276  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0723  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.41 
 
 
417 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.608067  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3313  FAD linked oxidase domain protein  24.23 
 
 
437 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88335  D-arabinono-1,4-lactone oxidase (ALO) (L-galactono-gamma-lactone oxidase)  25.86 
 
 
556 aa  110  4.0000000000000004e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.766269  normal  0.0733119 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3634  FAD linked oxidase domain protein  26.74 
 
 
430 aa  105  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.263077  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2461  FAD linked oxidase domain protein  27.45 
 
 
446 aa  103  8e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0132969 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6373  FAD linked oxidase domain protein  25.54 
 
 
448 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_1854  predicted protein  27.65 
 
 
483 aa  101  3e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.438498  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4763  FAD linked oxidase domain protein  26.32 
 
 
418 aa  96.3  9e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.431608 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1977  FAD linked oxidase domain protein  27.58 
 
 
424 aa  92  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.265548  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1781  FAD/FMN-containing dehydrogenase  21.47 
 
 
642 aa  90.5  6e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.926813  normal  0.0106686 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2879  FAD linked oxidase domain protein  32.08 
 
 
421 aa  79  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00684532 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2301  FAD linked oxidase domain protein  30.29 
 
 
413 aa  77  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000142311  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0930  FAD linked oxidase domain protein  30 
 
 
423 aa  76.3  0.0000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35760  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  41 
 
 
462 aa  73.6  0.000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.744016  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0598  FAD linked oxidase domain-containing protein  19.6 
 
 
504 aa  73.2  0.000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.7417 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1732  FAD linked oxidase domain protein  20.18 
 
 
475 aa  72.4  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2313  sorbitol oxidase  29.61 
 
 
427 aa  68.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0164  FAD linked oxidase domain-containing protein  19.26 
 
 
490 aa  65.1  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2940  FAD linked oxidase domain protein  34.25 
 
 
1055 aa  63.5  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0223  oxidoreductase, FAD-binding  19.56 
 
 
478 aa  63.2  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.337071  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0270  FAD linked oxidase domain protein  33.69 
 
 
455 aa  62.8  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.865067 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5285  FAD linked oxidase domain protein  25.25 
 
 
366 aa  62  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.288656  normal  0.274846 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0199  oxidoreductase, FAD-binding  18.94 
 
 
468 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.411918  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2375  FAD linked oxidase-like protein  31.39 
 
 
952 aa  60.8  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0180  oxidoreductase, FAD-binding  19.34 
 
 
478 aa  60.5  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0199  oxidoreductase, FAD-binding  19.34 
 
 
478 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0178  FAD-binding oxidoreductase  19.34 
 
 
471 aa  60.5  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.394744  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0203  oxidoreductase, FAD-binding  20.56 
 
 
478 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6081  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.58 
 
 
1023 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3539  FAD/FMN-containing dehydrogenases-like protein  23.02 
 
 
761 aa  59.7  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.709079 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5122  oxidoreductase, FAD-binding  19.43 
 
 
478 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.874515  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4954  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.07 
 
 
462 aa  58.5  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209411  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2774  alkylglycerone-phosphate synthase  33.33 
 
 
521 aa  58.5  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.757745  hitchhiker  0.000882641 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0949  hypothetical protein  24.02 
 
 
595 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0672841  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4288  hypothetical protein  47.17 
 
 
69 aa  58.2  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0353708 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2666  glycolate oxidase FAD-linked subunit oxidoreductase  29.6 
 
 
497 aa  57.4  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.530486  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0170  oxidoreductase, FAD-binding  19.35 
 
 
478 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1894  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.98 
 
 
500 aa  57.4  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.140191 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0167  oxidoreductase, FAD-binding  18.9 
 
 
471 aa  56.6  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.395629  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6532  FAD linked oxidase domain protein  30.43 
 
 
463 aa  56.2  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>