More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1200 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1200  histidine kinase HAMP region domain protein  100 
 
 		 570 aa  1131    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.265792  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1395  putative adenylate/guanylate cyclase  40.56 
 
 		 536 aa  291  2e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.966002 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4881  putative adenylate/guanylate cyclase  40.65 
 
 		 528 aa  284  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0270875 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4795  adenylate/guanylate cyclase  40.65 
 
 		 528 aa  284  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5181  putative adenylate/guanylate cyclase  40.65 
 
 		 528 aa  284  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0517978 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5395  putative adenylate/guanylate cyclase  40.48 
 
 		 532 aa  282  1e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0939703 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4265  putative adenylate/guanylate cyclase  41.98 
 
 		 488 aa  281  2e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.426652 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3875  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  39.51 
 
 		 499 aa  281  2e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13674  transmembrane protein  41.27 
 
 		 549 aa  280  7e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0475504 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2183  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  42.47 
 
 		 539 aa  270  5.9999999999999995e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000625001  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2382  putative adenylate/guanylate cyclase  40.27 
 
 		 488 aa  267  4e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.627426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0577  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  41.12 
 
 		 504 aa  263  4.999999999999999e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4050  histidine kinase HAMP region domain protein  39.2 
 
 		 514 aa  263  8.999999999999999e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4184  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  42.41 
 
 		 524 aa  262  1e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.924655 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3816  putative adenylate/guanylate cyclase  40 
 
 		 486 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.206497 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3830  adenylate/guanylate cyclase  40 
 
 		 486 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3904  putative adenylate/guanylate cyclase  40 
 
 		 486 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0256204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2336  putative adenylate/guanylate cyclase  44.66 
 
 		 536 aa  260  4e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.469037 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11351  adenylate cyclase  38.48 
 
 		 567 aa  249  1e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.959564 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4309  putative adenylate/guanylate cyclase  39.29 
 
 		 536 aa  249  1e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68042 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3854  putative adenylate/guanylate cyclase  45.4 
 
 		 540 aa  246  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.296872  hitchhiker  0.00729431 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3868  adenylate/guanylate cyclase  45.4 
 
 		 540 aa  246  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0820885  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3942  putative adenylate/guanylate cyclase  45.4 
 
 		 540 aa  246  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0593664  normal  0.0915565 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0786  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  37.22 
 
 		 539 aa  244  3e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11350  adenylate cyclase  38.35 
 
 		 558 aa  244  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000457389  normal  0.631682 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11345  adenylate cyclase  37.32 
 
 		 541 aa  243  6e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0024164  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3760  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  36.03 
 
 		 522 aa  233  8.000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.244119  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01760  family 3 adenylate cyclase  38.11 
 
 		 494 aa  223  9e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.817284 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11346  adenylate cyclase  46.45 
 
 		 217 aa  167  5e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.306360000000001e-28  normal  0.760848 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5211  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  31.73 
 
 		 529 aa  149  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0078  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  37.11 
 
 		 585 aa  137  7.000000000000001e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0981996 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  32.08 
 
 		 641 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1986  adenylate cyclase, putative  29.35 
 
 		 636 aa  132  1.0000000000000001e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000955851  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  33.02 
 
 		 284 aa  128  3e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1583  adenylate/guanylate cyclase  33.94 
 
 		 483 aa  126  9e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000336338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4017  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.78 
 
 		 701 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5176  adenylate/guanylyl cyclase  33.78 
 
 		 717 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263029  normal  0.588904 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3665  adenylate/guanylate cyclase  35.32 
 
 		 439 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.125818  normal  0.715111 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  34.22 
 
 		 607 aa  115  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3461  adenylate/guanylate cyclase  39.33 
 
 		 459 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0672  hypothetical protein  29.34 
 
 		 487 aa  114  6e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  38.29 
 
 		 903 aa  113  8.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5302  putative adenylate cyclase  35.27 
 
 		 431 aa  111  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714229 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  26.49 
 
 		 483 aa  111  3e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  33.78 
 
 		 859 aa  112  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1795  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  34.86 
 
 		 440 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.000135307  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  26.12 
 
 		 483 aa  110  5e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  35.96 
 
 		 864 aa  110  5e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3177  adenylate/guanylate cyclase with GAF and PAS/PAC sensors  35.84 
 
 		 971 aa  110  6e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 		 858 aa  110  7.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2694  putative PAS/PAC sensor protein  36.74 
 
 		 969 aa  109  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0176534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2387  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  27.86 
 
 		 604 aa  110  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179199  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  32.46 
 
 		 1160 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  34.41 
 
 		 1093 aa  108  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4218  adenylate/guanylate cyclase  39.25 
 
 		 468 aa  108  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.459756 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  33.77 
 
 		 645 aa  108  4e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0671  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  32.18 
 
 		 500 aa  108  4e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0415363  normal  0.502054 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0671  putative adenylate/guanylate cyclase  29.78 
 
 		 593 aa  107  5e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  27.98 
 
 		 611 aa  107  8e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0034  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  31.34 
 
 		 758 aa  106  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000015313  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  32.99 
 
 		 746 aa  105  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2619  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.23 
 
 		 658 aa  105  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103266  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1638  putative adenylate/guanylate cyclase  33.76 
 
 		 515 aa  104  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.739692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  28.94 
 
 		 860 aa  103  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3884  adenylate/guanylate cyclase  32.23 
 
 		 667 aa  103  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2343  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  32.08 
 
 		 465 aa  102  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  29.09 
 
 		 861 aa  101  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  27.11 
 
 		 701 aa  101  4e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  31.05 
 
 		 741 aa  100  8e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4273  putative adenylate/guanylate cyclase  36.07 
 
 		 421 aa  99.8  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1844  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  33.59 
 
 		 725 aa  99.8  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.266709 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2386  adenylate/guanylate cyclase  33.18 
 
 		 681 aa  99.8  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6815  adenylate/guanylate cyclase  40.11 
 
 		 428 aa  99.8  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.741432 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  26.01 
 
 		 701 aa  98.6  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1704  hypothetical protein  27.23 
 
 		 758 aa  99  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.75 
 
 		 737 aa  99  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2161  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  34.46 
 
 		 1020 aa  99  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0428251  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5187  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  28.24 
 
 		 758 aa  99  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2802  adenylate/guanylate cyclase  28.31 
 
 		 702 aa  99  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.523853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  31.11 
 
 		 735 aa  98.6  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3462  putative adenylate/guanylate cyclase  30.29 
 
 		 651 aa  98.2  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1703  hypothetical protein  27.23 
 
 		 758 aa  97.8  4e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.68 
 
 		 672 aa  98.2  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0991  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.98 
 
 		 703 aa  97.8  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.358146  normal  0.0115754 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0231  putative adenylate/guanylate cyclase  32.28 
 
 		 675 aa  97.8  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0742762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  29.33 
 
 		 911 aa  97.8  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28331  guanylate cyclase  33.79 
 
 		 632 aa  97.4  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.345698 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.68 
 
 		 656 aa  97.4  7e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2253  adenylate cyclase  31.06 
 
 		 518 aa  97.1  8e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0171825 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0104  adenylate/guanylate cyclase  34 
 
 		 437 aa  96.3  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0668  putative adenylate/guanylate cyclase  29.29 
 
 		 701 aa  95.9  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00673986  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0353  adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 		 699 aa  95.9  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.213992 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  27.03 
 
 		 638 aa  95.9  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4565  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  27.75 
 
 		 761 aa  95.1  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.593943  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0559  adenylate/guanylate cyclase  31.17 
 
 		 523 aa  95.5  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.855978  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0411  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  26.44 
 
 		 694 aa  94.7  4e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0173822  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2195  putative adenylate/guanylate cyclase  33.18 
 
 		 641 aa  94.7  4e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.595097 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4571  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain protein  34.81 
 
 		 546 aa  94.4  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.226096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1110  adenylate/guanylate cyclase  32.22 
 
 		 348 aa  94.4  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0224811  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  27.31 
 
 		 614 aa  94.4  6e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>