More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0736 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0751  aminotransferase class V  98.6 
 
 		 356 aa  731    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000622725 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0736  aminotransferase class V  100 
 
 		 356 aa  738    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0866  alanine--glyoxylate transaminase  78.65 
 
 		 357 aa  608  1e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0177068  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3260  phosphoserine aminotransferase, putative  75.84 
 
 		 357 aa  564  1e-160  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0451268  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3173  aminotransferase, class V  75.28 
 
 		 357 aa  567  1e-160  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000995852  normal  0.606873 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3345  Alanine--glyoxylate transaminase  70.99 
 
 		 355 aa  543  1e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000754514  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2772  aminotransferase  64.59 
 
 		 358 aa  479  1e-134  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.22169e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3000  alanine--glyoxylate transaminase  53.35 
 
 		 362 aa  378  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123854 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0703  Alanine--glyoxylate transaminase  48.6 
 
 		 357 aa  367  1e-100  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0063  aminotransferase, class V  48.18 
 
 		 358 aa  363  2e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0060  aminotransferase, class V  47.9 
 
 		 358 aa  360  1e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.138135  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1420  aminotransferase class V  41.64 
 
 		 360 aa  293  2e-78  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1876  aminotransferase class V  38.03 
 
 		 373 aa  255  9e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.544025  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0059  aminotransferase class V  37.18 
 
 		 370 aa  249  6e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2626  Alanine--glyoxylate transaminase  36.62 
 
 		 375 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.506979  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1088  Alanine--glyoxylate transaminase  34.65 
 
 		 370 aa  237  2e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  37.76 
 
 		 382 aa  232  7.000000000000001e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2692  aminotransferase class V  35.49 
 
 		 370 aa  230  3e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.221383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  34.51 
 
 		 382 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  34.81 
 
 		 382 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  34.81 
 
 		 382 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1323  alanine--glyoxylate transaminase  36.05 
 
 		 387 aa  207  2e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2080  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  33.98 
 
 		 383 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00351015  normal  0.87954 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1351  aminotransferase class V  32.78 
 
 		 363 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0575  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  35.8 
 
 		 362 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  33.13 
 
 		 383 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00351  soluble hydrogenase small subunit  33.15 
 
 		 385 aa  199  7e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_002936  DET0600  soluble hydrogenase, tritium exchange subunit  35.8 
 
 		 362 aa  199  7.999999999999999e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00706485  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4341  aminotransferase class V  35.62 
 
 		 382 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.182025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  35.61 
 
 		 385 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_540  aminotransferase, class V  35.8 
 
 		 362 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0499245  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0008  serine--glyoxylate transaminase  32.34 
 
 		 383 aa  194  2e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0160251  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  32.96 
 
 		 382 aa  193  4e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  32.96 
 
 		 382 aa  193  4e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0945  Serine--pyruvate transaminase  32.64 
 
 		 386 aa  192  8e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0754728  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0019  Serine--glyoxylate transaminase  32.96 
 
 		 388 aa  191  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000322298  hitchhiker  0.00000185369 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3803  aminotransferase class V  31.93 
 
 		 384 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0011  aminotransferase, class V  34.82 
 
 		 384 aa  189  5e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000196245  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3167  Serine--glyoxylate transaminase  32.96 
 
 		 385 aa  189  5e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1361  soluble hydrogenase small subunit  30.9 
 
 		 384 aa  187  3e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00331  soluble hydrogenase small subunit  30.9 
 
 		 384 aa  187  3e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00341  soluble hydrogenase small subunit  32.49 
 
 		 387 aa  186  4e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2126  aminotransferase class V  32.74 
 
 		 386 aa  185  9e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000896436  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0044  soluble hydrogenase small subunit  32.68 
 
 		 382 aa  184  1.0000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1504  aminotransferase class V  30.88 
 
 		 379 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00341  soluble hydrogenase small subunit  31.28 
 
 		 387 aa  182  9.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0040  aminotransferase class V  32.12 
 
 		 385 aa  182  9.000000000000001e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0119169  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0040  soluble hydrogenase small subunit  32.68 
 
 		 397 aa  182  1e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11530  L-aspartate aminotransferase;phosphoserine aminotransferase  32.65 
 
 		 384 aa  181  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000426602  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0191  Serine--glyoxylate transaminase  31.48 
 
 		 382 aa  181  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.746637 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0836  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  33.15 
 
 		 400 aa  181  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.259424  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0514  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  30.81 
 
 		 380 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  34.21 
 
 		 384 aa  179  8e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00431  soluble hydrogenase small subunit  32.12 
 
 		 382 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2307  alanine--glyoxylate transaminase  31.74 
 
 		 360 aa  177  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2460  Serine--glyoxylate transaminase  31.87 
 
 		 379 aa  176  4e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0035  soluble hydrogenase small subunit  31.84 
 
 		 387 aa  176  7e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1188  aminotransferase class V  33.33 
 
 		 383 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.26379  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0257  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 382 aa  173  5e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2693  aminotransferase class V  32.44 
 
 		 381 aa  172  7.999999999999999e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00390195  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  33.33 
 
 		 384 aa  171  2e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2413  aminotransferase, class V  32.35 
 
 		 415 aa  171  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0849168 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0217  Serine--glyoxylate transaminase  30.88 
 
 		 379 aa  171  2e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0781  aminotransferase, class V  34.62 
 
 		 381 aa  171  2e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.329422  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0019  aminotransferase class V  31.59 
 
 		 404 aa  170  3e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3921  Serine--glyoxylate transaminase  32.85 
 
 		 396 aa  171  3e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00341  soluble hydrogenase small subunit  31.16 
 
 		 387 aa  169  6e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1547  aminotransferase class V  31.86 
 
 		 381 aa  169  6e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000755241 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2475  Serine--glyoxylate transaminase  31.81 
 
 		 377 aa  168  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1862  aminotransferase class V  31.04 
 
 		 401 aa  168  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0923  aminotransferase, class V  32.66 
 
 		 401 aa  168  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000440044  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4850  Alanine--glyoxylate transaminase  31.87 
 
 		 390 aa  167  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0155  Serine--glyoxylate transaminase  29.95 
 
 		 380 aa  167  2e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2300  Serine--glyoxylate transaminase  30.59 
 
 		 379 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000212673  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1731  Serine--pyruvate transaminase  29.97 
 
 		 381 aa  166  4e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.186952 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0103  class V aminotransferase  30.73 
 
 		 382 aa  166  5e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6959  Serine--glyoxylate transaminase  30.72 
 
 		 406 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3001  Serine--glyoxylate transaminase  31.01 
 
 		 406 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000231297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0602  Serine--glyoxylate transaminase  29.86 
 
 		 394 aa  163  3e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2753  aminotransferase, class V  30.43 
 
 		 406 aa  163  4.0000000000000004e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1714  aminotransferase class V  31.5 
 
 		 396 aa  162  6e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.280776 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3325  serine--glyoxylate aminotransferase  29.36 
 
 		 422 aa  162  8.000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0106  aminotransferase, class V  30.79 
 
 		 379 aa  162  9e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6552  Serine--glyoxylate transaminase  31.69 
 
 		 417 aa  161  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.323999 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0111  aminotransferase, class V  31.56 
 
 		 380 aa  162  1e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0104  aminotransferase class V  31.64 
 
 		 380 aa  162  1e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7112  aminotransferase class V  30.81 
 
 		 417 aa  160  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2994  alanine-glyoxylate aminotransferase  31.02 
 
 		 395 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2804  Serine--glyoxylate transaminase  31.49 
 
 		 399 aa  160  3e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19938  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5929  Serine--glyoxylate transaminase  32.37 
 
 		 421 aa  160  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293616  normal  0.115656 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0386  aminotransferase class V  31.71 
 
 		 360 aa  160  4e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.823228  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2489  putative serine--glyoxylate aminotransferase  31.1 
 
 		 400 aa  160  4e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4253  Serine--glyoxylate transaminase  30.43 
 
 		 406 aa  159  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3308  serine-glyoxylate aminotransferase  31.3 
 
 		 398 aa  159  6e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.662608  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3093  aminotransferase class V  31.02 
 
 		 396 aa  159  7e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3194  aminotransferase class V  31.02 
 
 		 396 aa  159  7e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2405  aminotransferase class V  30.36 
 
 		 395 aa  158  1e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.134118 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3670  aminotransferase class V  31.91 
 
 		 402 aa  158  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.569732 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2387  aminotransferase class V  30.17 
 
 		 355 aa  158  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.271517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1388  serine-glyoxylate aminotransferase  28.61 
 
 		 391 aa  158  2e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>