More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0576 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0576  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 164 aa  332  1e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00003083  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0589  Rhodanese domain protein  93.9 
 
 		 164 aa  317  5e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000910595 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3920  rhodanese domain-containing protein  46.54 
 
 		 167 aa  150  5.9999999999999996e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.305185  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0505  rhodanese-like domain-containing protein  48.3 
 
 		 169 aa  137  3.9999999999999997e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3018  rhodanese-like protein  39.02 
 
 		 172 aa  131  5e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00360973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2523  rhodanese-related sulfurtransferase  38.31 
 
 		 170 aa  103  8e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000271872  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1658  Rhodanese domain protein  36.21 
 
 		 252 aa  79.3  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.329991  normal  0.217102 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2538  rhodanese domain-containing protein  32.79 
 
 		 252 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0413586  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0713  rhodanese domain-containing protein  35.19 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0382  Rhodanese domain protein  33.13 
 
 		 274 aa  67.8  0.00000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0199253  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3805  rhodanese domain-containing protein  35.45 
 
 		 170 aa  67.8  0.00000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.715987 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2883  rhodanese domain-containing protein  36.51 
 
 		 172 aa  67.4  0.00000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.8077  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2272  Rhodanese domain protein  33.61 
 
 		 406 aa  66.2  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  33.63 
 
 		 173 aa  66.6  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  29.06 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3468  transcriptional activator domain-containing protein  38.1 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2645  Rhodanese domain protein  30.51 
 
 		 147 aa  64.3  0.0000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.799  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  30.28 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0008  rhodanese-like protein  34.51 
 
 		 380 aa  63.2  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.612514 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3059  rhodanese domain-containing protein  35.48 
 
 		 177 aa  63.5  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.865399  normal  0.233409 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1903  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.931871  decreased coverage  0.00875739 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1961  transcriptional regulator, ArsR family  34.26 
 
 		 222 aa  62  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172252  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2204  transcriptional regulator, ArsR family  34.38 
 
 		 221 aa  62  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.345359  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2739  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0533498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1363  ArsR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 227 aa  61.6  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0041  rhodanese domain-containing protein  36.27 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  37.62 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0050  rhodanese domain-containing protein  36.27 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3937  ArsR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.364905 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2503  rhodanese-related sulfurtransferase  30.77 
 
 		 112 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.314097 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  34.91 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1278  ArsR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.180316 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3631  rhodanese-like protein  37.36 
 
 		 353 aa  59.3  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.161268  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4469  rhodanese domain-containing protein  32.08 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345024 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4216  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2736  ArsR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 227 aa  58.2  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  29.81 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0787  Rhodanese domain protein  27.61 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403999  normal  0.138616 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4020  rhodanese domain-containing protein  35.29 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0046  rhodanese domain-containing protein  33.96 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000263421 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0052  rhodanese domain-containing protein  33.96 
 
 		 158 aa  57.4  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000103873 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  31.73 
 
 		 123 aa  57.8  0.00000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4331  rhodanese domain-containing protein  35.29 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0044  rhodanese domain-containing protein  35.29 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0048  Rhodanese domain protein  35.29 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0338944 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  28.32 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0048  rhodanese domain-containing protein  35.29 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000123958 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0930  sulfur transferase, putative, selenocysteine-containing  34.31 
 
 		 423 aa  57  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2044  Rhodanese domain protein  30.63 
 
 		 114 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0044  rhodanese domain-containing protein  35.29 
 
 		 149 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3128  ArsR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 223 aa  57  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3697  rhodanese-like protein  28.3 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4876  rhodanese domain-containing protein  31.37 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4773  Rhodanese domain-containing protein  32.63 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0201355  hitchhiker  0.000148861 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4212  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.204414  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0892  Rhodanese domain protein  32.2 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1513  cyclic nucleotide-binding protein  26.58 
 
 		 308 aa  55.5  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00604424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0061  rhodanese-like protein  32 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03114  hypothetical protein  37.5 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0450436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0134  Rhodanese domain protein  33.64 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.410653 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0756  transcriptional regulator, ArsR family  29.41 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.213263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1443  Rhodanese domain protein  25.71 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.095571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  27.68 
 
 		 269 aa  54.7  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2570  rhodanese domain-containing protein  27.88 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0116994 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  29.25 
 
 		 480 aa  53.5  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  30.1 
 
 		 145 aa  53.9  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2905  ArsR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 224 aa  53.9  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0462  ArsR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 253 aa  53.5  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2180  ArsR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 218 aa  53.5  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1911  rhodanese domain-containing protein  29.31 
 
 		 189 aa  53.9  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000193462  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002246  rhodanese-related sulfurtransferase  26.36 
 
 		 144 aa  53.1  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.566025  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  30.85 
 
 		 125 aa  53.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1677  Rhodanese domain protein  31.93 
 
 		 174 aa  53.1  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2472  rhodanese domain-containing protein  34.41 
 
 		 132 aa  53.1  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.86428  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3941  Rhodanese domain protein  31.37 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2078  rhodanese domain-containing protein  35.56 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.04221  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1355  rhodanese-like protein  33.08 
 
 		 161 aa  52.4  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100985  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4453  ArsR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 233 aa  52.4  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0398  phage shock protein E, putative  29.63 
 
 		 118 aa  51.6  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0701  thiosulfate sulfurtransferase GlpE  30.77 
 
 		 107 aa  52  0.000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.6297700000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2085  rhodanese domain-containing protein  31.13 
 
 		 194 aa  51.6  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252289  normal  0.0462986 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3983  rhodanese domain protein  32.35 
 
 		 143 aa  51.6  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4089  rhodanese domain-containing protein  32.35 
 
 		 143 aa  51.6  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3921  rhodanese domain protein  32.35 
 
 		 143 aa  51.6  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1792  rhodanese-like protein  31.31 
 
 		 177 aa  51.6  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  30.4 
 
 		 140 aa  51.6  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3902  rhodanese domain protein  32.35 
 
 		 143 aa  51.6  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.186637 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4028  rhodanese domain-containing protein  32.35 
 
 		 143 aa  51.6  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3743  hypothetical protein  28.93 
 
 		 237 aa  51.6  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1222  ArsR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 224 aa  51.2  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0354  Rhodanese domain protein  34.31 
 
 		 103 aa  51.2  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00605821  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0267  rhodanese domain-containing protein  29.81 
 
 		 161 aa  51.2  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0623  ArsR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 223 aa  51.2  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128738 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0094  Rhodanese domain protein  32.35 
 
 		 143 aa  51.2  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1758  ArsR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 224 aa  51.2  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.99053  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  29.52 
 
 		 218 aa  50.8  0.000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3427  ArsR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 234 aa  50.8  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.299912  normal  0.0245638 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4039  rhodanese domain protein  32.35 
 
 		 143 aa  51.2  0.000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4984  rhodanese domain protein  32.35 
 
 		 143 aa  51.2  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>