More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2666 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2666  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 237 aa  485  1e-136  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0191  transcriptional regulator  43.35 
 
 		 241 aa  214  9.999999999999999e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.168496 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1211  GntR family transcriptional regulator  43.98 
 
 		 241 aa  208  5e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1309  GntR family transcriptional regulator  42.92 
 
 		 238 aa  204  1e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3118  transcriptional regulator, GntR family  41.1 
 
 		 237 aa  199  1.9999999999999998e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.180499  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1472  GntR family transcriptional regulator  40.77 
 
 		 238 aa  179  4.999999999999999e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000013898  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1833  transcriptional regulator, GntR family  36.17 
 
 		 245 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0220411  normal  0.173691 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3424  GntR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 245 aa  161  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.014089  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3412  transcriptional regulator, GntR family  36.17 
 
 		 245 aa  159  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000144012  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0077  transcriptional regulator, GntR family  38.33 
 
 		 239 aa  159  5e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3424  transcriptional regulator, GntR family  35.74 
 
 		 245 aa  158  7e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3183  GntR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 245 aa  158  7e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.529781  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2998  transcriptional regulator, GntR family  39.26 
 
 		 239 aa  157  1e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000222084  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3111  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 245 aa  155  4e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3436  transcriptional regulator, GntR family  35.32 
 
 		 245 aa  155  4e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3204  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 245 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.264865  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3458  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 245 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3202  transcriptional regulator, GntR family  38.1 
 
 		 237 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1962  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 242 aa  142  3e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00453299  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000412  transcriptional regulator of succinyl CoA synthetase operon  33.61 
 
 		 235 aa  139  3.9999999999999997e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0016  GntR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 248 aa  135  8e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0020  transcriptional regulator, GntR family  32.88 
 
 		 238 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4235  transcriptional regulator, GntR family  32.88 
 
 		 238 aa  134  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5116  transcriptional regulator, GntR family  32.88 
 
 		 238 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4049  GntR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 238 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.855147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0019  GntR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 238 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3895  GntR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 238 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4192  GntR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 238 aa  133  3e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  32.2 
 
 		 243 aa  133  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0698  trehalose operon transcriptional repressor  34.82 
 
 		 236 aa  131  9e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0597  trehalose operon transcriptional repressor  33.47 
 
 		 236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.464881  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0630  trehalose operon transcriptional repressor  33.47 
 
 		 236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0543  GntR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0759  trehalose operon repressor  34.41 
 
 		 236 aa  129  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0541  trehalose operon transcriptional repressor  33.47 
 
 		 236 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0541  trehalose operon transcriptional repressor  33.47 
 
 		 236 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4671  trehalose operon repressor  33.47 
 
 		 236 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.38863e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0666  trehalose operon repressor  33.06 
 
 		 236 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0685  trehalose operon repressor  33.47 
 
 		 236 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.327487 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  32.19 
 
 		 247 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0543  trehalose operon repressor  30.34 
 
 		 235 aa  126  3e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.405615  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0527  trehalose operon transcriptional repressor  30.34 
 
 		 235 aa  126  3e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3530  GntR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 235 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.814628  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1687  GntR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 243 aa  122  4e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8112  transcriptional regulator, GntR family  34.35 
 
 		 252 aa  122  7e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0559  transcriptional regulator  30.51 
 
 		 242 aa  121  8e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000128597  hitchhiker  0.00000147754 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 243 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 233 aa  121  9.999999999999999e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0426  GntR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 248 aa  119  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 243 aa  119  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 243 aa  119  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 243 aa  119  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 243 aa  119  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0513  transcriptional regulator, GntR family  32.75 
 
 		 288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0204845 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  30.04 
 
 		 243 aa  116  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 225 aa  116  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0076  transcriptional regulator, GntR family  28.4 
 
 		 235 aa  115  6e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.15859  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  30.6 
 
 		 232 aa  114  8.999999999999998e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0649  DNA-binding transcriptional repressor MngR  31.09 
 
 		 240 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1622  transcriptional regulator, GntR family  27.85 
 
 		 246 aa  112  5e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0510  GntR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 240 aa  112  5e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3593  transcriptional regulator, GntR family  30.64 
 
 		 239 aa  112  6e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0756  DNA-binding transcriptional repressor MngR  31.12 
 
 		 240 aa  111  8.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00689  DNA-binding transcriptional dual regulator, fatty-acyl-binding  31.12 
 
 		 240 aa  111  9e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.829969  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0777  DNA-binding transcriptional repressor MngR  31.12 
 
 		 240 aa  111  9e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00678  hypothetical protein  31.12 
 
 		 240 aa  111  9e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2926  DNA-binding transcriptional repressor MngR  31.12 
 
 		 240 aa  111  9e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.594583  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2906  transcriptional regulator, GntR family  31.12 
 
 		 240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0169787  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0968  GntR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0543  GntR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.464871  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2552  transcriptional regulator, GntR family  27.97 
 
 		 237 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3733  transcriptional regulator, GntR family  30.13 
 
 		 245 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.502794  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1192  GntR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 245 aa  108  6e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1898  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 263 aa  108  7.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000197182  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  32.22 
 
 		 260 aa  107  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1727  GntR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 236 aa  107  2e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3873  transcriptional regulator, GntR family  31.47 
 
 		 244 aa  107  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3960  transcriptional regulator, GntR family  31.9 
 
 		 278 aa  105  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.130566  normal  0.0173208 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3846  transcriptional regulator, GntR family  31.9 
 
 		 278 aa  105  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00362277  normal  0.959313 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0376  transcriptional regulator, GntR family  31.42 
 
 		 252 aa  105  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2418  putative transcriptional regulator, GntR family  31.6 
 
 		 247 aa  105  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  30.47 
 
 		 252 aa  105  6e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  29.96 
 
 		 242 aa  104  1e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05542  putative DNA-binding transcriptional regulatory transcription regulator protein  31.03 
 
 		 273 aa  103  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0364359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0054  transcriptional regulator, GntR family  31.03 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.514646  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2122  transcriptional regulator, GntR family  30.74 
 
 		 244 aa  103  3e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1740  GntR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 232 aa  103  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.40989  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1621  GntR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 239 aa  102  6e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00823964  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1632  GntR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 232 aa  101  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.367647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  26.41 
 
 		 240 aa  101  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  28.39 
 
 		 242 aa  100  1e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4543  transcriptional regulator, GntR family  32.34 
 
 		 245 aa  99.8  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2016  transcriptional regulator, GntR family  25.64 
 
 		 242 aa  99.8  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.47195  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  28.14 
 
 		 241 aa  100  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1002  transcriptional regulator, GntR family  28.88 
 
 		 248 aa  99.4  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2332  GntR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 248 aa  99.4  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.491871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2288  transcriptional regulator, GntR family  28.45 
 
 		 248 aa  99.4  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.545924  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2381  transcriptional regulator, GntR family  28.45 
 
 		 248 aa  99.4  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.770781 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>