More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1237 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1237  NUDIX hydrolase  100 
 
 
137 aa  276  7e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0356  mutator MutT protein  68.75 
 
 
136 aa  190  5e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1031  putative mutator mutT protein  53.44 
 
 
131 aa  150  5e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0898  mutator MutT protein, putative  53.44 
 
 
131 aa  150  5e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0730911  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2053  MutT/nudix family protein  45.8 
 
 
132 aa  125  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.381111  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3078  NUDIX hydrolase  48.41 
 
 
134 aa  124  5e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2568  NUDIX hydrolase  45.31 
 
 
130 aa  119  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2516  NUDIX hydrolase  45.31 
 
 
130 aa  119  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2984  NUDIX hydrolase  43.94 
 
 
136 aa  100  7e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000021571  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3508  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.73 
 
 
128 aa  96.7  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116101  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2908  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.73 
 
 
128 aa  96.7  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0055236  normal  0.908985 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3377  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.73 
 
 
128 aa  96.7  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0382964  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2482  NUDIX hydrolase  40.16 
 
 
138 aa  95.5  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.62 
 
 
360 aa  95.1  3e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3838  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 
144 aa  93.2  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0218718  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5502  NUDIX hydrolase  42.64 
 
 
134 aa  92.4  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.985254 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  41.6 
 
 
318 aa  91.7  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8468  NUDIX hydrolase  42.15 
 
 
130 aa  90.1  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410235  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0574  mutator MutT protein  40.68 
 
 
139 aa  89.7  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.37378  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0771  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.84 
 
 
134 aa  89  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  0.720455 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0910  NUDIX hydrolase  39.37 
 
 
141 aa  89.4  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.479251  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1486  NUDIX hydrolase  32.82 
 
 
131 aa  89  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00282357  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  42.37 
 
 
383 aa  87.8  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11810  ADP-ribose pyrophosphatase  41.67 
 
 
131 aa  87.8  5e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  41.41 
 
 
137 aa  87.8  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  45.24 
 
 
314 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  41.41 
 
 
142 aa  87.4  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  45.24 
 
 
314 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3099  mutator protein; oxidative damage repair protein  34.59 
 
 
137 aa  87  8e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1790  NUDIX hydrolase  37.82 
 
 
154 aa  86.7  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3582  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.3 
 
 
131 aa  86.3  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000334964  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4501  hypothetical protein  44.44 
 
 
314 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523087  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2042  NUDIX hydrolase  43.41 
 
 
129 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000547499 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  40.68 
 
 
363 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  42.64 
 
 
135 aa  85.5  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2414  NUDIX hydrolase  39.02 
 
 
126 aa  85.5  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.143725  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  40.62 
 
 
136 aa  85.5  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1921  NUDIX hydrolase  37.4 
 
 
133 aa  85.5  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.11755  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  43.65 
 
 
314 aa  84.7  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17541  A/G-specific DNA glycosylase  36.07 
 
 
399 aa  85.5  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1775  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 
129 aa  84.3  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.296323  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1687  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.84 
 
 
140 aa  84.3  5e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1863  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 
132 aa  84.3  5e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.477977  normal  0.665179 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  39.68 
 
 
316 aa  84  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1890  Mutator MutT  38.1 
 
 
142 aa  83.6  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.620209 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  39.84 
 
 
137 aa  83.6  9e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0634  NUDIX hydrolase  39.84 
 
 
143 aa  82.8  0.000000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3658  mutator MutT protein  44.64 
 
 
135 aa  83.2  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236932  normal  0.362443 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  39.02 
 
 
386 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  39.37 
 
 
132 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2157  NUDIX hydrolase  39.84 
 
 
129 aa  82  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  39.37 
 
 
132 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  39.37 
 
 
132 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0523  NUDIX hydrolase  39.68 
 
 
133 aa  82  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  39.83 
 
 
352 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2065  NUDIX hydrolase  39.84 
 
 
129 aa  82  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0388  mutator MutT protein  41.88 
 
 
138 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4091  hypothetical protein  38.1 
 
 
316 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2179  hypothetical protein  37.8 
 
 
314 aa  81.3  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299804  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0991  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  35.11 
 
 
132 aa  81.3  0.000000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1931  NUDIX hydrolase  38.33 
 
 
133 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000285208  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0428  NUDIX hydrolase  41.88 
 
 
138 aa  81.3  0.000000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.834318  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2201  NUDIX hydrolase  46.72 
 
 
132 aa  80.9  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04356  hypothetical protein  40.52 
 
 
302 aa  81.3  0.000000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3059  A/G-specific adenine glycosylase  39.83 
 
 
352 aa  80.9  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2289  NUDIX hydrolase  46.72 
 
 
132 aa  80.9  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.648467  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0312  mutator MutT protein  42.11 
 
 
138 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.672809  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  40.8 
 
 
151 aa  80.5  0.000000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1657  NUDIX hydrolase  45.9 
 
 
132 aa  80.5  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.809555  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  37.98 
 
 
137 aa  80.9  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0356  mutator MutT protein  42.11 
 
 
138 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0223709  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3270  NUDIX hydrolase  42.74 
 
 
139 aa  80.5  0.000000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196596  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0387  NUDIX hydrolase  39.52 
 
 
129 aa  80.5  0.000000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0299  mutator mutT protein  39.56 
 
 
139 aa  80.1  0.000000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0361617  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3444  mutator MutT protein  33.59 
 
 
129 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  38.14 
 
 
329 aa  79.3  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  39.68 
 
 
314 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0143  Mutator MutT  36.22 
 
 
352 aa  79.7  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  39.02 
 
 
128 aa  79.7  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1617  NUDIX hydrolase  39.2 
 
 
132 aa  79.3  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267139  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  38.14 
 
 
329 aa  79.3  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0513  NUDIX hydrolase  39.83 
 
 
138 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117627  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  36.43 
 
 
138 aa  79.3  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2293  mutator MutT protein  37.5 
 
 
129 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.192428  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3770  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.13 
 
 
131 aa  78.6  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  36.43 
 
 
138 aa  79.3  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4971  hypothetical protein  39.68 
 
 
315 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1484  NUDIX hydrolase  45.3 
 
 
138 aa  78.2  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1487  NUDIX hydrolase  41.35 
 
 
147 aa  78.6  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000137627 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0146  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.43 
 
 
131 aa  77.8  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1154  NUDIX hydrolase  46.09 
 
 
124 aa  78.2  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.271981  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  36.22 
 
 
132 aa  77.8  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  40.48 
 
 
313 aa  77.8  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0110  NUDIX hydrolase  38.28 
 
 
133 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0781  mutator MutT protein  38.21 
 
 
317 aa  77.8  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0134531  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0620  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.65 
 
 
132 aa  77.4  0.00000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3770  NUDIX hydrolase  43.09 
 
 
200 aa  77.4  0.00000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.288059 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2266  mutator MutT protein  37.5 
 
 
138 aa  77.4  0.00000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.97404 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0863  NUDIX hydrolase  39.67 
 
 
153 aa  77.4  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.522755 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0614  NUDIX hydrolase  41.79 
 
 
135 aa  77  0.00000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852421  normal  0.976562 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>