More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0523 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0523  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 224 aa  453  1e-127  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2673  DNA-binding response regulator  66.06 
 
 		 224 aa  299  2e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2492  two component transcriptional regulator  65.61 
 
 		 224 aa  299  3e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.22217  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2675  DNA-binding response regulator  66.06 
 
 		 224 aa  299  3e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0180828  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1228  two component transcriptional regulator  62.11 
 
 		 228 aa  289  2e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000325236  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1732  DNA-binding response regulator  59.65 
 
 		 229 aa  281  7.000000000000001e-75  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.019008  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1398  DNA-binding response regulator  57.21 
 
 		 246 aa  272  3e-72  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000136334  hitchhiker  8.832960000000001e-24 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0354  DNA-binding response regulator  60.35 
 
 		 229 aa  270  2e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000041064  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1701  DNA-binding response regulator  59.19 
 
 		 230 aa  269  2.9999999999999997e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00672994  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1625  DNA-binding response regulator CsrR  58.59 
 
 		 229 aa  263  2e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.137799  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1476  two component transcriptional regulator  55 
 
 		 219 aa  249  3e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1505  response regulator receiver  55 
 
 		 219 aa  249  3e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.404603  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2231  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.16 
 
 		 226 aa  244  8e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.64 
 
 		 225 aa  239  2e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0015  two component transcriptional regulator  53.12 
 
 		 228 aa  237  9e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3055  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.05 
 
 		 227 aa  236  2e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.703147  hitchhiker  0.000223036 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  53.12 
 
 		 228 aa  236  3e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1098  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.97 
 
 		 228 aa  235  4e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.12 
 
 		 224 aa  233  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  52.05 
 
 		 224 aa  233  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  51.6 
 
 		 224 aa  233  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0989  DNA-binding response regulator ArlR  54.34 
 
 		 219 aa  229  3e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.110636  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1056  DNA-binding response regulator  55.41 
 
 		 226 aa  228  8e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.775205  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.45 
 
 		 224 aa  228  8e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2324  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.74 
 
 		 223 aa  224  6e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.237639  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  50.23 
 
 		 236 aa  223  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2194  DNA-binding response regulator  50.44 
 
 		 227 aa  219  3e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00702475  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2056  DNA-binding response regulator  50.44 
 
 		 227 aa  217  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.413172  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2240  DNA-binding response regulator  50.44 
 
 		 227 aa  217  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.85177e-28 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2212  DNA-binding response regulator  50.44 
 
 		 227 aa  217  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0737  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.43 
 
 		 224 aa  216  2e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0389  winged helix family two component transcriptional regulator  49.09 
 
 		 224 aa  215  4e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.667669  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  50.68 
 
 		 225 aa  214  5.9999999999999996e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1873  two component transcriptional regulator  47.77 
 
 		 226 aa  212  2.9999999999999995e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1131  two component transcriptional regulator  50.67 
 
 		 226 aa  212  2.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  49.32 
 
 		 240 aa  212  3.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  47.58 
 
 		 231 aa  208  4e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  46.7 
 
 		 231 aa  208  5e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  48.25 
 
 		 237 aa  207  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2264  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.75 
 
 		 231 aa  206  3e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00910741  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  45.74 
 
 		 231 aa  205  4e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.96 
 
 		 224 aa  204  7e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.96 
 
 		 224 aa  204  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  45.29 
 
 		 231 aa  204  1e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4284  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.4 
 
 		 227 aa  203  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0759  two component transcriptional regulator  45.74 
 
 		 223 aa  202  3e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128917  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0274  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.43 
 
 		 232 aa  202  3e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.701823  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2268  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.21 
 
 		 221 aa  202  4e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  45.95 
 
 		 227 aa  202  4e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  45.7 
 
 		 224 aa  201  5e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  45.7 
 
 		 224 aa  202  5e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  46.46 
 
 		 230 aa  202  5e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  46.15 
 
 		 224 aa  201  7e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  46.02 
 
 		 230 aa  201  7e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  46.02 
 
 		 230 aa  201  7e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  46.02 
 
 		 230 aa  201  7e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  45.7 
 
 		 224 aa  201  8e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  45.25 
 
 		 224 aa  201  8e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  48.18 
 
 		 236 aa  201  9e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.34 
 
 		 225 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2632  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.29 
 
 		 229 aa  200  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.64 
 
 		 228 aa  200  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1377  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.64 
 
 		 225 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000301655 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2318  two component transcriptional regulator  47.49 
 
 		 225 aa  200  1.9999999999999998e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.642935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2106  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.05 
 
 		 238 aa  199  3e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2999  DNA-binding response regulator  45.25 
 
 		 224 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.227145  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3229  DNA-binding response regulator  45.25 
 
 		 224 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  45.7 
 
 		 224 aa  198  6e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1044  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.28 
 
 		 234 aa  198  7e-50  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1986  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.82 
 
 		 223 aa  197  9e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0566795  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00280  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  46.96 
 
 		 234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000064956 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0191  two component transcriptional regulator  46.15 
 
 		 244 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1491  two component transcriptional regulator  46.29 
 
 		 236 aa  196  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00391258 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0461  two component transcriptional regulator  46.15 
 
 		 248 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.735267  normal  0.697364 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  45.7 
 
 		 224 aa  195  5.000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5235  DNA-binding response regulator  45.41 
 
 		 220 aa  194  7e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0048741  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  45.7 
 
 		 223 aa  194  8.000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0603  two component transcriptional regulator  43.11 
 
 		 233 aa  194  8.000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0519325  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.56 
 
 		 230 aa  194  9e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0293  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.87 
 
 		 226 aa  194  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.591061  normal  0.658536 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0311  two component transcriptional regulator  45.25 
 
 		 232 aa  194  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.280613 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0321  two component transcriptional regulator  44 
 
 		 406 aa  193  2e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2637  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.36 
 
 		 227 aa  193  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1247  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.16 
 
 		 235 aa  193  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.464606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0998  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.15 
 
 		 223 aa  192  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  43.81 
 
 		 232 aa  192  3e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1103  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.45 
 
 		 227 aa  192  5e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08590  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  46.82 
 
 		 239 aa  191  1e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.857083 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2496  response regulator receiver  45.05 
 
 		 225 aa  191  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491467  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3400  two component transcriptional regulator  43.05 
 
 		 224 aa  190  1e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.105495  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0399  two component transcriptional regulator  45.33 
 
 		 272 aa  190  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5186  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.75 
 
 		 223 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3349  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.21 
 
 		 223 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1893  two component transcriptional regulator  45.18 
 
 		 235 aa  191  1e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203788 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5224  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  47.03 
 
 		 225 aa  189  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.57611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6987  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.51 
 
 		 225 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.67799  normal  0.586494 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5744  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.06 
 
 		 225 aa  189  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0360294  normal  0.749662 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1389  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.58 
 
 		 225 aa  189  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.717226  normal  0.091392 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1505  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.51 
 
 		 225 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.228186  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5988  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.06 
 
 		 225 aa  189  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>