256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1820 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1820  protein-P-II uridylyltransferase, putative  100 
 
 		 902 aa  1843    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.074397  n/a   
 
 
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NC_007498  Pcar_1512  protein-P-II uridylyltransferase  52.09 
 
 		 906 aa  924    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007517  Gmet_1426  UTP-GlnB (protein PII) uridylyltransferase, GlnD  81.98 
 
 		 899 aa  1540    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.918297  normal  1 
 
 
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NC_011146  Gbem_1877  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  66.52 
 
 		 894 aa  1239    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2333  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  66.41 
 
 		 894 aa  1244    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2384  metal dependent phosphohydrolase  72.44 
 
 		 898 aa  1376    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2691  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  64.85 
 
 		 900 aa  1182    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.79049  n/a   
 
 
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NC_008609  Ppro_1343  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  66.19 
 
 		 905 aa  1231    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1411  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  37.78 
 
 		 924 aa  578  1.0000000000000001e-163  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009675  Anae109_2112  metal dependent phosphohydrolase  37.26 
 
 		 927 aa  569  1e-161  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0838808  normal  0.131108 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2253  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  36.22 
 
 		 930 aa  557  1e-157  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1692  metal dependent phosphohydrolase  35.98 
 
 		 930 aa  552  1e-156  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.427674  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2164  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  35.88 
 
 		 930 aa  551  1e-155  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.191815  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3602  PII uridylyl-transferase  35.45 
 
 		 931 aa  533  1e-150  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3539  PII uridylyl-transferase  36.57 
 
 		 936 aa  521  1e-146  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1811  PII uridylyl-transferase  35.25 
 
 		 930 aa  498  1e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0446  PII uridylyl-transferase  36.05 
 
 		 893 aa  498  1e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0458  PII uridylyl-transferase  35.25 
 
 		 930 aa  498  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0418586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0469  PII uridylyl-transferase  35.74 
 
 		 930 aa  496  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0882544 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0574  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  36.71 
 
 		 864 aa  494  9.999999999999999e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.342423  normal  0.895428 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0031  PII uridylyl-transferase  34.49 
 
 		 949 aa  487  1e-136  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000404003 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0567  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  34.91 
 
 		 887 aa  484  1e-135  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009667  Oant_0157  PII uridylyl-transferase  34.35 
 
 		 934 aa  480  1e-134  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010725  Mpop_0414  PII uridylyl-transferase  34.61 
 
 		 928 aa  476  1e-133  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.394312  normal  1 
 
 
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NC_004310  BR0144  PII uridylyl-transferase  34.99 
 
 		 934 aa  475  1e-132  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007802  Jann_0897  PII uridylyl-transferase  32.94 
 
 		 914 aa  473  1e-132  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.88473 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0335  PII uridylyl-transferase  34.38 
 
 		 928 aa  474  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.636952  normal  1 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_3543  PII uridylyl-transferase  33.71 
 
 		 935 aa  475  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.654766 
 
 
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NC_011757  Mchl_0382  PII uridylyl-transferase  34.38 
 
 		 928 aa  474  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.267202 
 
 
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NC_010511  M446_2185  PII uridylyl-transferase  34.14 
 
 		 936 aa  474  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00224079  normal  0.664857 
 
 
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NC_008687  Pden_3956  PII uridylyl-transferase  33.69 
 
 		 936 aa  476  1e-132  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.619091  normal  1 
 
 
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NC_011004  Rpal_0594  PII uridylyl-transferase  33.76 
 
 		 933 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009505  BOV_0139  PII uridylyl-transferase  34.65 
 
 		 934 aa  470  1.0000000000000001e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009952  Dshi_2833  PII uridylyl-transferase  33.82 
 
 		 943 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.141519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2799  PII uridylyl-transferase  34.37 
 
 		 937 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_007958  RPD_0116  PII uridylyl-transferase  33.84 
 
 		 933 aa  469  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.870381 
 
 
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NC_007778  RPB_0032  PII uridylyl-transferase  33.84 
 
 		 932 aa  464  1e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.968292  normal  0.957944 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0342  PII uridylyl-transferase  33.37 
 
 		 931 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52528  normal  1 
 
 
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NC_008048  Sala_2787  PII uridylyl-transferase  34.03 
 
 		 935 aa  466  1e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.565994  normal  0.190561 
 
 
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NC_011894  Mnod_1147  PII uridylyl-transferase  34.88 
 
 		 1029 aa  462  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.845695  n/a   
 
 
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NC_007964  Nham_0226  PII uridylyl-transferase  33.56 
 
 		 931 aa  461  9.999999999999999e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.952956  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0424  PII uridylyl-transferase  34.1 
 
 		 941 aa  459  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009485  BBta_7648  PII uridylyl-transferase  32.71 
 
 		 931 aa  459  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.285774 
 
 
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NC_007794  Saro_0682  PII uridylyl-transferase  33.44 
 
 		 912 aa  459  1e-127  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009484  Acry_0914  PII uridylyl-transferase  33.41 
 
 		 938 aa  459  1e-127  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009720  Xaut_0284  PII uridylyl-transferase  34.19 
 
 		 969 aa  454  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.610069  normal  0.0372398 
 
 
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NC_010581  Bind_3127  PII uridylyl-transferase  33.82 
 
 		 953 aa  455  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008254  Meso_4033  PII uridylyl-transferase  33.18 
 
 		 912 aa  443  1e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.23625  n/a   
 
 
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NC_012850  Rleg_0045  PII uridylyl-transferase  32.69 
 
 		 968 aa  446  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.893675 
 
 
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NC_011369  Rleg2_0030  PII uridylyl-transferase  32.69 
 
 		 968 aa  443  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.892083 
 
 
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NC_007406  Nwi_0133  PII uridylyl-transferase  32.41 
 
 		 925 aa  442  9.999999999999999e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.633689  normal  0.494173 
 
 
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NC_011901  Tgr7_1157  (Protein-PII) uridylyltransferase  34.82 
 
 		 899 aa  436  1e-120  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011365  Gdia_0300  PII uridylyl-transferase  32.97 
 
 		 989 aa  432  1e-119  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.940535  normal  0.172702 
 
 
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NC_010338  Caul_0009  PII uridylyl-transferase  32.1 
 
 		 941 aa  421  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010730  SYO3AOP1_0911  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  32.35 
 
 		 869 aa  422  1e-116  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0590942  n/a   
 
 
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NC_008789  Hhal_1468  metal dependent phosphohydrolase  33.29 
 
 		 889 aa  419  1e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010571  Oter_2005  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  31.3 
 
 		 937 aa  415  1e-114  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.572781  normal  0.260834 
 
 
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NC_013889  TK90_1499  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  34.1 
 
 		 893 aa  414  1e-114  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.179178  normal  1 
 
 
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NC_013440  Hoch_3155  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  33.6 
 
 		 916 aa  410  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.620128  normal  0.567988 
 
 
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NC_012560  Avin_39010  PII uridylyl-transferase  33.58 
 
 		 899 aa  412  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002947  PP_1589  PII uridylyl-transferase  33.01 
 
 		 900 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.590557 
 
 
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NC_007912  Sde_2602  PII uridylyl-transferase  30.7 
 
 		 900 aa  404  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4188  PII uridylyl-transferase  33.01 
 
 		 900 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.445496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3055  PII uridylyl-transferase  31.8 
 
 		 899 aa  403  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460023  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1532  [protein-pII] uridylyltransferase  32.76 
 
 		 898 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008340  Mlg_1865  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  31.52 
 
 		 894 aa  401  9.999999999999999e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.678957  normal  1 
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_1270  metal dependent phosphohydrolase  31.82 
 
 		 897 aa  401  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.439382 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1144  PII uridylyl-transferase  32.76 
 
 		 900 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.206269  normal  0.972072 
 
 
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NC_010681  Bphyt_2457  PII uridylyl-transferase  33.21 
 
 		 859 aa  399  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.100241  hitchhiker  0.00205013 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0806  protein-P-II uridylyltransferase  31.6 
 
 		 892 aa  399  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.389764  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4084  PII uridylyl-transferase  32.93 
 
 		 900 aa  399  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.822232 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1255  PII uridylyl-transferase  31.29 
 
 		 858 aa  393  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0751944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1679  PII uridylyl-transferase  32.83 
 
 		 859 aa  395  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0894657  normal  0.0862944 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3101  PII uridylyl-transferase  32.07 
 
 		 885 aa  394  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.429175  normal  0.244748 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0565  protein-P-II uridylyltransferase  31.54 
 
 		 877 aa  392  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.184337  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1402  PII uridylyl-transferase  32.82 
 
 		 861 aa  391  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1739  PII uridylyl-transferase  31.83 
 
 		 852 aa  391  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1276  PII uridylyl-transferase  32.42 
 
 		 862 aa  391  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.111517  normal  0.077343 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4853  PII uridylyl-transferase  32.49 
 
 		 895 aa  393  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.826646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17040  PII uridylyl-transferase  32.5 
 
 		 900 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1340  PII uridylyl-transferase  32.42 
 
 		 862 aa  392  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.423567 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1331  PII uridylyl-transferase  31.16 
 
 		 858 aa  389  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.118754  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1557  PII uridylyl-transferase  31.16 
 
 		 858 aa  389  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2496  PII uridylyl-transferase  31.16 
 
 		 858 aa  389  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0815155  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2585  PII uridylyl-transferase  31.16 
 
 		 858 aa  389  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1099  PII uridylyl-transferase  31.87 
 
 		 900 aa  388  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1433  PII uridylyl-transferase  31.23 
 
 		 857 aa  387  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000939305 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2275  protein-P-II uridylyltransferase  30.08 
 
 		 895 aa  387  1e-106  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1340  PII uridylyl-transferase  31.64 
 
 		 859 aa  388  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.490148  normal  0.451762 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2059  PII uridylyl-transferase  31.16 
 
 		 858 aa  389  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.222746  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3252  PII uridylyl-transferase  31.16 
 
 		 858 aa  389  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.131607  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2439  PII uridylyl-transferase  31.16 
 
 		 858 aa  389  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1883  PII uridylyl-transferase  30.84 
 
 		 869 aa  384  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.779236  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5331  PII uridylyl-transferase  30.75 
 
 		 858 aa  383  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.345474  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2942  PII uridylyl-transferase  31.48 
 
 		 868 aa  385  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1481  PII uridylyl-transferase  32.46 
 
 		 900 aa  385  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.918327  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0561  PII uridylyl-transferase  32.76 
 
 		 891 aa  385  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.113275  n/a   
 
 
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NC_007651  BTH_I2025  PII uridylyl-transferase  31.26 
 
 		 858 aa  382  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_2041  PII uridylyl-transferase  31.89 
 
 		 858 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.442689  normal  1 
 
 
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NC_008062  Bcen_6056  PII uridylyl-transferase  31.89 
 
 		 858 aa  383  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.399672  n/a   
 
 
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