141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0690 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0690  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  377  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2819  putative rRNA methylase  76.22 
 
 		 1128 aa  294  7e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000245096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1022  putative rRNA methylase  62.09 
 
 		 200 aa  229  3e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3358  putative rRNA methylase  60.99 
 
 		 192 aa  221  3e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000432996  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0564  putative rRNA methylase  57.84 
 
 		 196 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.427822  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0887  putative rRNA methylase  58.24 
 
 		 195 aa  209  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.94545e-19 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3179  putative rRNA methylase  51.65 
 
 		 200 aa  171  3.9999999999999995e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1203  putative rRNA methylase  52.51 
 
 		 187 aa  169  2e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0696  putative rRNA methylase  42.93 
 
 		 188 aa  159  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0153  putative rRNA methylase  46.95 
 
 		 190 aa  159  3e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.854086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1082  putative rRNA methylase  42.22 
 
 		 185 aa  157  7e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000102664  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2581  putative rRNA methylase  43.02 
 
 		 209 aa  157  9e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.113396 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3485  putative rRNA methylase  45.93 
 
 		 193 aa  153  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.894221  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12000  putative rRNA methylase  43.41 
 
 		 196 aa  149  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000449414  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4862  hypothetical protein  40.43 
 
 		 190 aa  149  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3423  putative rRNA methylase  40.43 
 
 		 190 aa  148  4e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4482  SAM-dependent methyltransferase  40.43 
 
 		 190 aa  147  6e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4886  hypothetical protein  40.43 
 
 		 190 aa  147  6e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4647  hypothetical protein  40.43 
 
 		 190 aa  147  7e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5002  hypothetical protein  40.43 
 
 		 190 aa  147  7e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.687939  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1515  putative rRNA methylase  54.23 
 
 		 194 aa  147  7e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.213957  normal  0.617269 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4872  hypothetical protein  40.43 
 
 		 190 aa  147  8e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4500  SAM-dependent methyltransferase  39.89 
 
 		 190 aa  147  9e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0095  methyltransferase (putative)  44.62 
 
 		 195 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0375  hypothetical protein  39.89 
 
 		 190 aa  145  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4893  hypothetical protein  39.89 
 
 		 190 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0960  putative rRNA methylase  47.8 
 
 		 235 aa  144  6e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4580  putative rRNA methylase  39.89 
 
 		 190 aa  144  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2602  hypothetical protein  38.28 
 
 		 211 aa  142  4e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1741  putative rRNA methylase  38.92 
 
 		 188 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0662  putative rRNA methylase  39.68 
 
 		 195 aa  138  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2770  putative rRNA methylase  35.98 
 
 		 191 aa  137  7.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00973946  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0543  putative rRNA methylase  43.41 
 
 		 196 aa  131  6e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.313767  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1400  hypothetical protein  38.76 
 
 		 188 aa  130  1.0000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1610  rRNA methylase (SAM-dependent methyltransferase superfamily), putative  39.33 
 
 		 182 aa  127  7.000000000000001e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2381  rRNA methylase domain-containing protein  42.79 
 
 		 232 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.37961e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1816  hypothetical protein  34.95 
 
 		 187 aa  125  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.185209  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1851  hypothetical protein  34.95 
 
 		 187 aa  125  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.002601  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2114  putative rRNA methylase  50 
 
 		 243 aa  122  4e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0217  hypothetical protein  36.22 
 
 		 194 aa  118  4.9999999999999996e-26  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.624522  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1670  putative rRNA methylase  46.98 
 
 		 201 aa  118  4.9999999999999996e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1148  hypothetical protein  31.22 
 
 		 183 aa  112  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00028525  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1337  hypothetical protein  31.22 
 
 		 183 aa  109  3e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339513  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1321  hypothetical protein  29.79 
 
 		 187 aa  106  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.626127  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0073  putative rRNA methylase  43.79 
 
 		 225 aa  101  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0213  putative rRNA methylase  30.99 
 
 		 181 aa  97.4  1e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42440  predicted protein  32.02 
 
 		 475 aa  56.2  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.727315  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1507  hypothetical protein  35.17 
 
 		 184 aa  54.7  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1633  methyltransferase type 11  35.48 
 
 		 409 aa  54.7  0.0000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0334927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0586  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.04 
 
 		 346 aa  53.9  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3189  methyltransferase type 11  38.98 
 
 		 187 aa  53.1  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0523  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.41 
 
 		 256 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.846514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  46.15 
 
 		 233 aa  51.6  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1145  Methyltransferase type 11  25.17 
 
 		 208 aa  51.2  0.000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3938  protein-L-isoaspartate(D-aspartate)O- methyltransferase  32.93 
 
 		 693 aa  51.2  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.791097  normal  0.0454105 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3933  S-adenosyl-methyltransferase MraW  39.76 
 
 		 348 aa  50.8  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00956615  normal  0.253817 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1710  methyltransferase type 11  32.39 
 
 		 262 aa  51.2  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1087  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  48.39 
 
 		 248 aa  50.8  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0234174  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1396  Methyltransferase type 11  33.62 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482862  normal  0.887166 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3349  Methyltransferase type 11  36.59 
 
 		 145 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6647  putative protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  36.54 
 
 		 277 aa  49.7  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0880858 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1509  Methyltransferase type 11  42.37 
 
 		 186 aa  49.7  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2185  methyltransferase type 11  30.57 
 
 		 291 aa  48.9  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.65586  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3422  arsenite S-adenosylmethyltransferase  31.93 
 
 		 271 aa  48.5  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.352558  normal  0.929536 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1612  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.78 
 
 		 356 aa  48.1  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0469  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.23 
 
 		 234 aa  48.1  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0116  precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating), CbiT subunit  36.51 
 
 		 199 aa  47.8  0.00009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.889427  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2339  methyltransferase type 11  46.55 
 
 		 191 aa  47  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.755854  normal  0.422901 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1310  Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  40.58 
 
 		 419 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2844  S-adenosyl-methyltransferase MraW  37.93 
 
 		 301 aa  46.6  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2231  tRNA (adenine-57, 58-N(1)-) methyltransferase  33.33 
 
 		 253 aa  47  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000396256 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1236  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.68 
 
 		 237 aa  46.6  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.228899  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2653  methyltransferase type 11  34.72 
 
 		 210 aa  46.6  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240915  normal  0.794534 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3415  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.17 
 
 		 260 aa  46.2  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2814  UbiE/COQ5 methyltransferase  41.27 
 
 		 209 aa  45.8  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.89 
 
 		 237 aa  45.8  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27308  predicted protein  37.25 
 
 		 247 aa  45.4  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6795  protein-L-isoaspartate(D-aspartate)O- methyltransferase  42.47 
 
 		 390 aa  45.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.794475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2671  SAM-dependent methyltransferase  29.66 
 
 		 193 aa  45.1  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1437  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.4 
 
 		 237 aa  45.1  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0387  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.38 
 
 		 256 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108679 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1523  cobalt-precorrin-6Y C(15)-methyltransferase  31.16 
 
 		 195 aa  44.7  0.0008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000132961 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0557  Methyltransferase type 11  52.5 
 
 		 206 aa  44.7  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1968  arsenite S-adenosylmethyltransferase  29.23 
 
 		 276 aa  44.7  0.0009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0064  Methyltransferase type 11  40.98 
 
 		 249 aa  44.7  0.0009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262124  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1640  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.51 
 
 		 237 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.169643  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0667  Methyltransferase type 11  34.57 
 
 		 243 aa  44.3  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.536233  normal  0.0338996 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2576  putative methyltransferase  31.09 
 
 		 305 aa  44.3  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1099  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  45.65 
 
 		 233 aa  44.3  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.729785  normal  0.0384798 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0804  beta-aspartate methyltransferase, conjectural  42.11 
 
 		 255 aa  44.3  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.10576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2444  methyltransferase type 11  42.62 
 
 		 280 aa  44.3  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubiE  27.89 
 
 		 250 aa  43.9  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5011  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.47 
 
 		 256 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0294  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  27.89 
 
 		 271 aa  43.9  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00915266  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5150  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  28.38 
 
 		 256 aa  43.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0059  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.86 
 
 		 249 aa  43.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.802877  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1919  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  36.76 
 
 		 302 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.134811  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1157  methyltransferase type 11  26.73 
 
 		 187 aa  43.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.120807  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1076  Acyl-CoA synthetases (AMP-forming)/AMP-acid ligases II-like protein  45.65 
 
 		 176 aa  43.9  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45410  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.38 
 
 		 253 aa  43.5  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179927  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>