More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3933 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3933  S-adenosyl-methyltransferase MraW  100 
 
 
348 aa  683    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00956615  normal  0.253817 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5774  S-adenosyl-methyltransferase MraW  62.62 
 
 
316 aa  385  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.752734  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24970  S-adenosyl-methyltransferase MraW  61.08 
 
 
327 aa  371  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.886239 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2934  S-adenosyl-methyltransferase MraW  60.86 
 
 
337 aa  353  2e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00284592  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3270  S-adenosyl-methyltransferase MraW  60.71 
 
 
330 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000287987  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1562  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.15 
 
 
332 aa  352  7e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3220  S-adenosyl-methyltransferase MraW  58.36 
 
 
371 aa  350  3e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0668029 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2663  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.66 
 
 
336 aa  349  5e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3446  S-adenosyl-methyltransferase MraW  59.31 
 
 
372 aa  348  7e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.597717  normal  0.0548232 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5106  S-adenosyl-methyltransferase MraW  58.62 
 
 
327 aa  346  4e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0516888  normal  0.108536 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3071  S-adenosyl-methyltransferase MraW  59.81 
 
 
319 aa  345  8e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0302613  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1276  S-adenosyl-methyltransferase MraW  60.82 
 
 
351 aa  343  2e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.462146  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1653  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.11 
 
 
316 aa  342  5e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.489649 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0888  S-adenosyl-methyltransferase MraW  58.18 
 
 
357 aa  340  2e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127807  normal  0.556593 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12195  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.22 
 
 
396 aa  340  2e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0705243  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3531  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.14 
 
 
378 aa  339  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0334223  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22880  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.16 
 
 
346 aa  339  4e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.555108  normal  0.0421378 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3207  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.23 
 
 
391 aa  338  5.9999999999999996e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00627417  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1102  methyltransferase  56.92 
 
 
330 aa  338  7e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.498999  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3025  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.56 
 
 
336 aa  338  7e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.106729  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2980  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.94 
 
 
371 aa  338  8e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.540896  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1588  S-adenosyl-methyltransferase MraW  59.25 
 
 
333 aa  333  2e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.120607  normal  0.39264 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1407  S-adenosyl-methyltransferase MraW  58.6 
 
 
321 aa  332  7.000000000000001e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00650999  hitchhiker  0.00170065 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3275  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.41 
 
 
324 aa  330  3e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1563  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.4 
 
 
330 aa  325  1e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16640  S-adenosyl-methyltransferase MraW  52.32 
 
 
335 aa  318  7.999999999999999e-86  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0807568  normal  0.0139402 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3264  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.1 
 
 
324 aa  315  8e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.345832  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3326  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.1 
 
 
324 aa  315  8e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.33134  normal  0.0930873 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2654  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.91 
 
 
331 aa  314  9.999999999999999e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2418  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.41 
 
 
333 aa  311  1e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0532516 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13680  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.82 
 
 
331 aa  310  2.9999999999999997e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.381584  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2862  S-adenosylmethionine-dependentmethyltransferase  57.19 
 
 
330 aa  306  3e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10730  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.99 
 
 
331 aa  304  2.0000000000000002e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.101108  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1399  S-adenosyl-methyltransferase MraW  58.75 
 
 
327 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.466335  normal  0.0101144 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1002  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.47 
 
 
329 aa  301  8.000000000000001e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.173656  normal  0.35272 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1066  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.56 
 
 
334 aa  301  1e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0173  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50.16 
 
 
359 aa  290  2e-77  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1109  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.17 
 
 
345 aa  254  1.0000000000000001e-66  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.694577 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1572  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.31 
 
 
291 aa  247  2e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4681  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.96 
 
 
315 aa  242  6e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0572625 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2017  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.78 
 
 
308 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2103  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.43 
 
 
318 aa  240  2.9999999999999997e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.871693  hitchhiker  0.00489448 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08780  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.87 
 
 
318 aa  240  2.9999999999999997e-62  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000136527 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09570  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.2 
 
 
321 aa  239  5.999999999999999e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.142549 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4395  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.48 
 
 
315 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.216905  normal  0.387462 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0770  S-adenosyl-methyltransferase MraW  39.18 
 
 
307 aa  238  8e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.910807  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1329  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.17 
 
 
315 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95493  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0500  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.72 
 
 
312 aa  238  1e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.214758 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0936  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.17 
 
 
315 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4520  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.17 
 
 
315 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2119  S-adenosyl-methyltransferase MraW  39.88 
 
 
310 aa  235  7e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1833  S-adenosyl-methyltransferase MraW  39.88 
 
 
310 aa  235  7e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09010  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.24 
 
 
311 aa  235  9e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4110  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.86 
 
 
313 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0936286  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0585  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.77 
 
 
318 aa  235  1.0000000000000001e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57450  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.03 
 
 
313 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4992  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.72 
 
 
313 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1296  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.38 
 
 
315 aa  234  2.0000000000000002e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4416  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.93 
 
 
313 aa  233  3e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0799414  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1444  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.45 
 
 
324 aa  233  4.0000000000000004e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0770792  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1269  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.39 
 
 
316 aa  230  2e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1046  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.2 
 
 
311 aa  229  6e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0478  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.69 
 
 
327 aa  228  1e-58  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0914  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.72 
 
 
314 aa  226  4e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357676  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0981  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.18 
 
 
313 aa  226  4e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.575492  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0404  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.89 
 
 
313 aa  224  1e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0483  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.8 
 
 
312 aa  223  4e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0667  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.57 
 
 
313 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1884  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.66 
 
 
310 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1209  S-adenosyl-methyltransferase MraW  38.44 
 
 
315 aa  219  3.9999999999999997e-56  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.034127  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1151  SAM-dependent methyltransferase for cell envelope biogenesis  40.54 
 
 
314 aa  218  8.999999999999998e-56  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1991  S-adenosyl-methyltransferase MraW  39.81 
 
 
307 aa  218  1e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.105239  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0205  S-adenosyl-methyltransferase MraW  39.81 
 
 
307 aa  217  2e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3660  S-adenosyl-methyltransferase MraW  39.75 
 
 
310 aa  218  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4019  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.2 
 
 
310 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.219657  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0285  S-adenosyl-methyltransferase MraW  38.58 
 
 
315 aa  216  4e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3677  S-adenosyl-methyltransferase MraW  39.75 
 
 
310 aa  216  4e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3933  S-adenosyl-methyltransferase MraW  39.75 
 
 
310 aa  216  4e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0745363 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4057  S-adenosyl-methyltransferase MraW  39.75 
 
 
310 aa  216  4e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1222  S-adenosyl-methyltransferase MraW  39.06 
 
 
310 aa  216  4e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000949855  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2479  S-adenosyl-methyltransferase MraW  38.31 
 
 
317 aa  216  4e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00084637  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0055  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.19 
 
 
299 aa  216  5e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000417254  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0055  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.19 
 
 
299 aa  216  7e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00424727  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1012  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.96 
 
 
310 aa  215  8e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4071  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.25 
 
 
310 aa  215  9e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2844  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.26 
 
 
301 aa  215  9e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3964  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.58 
 
 
310 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3769  S-adenosyl-methyltransferase MraW  38.85 
 
 
310 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.865675  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2568  S-adenosyl-methyltransferase MraW  39.63 
 
 
310 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3518  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.62 
 
 
313 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1263  S-adenosyl-methyltransferase MraW  39.73 
 
 
311 aa  214  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0087  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.62 
 
 
313 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.519171  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3971  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.97 
 
 
310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000219611  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0088  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.62 
 
 
313 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0090  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.62 
 
 
313 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.929573 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00082  hypothetical protein  42.62 
 
 
313 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1238  S-adenosyl-methyltransferase MraW  39.73 
 
 
311 aa  214  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0084  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.62 
 
 
313 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.796275  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1668  S-adenosyl-methyltransferase MraW  38.6 
 
 
316 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0075  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.62 
 
 
313 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>