More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0478 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_0478  S-adenosyl-methyltransferase MraW  100 
 
 
327 aa  668    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09570  S-adenosyl-methyltransferase MraW  63.49 
 
 
321 aa  404  1e-111  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.142549 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2103  S-adenosyl-methyltransferase MraW  61.88 
 
 
318 aa  398  9.999999999999999e-111  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.871693  hitchhiker  0.00489448 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08780  S-adenosyl-methyltransferase MraW  62.1 
 
 
318 aa  390  1e-107  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000136527 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1269  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.02 
 
 
316 aa  333  3e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0667  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.43 
 
 
313 aa  323  3e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2119  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50.48 
 
 
310 aa  320  1.9999999999999998e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1833  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50.48 
 
 
310 aa  320  1.9999999999999998e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1046  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.45 
 
 
311 aa  318  1e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09010  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.53 
 
 
311 aa  306  3e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2017  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.36 
 
 
308 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3077  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.27 
 
 
311 aa  301  8.000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0981  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.92 
 
 
313 aa  299  3e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.575492  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3297  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.6 
 
 
313 aa  295  5e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0476  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.41 
 
 
313 aa  295  6e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00757887  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2479  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.79 
 
 
317 aa  294  1e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00084637  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1296  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.77 
 
 
315 aa  290  2e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3964  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.2 
 
 
310 aa  287  1e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2568  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.2 
 
 
310 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3777  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.19 
 
 
314 aa  286  2.9999999999999996e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0880861  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3971  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.88 
 
 
310 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000219611  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0404  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.52 
 
 
313 aa  286  4e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3660  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.72 
 
 
310 aa  285  5.999999999999999e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0835  methyltransferase  53.07 
 
 
318 aa  285  5.999999999999999e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.591389 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1222  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.88 
 
 
310 aa  285  8e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000949855  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3677  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.88 
 
 
310 aa  285  9e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4057  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.88 
 
 
310 aa  285  9e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3933  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.88 
 
 
310 aa  285  9e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0745363 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3982  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50 
 
 
303 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4019  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.56 
 
 
310 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.219657  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3769  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.56 
 
 
310 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.865675  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1238  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.22 
 
 
311 aa  283  4.0000000000000003e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1263  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.22 
 
 
311 aa  283  4.0000000000000003e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0744  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.57 
 
 
311 aa  281  8.000000000000001e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.33376  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0678  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.4 
 
 
313 aa  281  8.000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0500  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.4 
 
 
312 aa  281  1e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.214758 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2795  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.15 
 
 
312 aa  281  1e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000553872  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3745  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.24 
 
 
310 aa  281  1e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.627703  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1444  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50.64 
 
 
324 aa  280  3e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0770792  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1012  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.59 
 
 
310 aa  278  6e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4071  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.77 
 
 
310 aa  275  9e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1884  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.87 
 
 
310 aa  270  2e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0483  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.44 
 
 
312 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0787  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.33 
 
 
309 aa  266  2.9999999999999995e-70  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1209  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.23 
 
 
315 aa  265  5.999999999999999e-70  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.034127  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0770  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.37 
 
 
307 aa  264  2e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.910807  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1572  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.03 
 
 
291 aa  263  3e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0585  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.65 
 
 
318 aa  263  3e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2210  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  48.24 
 
 
314 aa  261  1e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0172475  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0341  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.79 
 
 
349 aa  256  4e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000642562  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_282  S-adenosyl-methyltransferase  46.79 
 
 
349 aa  255  8e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000442175  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0888  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.37 
 
 
357 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127807  normal  0.556593 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0320  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.47 
 
 
349 aa  252  6e-66  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000221131  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0285  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.55 
 
 
315 aa  252  7e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1034  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.34 
 
 
325 aa  252  7e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0388  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.49 
 
 
309 aa  251  1e-65  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0708446  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1653  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.87 
 
 
316 aa  250  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.489649 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0738  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.77 
 
 
332 aa  250  2e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0462605  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1151  SAM-dependent methyltransferase for cell envelope biogenesis  44.44 
 
 
314 aa  250  2e-65  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1668  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.91 
 
 
316 aa  249  3e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl394  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.49 
 
 
308 aa  249  4e-65  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.0000973738  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2663  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.47 
 
 
336 aa  249  5e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3071  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.04 
 
 
319 aa  248  1e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0302613  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22880  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.32 
 
 
346 aa  247  2e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.555108  normal  0.0421378 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1588  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.18 
 
 
333 aa  247  2e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.120607  normal  0.39264 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1207  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.84 
 
 
306 aa  246  3e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3207  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.32 
 
 
391 aa  246  4e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00627417  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1102  methyltransferase  47.68 
 
 
330 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.498999  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0935  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.81 
 
 
298 aa  244  9.999999999999999e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1985  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.16 
 
 
308 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000115812  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2614  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.31 
 
 
320 aa  241  1e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.624613  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1500  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.48 
 
 
312 aa  241  2e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0963  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.19 
 
 
361 aa  239  5e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0178075 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2844  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.81 
 
 
301 aa  238  8e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5106  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.48 
 
 
327 aa  238  8e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0516888  normal  0.108536 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0733  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.52 
 
 
323 aa  238  1e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0144586  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1002  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45 
 
 
329 aa  236  4e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.173656  normal  0.35272 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1562  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.88 
 
 
332 aa  235  7e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3275  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.08 
 
 
324 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0766  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.81 
 
 
308 aa  234  1.0000000000000001e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1616  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.04 
 
 
304 aa  233  3e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3531  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.45 
 
 
378 aa  233  3e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0334223  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3519  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.6 
 
 
337 aa  233  4.0000000000000004e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5774  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.15 
 
 
316 aa  232  5e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.752734  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2980  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.82 
 
 
371 aa  232  5e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.540896  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3025  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.27 
 
 
336 aa  231  1e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.106729  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3270  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.58 
 
 
330 aa  231  1e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000287987  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1276  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.74 
 
 
351 aa  231  1e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.462146  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3446  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.47 
 
 
372 aa  231  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.597717  normal  0.0548232 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1500  methyltransferase  44.27 
 
 
312 aa  231  1e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0356236  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2654  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.09 
 
 
331 aa  230  2e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2862  S-adenosylmethionine-dependentmethyltransferase  47.51 
 
 
330 aa  230  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24970  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.04 
 
 
327 aa  229  4e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.886239 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3463  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.41 
 
 
319 aa  229  4e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000923351 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57450  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.45 
 
 
313 aa  229  7e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3220  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.99 
 
 
371 aa  228  1e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0668029 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3264  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.39 
 
 
324 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.345832  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3326  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.39 
 
 
324 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.33134  normal  0.0930873 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10730  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.77 
 
 
331 aa  228  2e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.101108  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2418  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.51 
 
 
333 aa  226  5.0000000000000005e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0532516 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>