More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3071 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_3071  S-adenosyl-methyltransferase MraW  100 
 
 
319 aa  613  1e-175  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0302613  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1653  S-adenosyl-methyltransferase MraW  63.92 
 
 
316 aa  397  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.489649 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24970  S-adenosyl-methyltransferase MraW  65.26 
 
 
327 aa  385  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.886239 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1588  S-adenosyl-methyltransferase MraW  68.4 
 
 
333 aa  375  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.120607  normal  0.39264 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5774  S-adenosyl-methyltransferase MraW  66.03 
 
 
316 aa  371  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.752734  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22880  S-adenosyl-methyltransferase MraW  63.84 
 
 
346 aa  369  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.555108  normal  0.0421378 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5106  S-adenosyl-methyltransferase MraW  63.23 
 
 
327 aa  369  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0516888  normal  0.108536 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1276  S-adenosyl-methyltransferase MraW  65.91 
 
 
351 aa  365  1e-100  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.462146  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1562  S-adenosyl-methyltransferase MraW  59.62 
 
 
332 aa  358  8e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3446  S-adenosyl-methyltransferase MraW  63.75 
 
 
372 aa  355  5.999999999999999e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.597717  normal  0.0548232 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2418  S-adenosyl-methyltransferase MraW  63.52 
 
 
333 aa  354  8.999999999999999e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0532516 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2654  S-adenosyl-methyltransferase MraW  62.21 
 
 
331 aa  354  1e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2980  S-adenosyl-methyltransferase MraW  62.54 
 
 
371 aa  354  1e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.540896  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16640  S-adenosyl-methyltransferase MraW  59.87 
 
 
335 aa  353  2e-96  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0807568  normal  0.0139402 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1407  S-adenosyl-methyltransferase MraW  63.19 
 
 
321 aa  352  2.9999999999999997e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00650999  hitchhiker  0.00170065 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3220  S-adenosyl-methyltransferase MraW  61.86 
 
 
371 aa  352  4e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0668029 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3025  S-adenosyl-methyltransferase MraW  60.32 
 
 
336 aa  343  2e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.106729  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3275  S-adenosyl-methyltransferase MraW  59.24 
 
 
324 aa  342  4e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3531  S-adenosyl-methyltransferase MraW  60.51 
 
 
378 aa  342  4e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0334223  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3207  S-adenosyl-methyltransferase MraW  58.96 
 
 
391 aa  338  5e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00627417  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2934  S-adenosyl-methyltransferase MraW  60.87 
 
 
337 aa  335  5.999999999999999e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00284592  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12195  S-adenosyl-methyltransferase MraW  59.01 
 
 
396 aa  333  2e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0705243  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2663  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.79 
 
 
336 aa  333  2e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1563  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.67 
 
 
330 aa  333  3e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3270  S-adenosyl-methyltransferase MraW  61.79 
 
 
330 aa  332  6e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000287987  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1066  S-adenosyl-methyltransferase MraW  59.28 
 
 
334 aa  329  5.0000000000000004e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3933  S-adenosyl-methyltransferase MraW  59.54 
 
 
348 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00956615  normal  0.253817 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1102  methyltransferase  57.58 
 
 
330 aa  325  5e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.498999  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3264  S-adenosyl-methyltransferase MraW  58.92 
 
 
324 aa  324  1e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.345832  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3326  S-adenosyl-methyltransferase MraW  58.92 
 
 
324 aa  324  1e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.33134  normal  0.0930873 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0888  S-adenosyl-methyltransferase MraW  58.25 
 
 
357 aa  321  9.999999999999999e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127807  normal  0.556593 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10730  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.91 
 
 
331 aa  315  9e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.101108  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1002  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.95 
 
 
329 aa  312  3.9999999999999997e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.173656  normal  0.35272 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13680  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.12 
 
 
331 aa  308  1.0000000000000001e-82  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.381584  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2862  S-adenosylmethionine-dependentmethyltransferase  57.97 
 
 
330 aa  307  2.0000000000000002e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0173  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.55 
 
 
359 aa  305  5.0000000000000004e-82  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1399  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.97 
 
 
327 aa  287  1e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.466335  normal  0.0101144 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1109  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.35 
 
 
345 aa  270  2.9999999999999997e-71  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.694577 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2119  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.23 
 
 
310 aa  268  1e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1833  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.23 
 
 
310 aa  268  1e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0404  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.25 
 
 
313 aa  259  6e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09010  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.04 
 
 
311 aa  256  3e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1572  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.01 
 
 
291 aa  252  5.000000000000001e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0770  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.75 
 
 
307 aa  252  7e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.910807  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0500  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.95 
 
 
312 aa  251  2e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.214758 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3982  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.18 
 
 
303 aa  249  3e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1046  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.55 
 
 
311 aa  249  5e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09570  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.45 
 
 
321 aa  249  6e-65  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.142549 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3745  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.69 
 
 
310 aa  248  8e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.627703  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2568  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.55 
 
 
310 aa  248  8e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3964  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.87 
 
 
310 aa  248  9e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3971  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.87 
 
 
310 aa  248  1e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000219611  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3660  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.87 
 
 
310 aa  248  1e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1296  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.26 
 
 
315 aa  247  2e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2479  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.26 
 
 
317 aa  247  2e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00084637  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3677  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.87 
 
 
310 aa  246  3e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1034  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.51 
 
 
325 aa  246  3e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4057  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.87 
 
 
310 aa  246  3e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3933  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.87 
 
 
310 aa  246  3e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0745363 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2103  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.47 
 
 
318 aa  246  4e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.871693  hitchhiker  0.00489448 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0478  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.04 
 
 
327 aa  245  6e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3077  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.91 
 
 
311 aa  245  8e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1269  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.67 
 
 
316 aa  245  9e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3769  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.55 
 
 
310 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.865675  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1222  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.23 
 
 
310 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000949855  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4019  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.23 
 
 
310 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.219657  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2017  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.45 
 
 
308 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3297  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.81 
 
 
313 aa  243  3e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1444  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.84 
 
 
324 aa  242  5e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0770792  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0483  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.63 
 
 
312 aa  242  7.999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08780  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.22 
 
 
318 aa  240  2e-62  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000136527 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0744  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.88 
 
 
311 aa  239  5.999999999999999e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.33376  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0667  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.03 
 
 
313 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1263  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.23 
 
 
311 aa  238  1e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1238  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.23 
 
 
311 aa  238  1e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1105  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.57 
 
 
327 aa  237  2e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1012  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.44 
 
 
310 aa  237  2e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1668  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.21 
 
 
316 aa  233  3e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0285  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.97 
 
 
315 aa  231  1e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0678  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.98 
 
 
313 aa  231  1e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0585  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.88 
 
 
318 aa  230  2e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1209  S-adenosyl-methyltransferase MraW  39.3 
 
 
315 aa  230  2e-59  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.034127  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1884  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.23 
 
 
310 aa  230  3e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0341  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.09 
 
 
349 aa  228  1e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000642562  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3777  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.1 
 
 
314 aa  227  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0880861  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_282  S-adenosyl-methyltransferase  42.09 
 
 
349 aa  226  4e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000442175  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0476  S-adenosyl-methyltransferase MraW  37.62 
 
 
313 aa  226  6e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00757887  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1500  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.97 
 
 
312 aa  224  1e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2210  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  46.3 
 
 
314 aa  224  2e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0172475  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0835  methyltransferase  45.37 
 
 
318 aa  224  2e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.591389 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0320  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.46 
 
 
349 aa  223  4.9999999999999996e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000221131  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1852  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.62 
 
 
345 aa  222  6e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.787107 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0981  S-adenosyl-methyltransferase MraW  38.78 
 
 
313 aa  222  7e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.575492  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4992  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.99 
 
 
313 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2795  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.45 
 
 
312 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000553872  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0733  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.71 
 
 
323 aa  220  3e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0144586  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4520  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.35 
 
 
315 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0936  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.35 
 
 
315 aa  219  5e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1329  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.35 
 
 
315 aa  219  6e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95493  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0935  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.07 
 
 
298 aa  219  6e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>