More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4520 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4520  S-adenosyl-methyltransferase MraW  100 
 
 		 315 aa  630  1e-179  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1329  S-adenosyl-methyltransferase MraW  99.05 
 
 		 315 aa  625  1e-178  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4395  S-adenosyl-methyltransferase MraW  99.37 
 
 		 315 aa  625  1e-178  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.216905  normal  0.387462 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0936  S-adenosyl-methyltransferase MraW  98.73 
 
 		 315 aa  623  1e-177  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4110  S-adenosyl-methyltransferase MraW  89.78 
 
 		 313 aa  567  1e-161  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0936286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4681  S-adenosyl-methyltransferase MraW  89.84 
 
 		 315 aa  570  1e-161  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0572625 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4416  S-adenosyl-methyltransferase MraW  86.9 
 
 		 313 aa  557  1e-158  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0799414  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4992  S-adenosyl-methyltransferase MraW  83.07 
 
 		 313 aa  528  1e-149  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57450  S-adenosyl-methyltransferase MraW  82.75 
 
 		 313 aa  523  1e-147  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0914  S-adenosyl-methyltransferase MraW  81.09 
 
 		 314 aa  513  1e-144  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357676  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13170  S-adenosyl-methyltransferase MraW  77.96 
 
 		 313 aa  498  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.916249  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2622  S-adenosyl-methyltransferase MraW  58.82 
 
 		 312 aa  362  7.0000000000000005e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.985865  unclonable  0.00000000000627506 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0840  S-adenosyl-methyltransferase MraW  59.29 
 
 		 312 aa  349  3e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2198  methyltransferase  59.42 
 
 		 331 aa  345  4e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3600  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.77 
 
 		 314 aa  343  2e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3788  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.45 
 
 		 314 aa  342  2.9999999999999997e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3478  S-adenosyl-methyltransferase MraW  58.47 
 
 		 317 aa  342  7e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000297627  hitchhiker  0.00686608 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0478  S-adenosyl-methyltransferase MraW  58.79 
 
 		 317 aa  341  8e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00083  S-adenosyl-methyltransferase  56.37 
 
 		 313 aa  338  5e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3518  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.37 
 
 		 313 aa  338  5e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0087  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.37 
 
 		 313 aa  338  5e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.519171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0090  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.37 
 
 		 313 aa  338  5e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.929573 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0075  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.37 
 
 		 313 aa  338  5e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00082  hypothetical protein  56.37 
 
 		 313 aa  338  5e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3575  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.37 
 
 		 313 aa  338  5e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.723742  hitchhiker  0.000748743 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0088  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.37 
 
 		 313 aa  338  5e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0084  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.37 
 
 		 313 aa  338  5e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.796275  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0640  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.45 
 
 		 313 aa  338  8e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0602  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.13 
 
 		 313 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0132  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.91 
 
 		 313 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.673826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2844  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.83 
 
 		 313 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.302053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0137  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.59 
 
 		 313 aa  336  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0132  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.59 
 
 		 313 aa  336  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000516622 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0129  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.59 
 
 		 313 aa  336  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0136  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.59 
 
 		 313 aa  336  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.130148 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2732  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.47 
 
 		 319 aa  335  3.9999999999999995e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3637  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.51 
 
 		 313 aa  335  7e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2852  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.47 
 
 		 319 aa  335  9e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2681  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.51 
 
 		 317 aa  333  2e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3097  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.15 
 
 		 319 aa  332  5e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0522  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.19 
 
 		 313 aa  332  6e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0551  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.19 
 
 		 313 aa  332  6e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0975  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.9 
 
 		 308 aa  332  7.000000000000001e-90  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0945  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.9 
 
 		 308 aa  332  7.000000000000001e-90  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0480  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.19 
 
 		 313 aa  331  9e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.64263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2460  S-adenosyl-methyltransferase MraW  58.06 
 
 		 319 aa  331  9e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0455  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.19 
 
 		 313 aa  330  2e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.410064  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03266  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.8 
 
 		 313 aa  329  4e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00192279  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3558  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.23 
 
 		 313 aa  328  6e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2559  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.23 
 
 		 313 aa  328  7e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3553  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.23 
 
 		 313 aa  328  7e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.707909  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3533  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.23 
 
 		 313 aa  328  7e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1339  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.23 
 
 		 313 aa  328  7e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0480  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.23 
 
 		 313 aa  328  7e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.270235  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0069  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.87 
 
 		 313 aa  328  7e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3224  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.23 
 
 		 313 aa  328  7e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1110  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.23 
 
 		 313 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3527  S-adenosyl-methyltransferase MraW  52.75 
 
 		 311 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0753  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.53 
 
 		 313 aa  326  3e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0347  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.55 
 
 		 313 aa  326  3e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.790423  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0205  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.92 
 
 		 307 aa  326  3e-88  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1139  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.05 
 
 		 315 aa  325  6e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.148614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1991  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.59 
 
 		 307 aa  325  7e-88  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.105239  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0628  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.34 
 
 		 313 aa  323  2e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.813958  normal  0.404063 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3812  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.55 
 
 		 313 aa  322  5e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4473  S-adenosyl-methyltransferase MraW  52.37 
 
 		 316 aa  320  9.999999999999999e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2926  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.42 
 
 		 320 aa  320  1.9999999999999998e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3395  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.42 
 
 		 320 aa  320  1.9999999999999998e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3526  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.42 
 
 		 320 aa  320  1.9999999999999998e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.708442  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0346  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.19 
 
 		 313 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.859571  normal  0.194945 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2987  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.56 
 
 		 332 aa  317  1e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3506  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.4 
 
 		 308 aa  316  4e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1987  S-adenosyl-methyltransferase MraW  52.02 
 
 		 316 aa  315  5e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0378  S-adenosyl-methyltransferase MraW  52.26 
 
 		 313 aa  315  7e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.843738 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3578  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.94 
 
 		 313 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.461351 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4227  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.61 
 
 		 313 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3136  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.89 
 
 		 325 aa  313  1.9999999999999998e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3751  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.94 
 
 		 313 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187007 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0402  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.94 
 
 		 314 aa  312  4.999999999999999e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000191827 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0419  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.29 
 
 		 313 aa  311  6.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000814721 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0405  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.29 
 
 		 313 aa  311  6.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000604669 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0394  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.29 
 
 		 313 aa  311  6.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0393  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.29 
 
 		 313 aa  311  6.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2869  methyltransferase  58.31 
 
 		 315 aa  311  7.999999999999999e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0479  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.61 
 
 		 313 aa  311  1e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3819  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.61 
 
 		 315 aa  309  2.9999999999999997e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4541  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.29 
 
 		 313 aa  308  5e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0129716 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0595  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.88 
 
 		 322 aa  307  1.0000000000000001e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.835578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3461  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50.65 
 
 		 313 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.151811 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0350  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.27 
 
 		 319 aa  306  3e-82  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0559  methyltransferase  51.79 
 
 		 314 aa  305  6e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000972435  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00894  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50.32 
 
 		 316 aa  305  7e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2277  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.22 
 
 		 321 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.390656 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3435  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.25 
 
 		 311 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.022663  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0761  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.79 
 
 		 314 aa  302  6.000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.423015  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2055  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.63 
 
 		 340 aa  301  1e-80  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.625831  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0111  methyltransferase  53.75 
 
 		 311 aa  300  2e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0724488 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2652  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.37 
 
 		 316 aa  300  2e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04374  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.25 
 
 		 347 aa  299  3e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0524  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.38 
 
 		 317 aa  299  4e-80  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>