More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_282 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0341  S-adenosyl-methyltransferase MraW  96.85 
 
 
349 aa  694    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000642562  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0320  S-adenosyl-methyltransferase MraW  93.41 
 
 
349 aa  675    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000221131  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_282  S-adenosyl-methyltransferase  100 
 
 
349 aa  716    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000442175  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1616  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.82 
 
 
304 aa  323  2e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2844  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.76 
 
 
301 aa  311  1e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3982  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.16 
 
 
303 aa  287  2e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1046  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.38 
 
 
311 aa  287  2e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0667  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.71 
 
 
313 aa  286  5e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1103  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.47 
 
 
312 aa  285  7e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000544385  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3519  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.38 
 
 
337 aa  282  6.000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0770  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.56 
 
 
307 aa  282  7.000000000000001e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.910807  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0500  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.4 
 
 
312 aa  280  2e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.214758 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3778  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.62 
 
 
313 aa  281  2e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00382948  hitchhiker  0.000103872 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09010  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.45 
 
 
311 aa  279  4e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0981  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.83 
 
 
313 aa  278  1e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.575492  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1269  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.1 
 
 
316 aa  277  2e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0404  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.33 
 
 
313 aa  276  4e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4071  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.42 
 
 
310 aa  275  7e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0787  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.85 
 
 
309 aa  275  1.0000000000000001e-72  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3077  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.54 
 
 
311 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0733  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.2 
 
 
323 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0144586  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3463  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.71 
 
 
319 aa  274  2.0000000000000002e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000923351 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1444  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.45 
 
 
324 aa  273  5.000000000000001e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0770792  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0963  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.73 
 
 
361 aa  271  1e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0178075 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2017  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.48 
 
 
308 aa  268  1e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0483  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.76 
 
 
312 aa  268  1e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1296  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.34 
 
 
315 aa  268  2e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1884  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.25 
 
 
310 aa  267  2e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2119  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.19 
 
 
310 aa  265  8.999999999999999e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1833  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.19 
 
 
310 aa  265  8.999999999999999e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1034  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.63 
 
 
325 aa  264  1e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09570  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.08 
 
 
321 aa  264  2e-69  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.142549 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1852  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.1 
 
 
345 aa  261  8.999999999999999e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.787107 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1207  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.18 
 
 
306 aa  261  1e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0585  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.28 
 
 
318 aa  259  5.0000000000000005e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3297  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.84 
 
 
313 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2479  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.69 
 
 
317 aa  259  6e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00084637  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1985  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.07 
 
 
308 aa  258  1e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000115812  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0975  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.28 
 
 
296 aa  258  1e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000346551  normal  0.234872 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3964  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.83 
 
 
310 aa  257  2e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1653  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.48 
 
 
316 aa  258  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.489649 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3971  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.83 
 
 
310 aa  256  3e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000219611  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3196  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.18 
 
 
305 aa  256  4e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.421638  decreased coverage  0.00000374346 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0678  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.83 
 
 
313 aa  256  4e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4019  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.51 
 
 
310 aa  255  7e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.219657  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2103  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.4 
 
 
318 aa  254  1.0000000000000001e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.871693  hitchhiker  0.00489448 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3660  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.51 
 
 
310 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3677  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.51 
 
 
310 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0738  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.9 
 
 
332 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0462605  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4057  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.51 
 
 
310 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1222  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.51 
 
 
310 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000949855  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2568  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.51 
 
 
310 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3933  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.51 
 
 
310 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0745363 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2210  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  46.28 
 
 
314 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0172475  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3769  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.51 
 
 
310 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.865675  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0835  methyltransferase  47.62 
 
 
318 aa  253  4.0000000000000004e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.591389 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0285  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.09 
 
 
315 aa  252  5.000000000000001e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3745  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.86 
 
 
310 aa  252  7e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.627703  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2614  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.01 
 
 
320 aa  252  7e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.624613  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0478  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.79 
 
 
327 aa  251  1e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4056  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.63 
 
 
332 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00662143  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1012  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.66 
 
 
310 aa  251  1e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0744  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.3 
 
 
311 aa  251  2e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.33376  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2795  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.9 
 
 
312 aa  249  4e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000553872  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0163  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.75 
 
 
299 aa  249  4e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0366877 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1263  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.63 
 
 
311 aa  249  4e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1238  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.63 
 
 
311 aa  249  4e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1198  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.3 
 
 
315 aa  248  8e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00016413  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08780  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.35 
 
 
318 aa  248  1e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000136527 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2460  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.75 
 
 
319 aa  246  3e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1668  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.45 
 
 
316 aa  246  4e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0476  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.63 
 
 
313 aa  246  4.9999999999999997e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00757887  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1105  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.05 
 
 
327 aa  245  8e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1991  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43 
 
 
307 aa  245  9e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.105239  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1572  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.98 
 
 
291 aa  245  9e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0205  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43 
 
 
307 aa  245  9.999999999999999e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0840  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.77 
 
 
312 aa  244  1.9999999999999999e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1997  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.19 
 
 
283 aa  243  3.9999999999999997e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.983308  normal  0.573092 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1986  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.72 
 
 
337 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.376194  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3751  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.56 
 
 
294 aa  239  5e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0595  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.05 
 
 
322 aa  239  5.999999999999999e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.835578  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4161  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.73 
 
 
304 aa  238  9e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1562  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.81 
 
 
332 aa  238  1e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3637  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.49 
 
 
313 aa  237  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0684  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.15 
 
 
355 aa  237  2e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.206992 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3402  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.86 
 
 
398 aa  237  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.160139  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1255  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.88 
 
 
295 aa  236  3e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00341421  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4816  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.76 
 
 
283 aa  237  3e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0914  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.78 
 
 
314 aa  236  4e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357676  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3777  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.04 
 
 
314 aa  236  4e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0880861  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2844  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.49 
 
 
313 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.302053  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4200  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.73 
 
 
304 aa  236  6e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24970  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.39 
 
 
327 aa  235  7e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.886239 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2038  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.95 
 
 
301 aa  235  7e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12195  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.17 
 
 
396 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0705243  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1500  methyltransferase  44.23 
 
 
312 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0356236  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0455  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.63 
 
 
313 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.410064  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4473  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.72 
 
 
316 aa  234  2.0000000000000002e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22880  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.55 
 
 
346 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.555108  normal  0.0421378 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4681  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.52 
 
 
315 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0572625 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>