More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3402 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007958  RPD_3402  S-adenosyl-methyltransferase MraW  100 
 
 
398 aa  787    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.160139  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1986  S-adenosyl-methyltransferase MraW  88.22 
 
 
337 aa  588  1e-167  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.376194  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4056  S-adenosyl-methyltransferase MraW  84.64 
 
 
332 aa  557  1e-157  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00662143  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1271  S-adenosyl-methyltransferase MraW  66.99 
 
 
399 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6182  S-adenosyl-methyltransferase MraW  71.3 
 
 
331 aa  458  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.557144 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2186  S-adenosyl-methyltransferase MraW  77.74 
 
 
330 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.222915  normal  0.85718 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1043  S-adenosyl-methyltransferase MraW  72.29 
 
 
332 aa  395  1e-109  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1852  S-adenosyl-methyltransferase MraW  61.7 
 
 
345 aa  382  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.787107 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5104  S-adenosyl-methyltransferase MraW  60 
 
 
353 aa  345  6e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131212  normal  0.927807 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4641  S-adenosyl-methyltransferase MraW  59.69 
 
 
351 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.059697 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5471  S-adenosyl-methyltransferase MraW  63.49 
 
 
339 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.191975  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5180  S-adenosyl-methyltransferase MraW  60.31 
 
 
351 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0263  S-adenosyl-methyltransferase MraW  63.55 
 
 
337 aa  335  5.999999999999999e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0989467  normal  0.0563961 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2413  S-adenosyl-methyltransferase MraW  61.56 
 
 
339 aa  333  4e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.881331  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2086  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.45 
 
 
334 aa  329  4e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.926608 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2365  S-adenosyl-methyltransferase MraW  61.11 
 
 
353 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0749986 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0684  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.1 
 
 
355 aa  316  6e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.206992 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3477  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.23 
 
 
346 aa  311  1e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3955  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.01 
 
 
322 aa  310  2e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2015  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.17 
 
 
339 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0683  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.23 
 
 
331 aa  302  6.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.856779  normal  0.179081 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1736  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.97 
 
 
347 aa  302  7.000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2090  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.29 
 
 
362 aa  301  1e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00955336 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3675  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.52 
 
 
322 aa  300  3e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.188386 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0772  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.89 
 
 
331 aa  299  5e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.11947  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6038  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.89 
 
 
331 aa  298  8e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1439  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.04 
 
 
346 aa  298  9e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.464087  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2900  S-adenosyl-methyltransferase MraW  52.91 
 
 
341 aa  298  1e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0958  S-adenosyl-methyltransferase MraW  52.41 
 
 
326 aa  297  2e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0583  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.97 
 
 
322 aa  294  1e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.401485  normal  0.166979 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1396  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.42 
 
 
346 aa  293  3e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2602  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.43 
 
 
341 aa  292  8e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172088  normal  0.713664 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1889  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.66 
 
 
325 aa  288  1e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0524165 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0955  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.39 
 
 
331 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2862  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.82 
 
 
341 aa  280  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0167683 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2769  S-adenosyl-methyltransferase MraW  52.27 
 
 
327 aa  275  1.0000000000000001e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.66075  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0170  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.91 
 
 
314 aa  274  2.0000000000000002e-72  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.225843  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2015  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.84 
 
 
329 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1125  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.09 
 
 
329 aa  273  5.000000000000001e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0055  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.52 
 
 
313 aa  264  2e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0491  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.67 
 
 
297 aa  261  2e-68  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0542  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.16 
 
 
297 aa  258  2e-67  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.770048  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0761  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.92 
 
 
313 aa  256  4e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3982  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.69 
 
 
303 aa  256  5e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3178  S-adenosyl-methyltransferase MraW  52.53 
 
 
338 aa  256  6e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.457963  normal  0.965716 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3077  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.37 
 
 
311 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3435  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50.81 
 
 
311 aa  253  5.000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.022663  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0111  methyltransferase  50.96 
 
 
311 aa  252  7e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0724488 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3506  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.85 
 
 
308 aa  251  2e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2622  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.37 
 
 
312 aa  250  3e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.985865  unclonable  0.00000000000627506 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0766  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.49 
 
 
308 aa  250  3e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2844  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.37 
 
 
301 aa  249  4e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0137  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.62 
 
 
313 aa  249  8e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0136  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.62 
 
 
313 aa  249  8e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.130148 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0132  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.62 
 
 
313 aa  249  8e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000516622 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0129  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.62 
 
 
313 aa  249  8e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0132  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.62 
 
 
313 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.673826  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2474  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.79 
 
 
333 aa  245  9e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.508671 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4541  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.58 
 
 
313 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0129716 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0350  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.14 
 
 
319 aa  244  9.999999999999999e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1616  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.91 
 
 
304 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04374  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.1 
 
 
347 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3519  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.62 
 
 
337 aa  244  1.9999999999999999e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0479  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.25 
 
 
313 aa  244  3e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0500  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.43 
 
 
312 aa  244  3e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.214758 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0478  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.06 
 
 
317 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0402  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.58 
 
 
314 aa  242  7.999999999999999e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000191827 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0394  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.75 
 
 
313 aa  242  9e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0393  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.75 
 
 
313 aa  242  9e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0405  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.75 
 
 
313 aa  242  9e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000604669 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0419  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.75 
 
 
313 aa  242  9e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000814721 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3478  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.42 
 
 
317 aa  241  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000297627  hitchhiker  0.00686608 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00083  S-adenosyl-methyltransferase  45.66 
 
 
313 aa  241  2e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3518  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.66 
 
 
313 aa  241  2e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0084  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.66 
 
 
313 aa  241  2e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.796275  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0088  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.66 
 
 
313 aa  241  2e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0087  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.66 
 
 
313 aa  241  2e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.519171  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0090  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.66 
 
 
313 aa  241  2e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.929573 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3575  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.66 
 
 
313 aa  241  2e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.723742  hitchhiker  0.000748743 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0921  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.18 
 
 
296 aa  241  2e-62  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00082  hypothetical protein  45.66 
 
 
313 aa  241  2e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0075  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.66 
 
 
313 aa  241  2e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0454  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.21 
 
 
318 aa  241  2e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.835037 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0404  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.9 
 
 
313 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0378  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.6 
 
 
313 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.843738 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2277  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.59 
 
 
321 aa  240  4e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.390656 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3819  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.23 
 
 
315 aa  239  5e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0483  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.4 
 
 
312 aa  239  5e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3578  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.28 
 
 
313 aa  239  5e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.461351 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0628  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.66 
 
 
313 aa  239  6.999999999999999e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.813958  normal  0.404063 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3751  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.95 
 
 
313 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187007 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2460  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.89 
 
 
319 aa  239  8e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0346  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.43 
 
 
313 aa  239  8e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.859571  normal  0.194945 
 
 
-
 
NC_002936  DET0341  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.86 
 
 
349 aa  238  9e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000642562  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2502  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.37 
 
 
316 aa  239  9e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3526  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.43 
 
 
320 aa  238  9e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.708442  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3395  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.43 
 
 
320 aa  238  9e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4816  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.75 
 
 
283 aa  238  9e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2926  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.43 
 
 
320 aa  238  9e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4227  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.28 
 
 
313 aa  238  1e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>