More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0684 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_0684  S-adenosyl-methyltransferase MraW  100 
 
 
355 aa  696    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.206992 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3477  S-adenosyl-methyltransferase MraW  68.53 
 
 
346 aa  412  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1852  S-adenosyl-methyltransferase MraW  60.53 
 
 
345 aa  347  2e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.787107 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4641  S-adenosyl-methyltransferase MraW  60.66 
 
 
351 aa  346  3e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.059697 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5104  S-adenosyl-methyltransferase MraW  60.06 
 
 
353 aa  340  2e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131212  normal  0.927807 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4056  S-adenosyl-methyltransferase MraW  59.62 
 
 
332 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00662143  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1986  S-adenosyl-methyltransferase MraW  60.39 
 
 
337 aa  338  7e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.376194  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2365  S-adenosyl-methyltransferase MraW  64.61 
 
 
353 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0749986 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6182  S-adenosyl-methyltransferase MraW  63.11 
 
 
331 aa  335  5e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.557144 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5180  S-adenosyl-methyltransferase MraW  61.59 
 
 
351 aa  330  2e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3402  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.1 
 
 
398 aa  330  3e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.160139  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5471  S-adenosyl-methyltransferase MraW  62.14 
 
 
339 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.191975  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0263  S-adenosyl-methyltransferase MraW  62.42 
 
 
337 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0989467  normal  0.0563961 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1271  S-adenosyl-methyltransferase MraW  60.65 
 
 
399 aa  314  9.999999999999999e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0958  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55 
 
 
326 aa  312  5.999999999999999e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2086  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.23 
 
 
334 aa  309  5e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.926608 
 
 
-
 
NC_004310  BR1439  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.07 
 
 
346 aa  308  6.999999999999999e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.464087  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2900  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.75 
 
 
341 aa  307  2.0000000000000002e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2015  S-adenosyl-methyltransferase MraW  61.74 
 
 
339 aa  305  5.0000000000000004e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1396  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.49 
 
 
346 aa  303  2.0000000000000002e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2090  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.89 
 
 
362 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00955336 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1736  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.47 
 
 
347 aa  302  5.000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1889  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.56 
 
 
325 aa  298  7e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0524165 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0772  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.49 
 
 
331 aa  296  3e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.11947  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1125  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.79 
 
 
329 aa  296  5e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6038  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.49 
 
 
331 aa  295  7e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0683  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.87 
 
 
331 aa  295  1e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.856779  normal  0.179081 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2413  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.66 
 
 
339 aa  293  2e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.881331  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2186  S-adenosyl-methyltransferase MraW  59.03 
 
 
330 aa  293  3e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.222915  normal  0.85718 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3955  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.95 
 
 
322 aa  288  1e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2602  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.17 
 
 
341 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172088  normal  0.713664 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1043  S-adenosyl-methyltransferase MraW  60.07 
 
 
332 aa  285  5.999999999999999e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3675  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.37 
 
 
322 aa  282  5.000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.188386 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0583  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.38 
 
 
322 aa  282  8.000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.401485  normal  0.166979 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2844  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.57 
 
 
301 aa  279  6e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2015  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50.76 
 
 
329 aa  277  2e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0761  S-adenosyl-methyltransferase MraW  52.73 
 
 
313 aa  275  1.0000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2862  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.48 
 
 
341 aa  272  7e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0167683 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0955  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50.75 
 
 
331 aa  262  6e-69  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2769  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50.48 
 
 
327 aa  260  3e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.66075  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0341  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.47 
 
 
349 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000642562  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3519  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.36 
 
 
337 aa  253  2.0000000000000002e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3788  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.6 
 
 
314 aa  250  3e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_282  S-adenosyl-methyltransferase  46.15 
 
 
349 aa  250  3e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000442175  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57450  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.68 
 
 
313 aa  249  7e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0320  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.87 
 
 
349 aa  246  4.9999999999999997e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000221131  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3600  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.77 
 
 
314 aa  246  6e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3178  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.18 
 
 
338 aa  245  6.999999999999999e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.457963  normal  0.965716 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4992  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.36 
 
 
313 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0055  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.09 
 
 
313 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0132  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.98 
 
 
313 aa  245  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.673826  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4541  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.93 
 
 
313 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0129716 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3751  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50.16 
 
 
294 aa  244  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0136  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.67 
 
 
313 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.130148 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0914  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.39 
 
 
314 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357676  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0602  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.91 
 
 
313 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0132  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.67 
 
 
313 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000516622 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0595  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.13 
 
 
322 aa  244  1.9999999999999999e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.835578  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0129  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.67 
 
 
313 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0137  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.67 
 
 
313 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0402  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.6 
 
 
314 aa  243  3e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000191827 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2474  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.67 
 
 
333 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.508671 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00083  S-adenosyl-methyltransferase  46.52 
 
 
313 aa  242  9e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3518  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.52 
 
 
313 aa  242  9e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3575  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.52 
 
 
313 aa  242  9e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.723742  hitchhiker  0.000748743 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0075  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.52 
 
 
313 aa  242  9e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0084  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.52 
 
 
313 aa  242  9e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.796275  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0090  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.52 
 
 
313 aa  242  9e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.929573 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0087  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.52 
 
 
313 aa  242  9e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.519171  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00082  hypothetical protein  46.52 
 
 
313 aa  242  9e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0088  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.52 
 
 
313 aa  242  9e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2622  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.21 
 
 
312 aa  241  1e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.985865  unclonable  0.00000000000627506 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3819  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.6 
 
 
315 aa  241  1e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1976  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.21 
 
 
328 aa  241  1e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.169238  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1616  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.18 
 
 
304 aa  241  1e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3461  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.58 
 
 
313 aa  241  1e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.151811 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0640  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.77 
 
 
313 aa  240  2e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0491  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.85 
 
 
297 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4816  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.39 
 
 
283 aa  240  2.9999999999999997e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2055  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.56 
 
 
340 aa  239  4e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.625831  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0542  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.28 
 
 
297 aa  238  9e-62  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.770048  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0163  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.58 
 
 
299 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0366877 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0378  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.63 
 
 
313 aa  238  1e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.843738 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3751  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.63 
 
 
313 aa  238  1e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187007 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4227  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.63 
 
 
313 aa  238  2e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1103  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.21 
 
 
312 aa  237  2e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000544385  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0346  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.28 
 
 
313 aa  238  2e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.859571  normal  0.194945 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0454  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.24 
 
 
318 aa  237  2e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.835037 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13170  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.53 
 
 
313 aa  237  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.916249  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3578  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.63 
 
 
313 aa  238  2e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.461351 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0479  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.63 
 
 
313 aa  237  3e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0347  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.97 
 
 
313 aa  237  3e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.790423  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0393  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.3 
 
 
313 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0405  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.3 
 
 
313 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000604669 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0419  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.3 
 
 
313 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000814721 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0394  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.3 
 
 
313 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04374  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.21 
 
 
347 aa  236  6e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3778  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.57 
 
 
313 aa  235  7e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00382948  hitchhiker  0.000103872 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0628  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.86 
 
 
313 aa  235  9e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.813958  normal  0.404063 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0753  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.3 
 
 
313 aa  234  1.0000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>