More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3463 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3463  S-adenosyl-methyltransferase MraW  100 
 
 
319 aa  635    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000923351 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3982  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.64 
 
 
303 aa  317  2e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0500  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.95 
 
 
312 aa  309  5e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.214758 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3077  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.46 
 
 
311 aa  298  9e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0404  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.14 
 
 
313 aa  297  1e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3297  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.29 
 
 
313 aa  295  6e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0483  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.95 
 
 
312 aa  291  9e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0341  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.35 
 
 
349 aa  290  2e-77  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000642562  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2795  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.06 
 
 
312 aa  290  3e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000553872  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_282  S-adenosyl-methyltransferase  49.02 
 
 
349 aa  288  7e-77  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000442175  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0320  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.69 
 
 
349 aa  285  5e-76  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000221131  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1296  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.19 
 
 
315 aa  283  3.0000000000000004e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3778  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.47 
 
 
313 aa  280  3e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00382948  hitchhiker  0.000103872 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09010  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.21 
 
 
311 aa  280  3e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1269  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.69 
 
 
316 aa  277  1e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0667  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.09 
 
 
313 aa  277  1e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1103  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50.81 
 
 
312 aa  277  2e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000544385  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2844  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50.32 
 
 
301 aa  275  6e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0733  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.51 
 
 
323 aa  273  3e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0144586  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0678  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.06 
 
 
313 aa  272  5.000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1034  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.75 
 
 
325 aa  271  9e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0981  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.87 
 
 
313 aa  271  1e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.575492  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1616  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.41 
 
 
304 aa  271  1e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1046  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.48 
 
 
311 aa  270  2e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0770  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.86 
 
 
307 aa  269  5e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.910807  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0787  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.24 
 
 
309 aa  269  5.9999999999999995e-71  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2210  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  49.68 
 
 
314 aa  268  8e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0172475  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2119  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.56 
 
 
310 aa  267  2e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1833  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.56 
 
 
310 aa  267  2e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1198  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.56 
 
 
315 aa  265  1e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00016413  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2479  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.13 
 
 
317 aa  263  4e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00084637  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0761  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.71 
 
 
313 aa  263  4e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0476  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.32 
 
 
313 aa  260  2e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00757887  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1444  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.35 
 
 
324 aa  257  2e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0770792  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2017  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.52 
 
 
308 aa  257  2e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0963  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.73 
 
 
361 aa  257  2e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0178075 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08780  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.95 
 
 
318 aa  254  1.0000000000000001e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000136527 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2614  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.63 
 
 
320 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.624613  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1105  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.38 
 
 
327 aa  251  1e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1572  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.68 
 
 
291 aa  251  1e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1985  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.91 
 
 
308 aa  250  2e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000115812  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1884  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.83 
 
 
310 aa  249  4e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0958  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.52 
 
 
326 aa  248  1e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1012  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.56 
 
 
310 aa  247  2e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3519  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.29 
 
 
337 aa  247  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2460  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.78 
 
 
319 aa  246  4e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6182  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.91 
 
 
331 aa  244  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.557144 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1852  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.26 
 
 
345 aa  244  9.999999999999999e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.787107 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1653  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.28 
 
 
316 aa  244  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.489649 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09570  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.44 
 
 
321 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.142549 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0975  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.31 
 
 
296 aa  242  6e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000346551  normal  0.234872 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3964  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.91 
 
 
310 aa  241  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5104  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.77 
 
 
353 aa  241  1e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131212  normal  0.927807 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2568  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.91 
 
 
310 aa  241  1e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3745  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.26 
 
 
310 aa  241  1e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.627703  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0738  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.43 
 
 
332 aa  241  1e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0462605  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1562  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.1 
 
 
332 aa  241  1e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3196  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.91 
 
 
305 aa  240  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.421638  decreased coverage  0.00000374346 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4019  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.58 
 
 
310 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.219657  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1986  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.98 
 
 
337 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.376194  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04374  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.83 
 
 
347 aa  240  2.9999999999999997e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3971  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.58 
 
 
310 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000219611  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1222  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.58 
 
 
310 aa  239  4e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000949855  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1207  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.33 
 
 
306 aa  239  5e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3677  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.58 
 
 
310 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3933  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.58 
 
 
310 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0745363 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4057  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.58 
 
 
310 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3769  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.58 
 
 
310 aa  238  1e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.865675  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0478  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.41 
 
 
327 aa  238  1e-61  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4681  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.23 
 
 
315 aa  238  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0572625 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1991  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.97 
 
 
307 aa  238  1e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.105239  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4056  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.66 
 
 
332 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00662143  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0132  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.22 
 
 
313 aa  237  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000516622 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0205  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.3 
 
 
307 aa  237  2e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0129  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.22 
 
 
313 aa  237  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3402  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.97 
 
 
398 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.160139  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4641  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.13 
 
 
351 aa  237  2e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.059697 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0136  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.22 
 
 
313 aa  237  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.130148 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0137  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.22 
 
 
313 aa  237  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0132  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.22 
 
 
313 aa  236  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.673826  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3660  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.26 
 
 
310 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4520  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.47 
 
 
315 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0263  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.71 
 
 
337 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0989467  normal  0.0563961 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4992  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.28 
 
 
313 aa  235  6e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4071  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.56 
 
 
310 aa  235  8e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22880  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.63 
 
 
346 aa  235  8e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.555108  normal  0.0421378 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00083  S-adenosyl-methyltransferase  45.37 
 
 
313 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3518  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.37 
 
 
313 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4110  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.45 
 
 
313 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0936286  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0491  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.83 
 
 
297 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0075  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.37 
 
 
313 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3575  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.37 
 
 
313 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.723742  hitchhiker  0.000748743 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0088  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.37 
 
 
313 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0914  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.98 
 
 
314 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357676  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0084  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.37 
 
 
313 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.796275  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0090  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.37 
 
 
313 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.929573 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0087  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.37 
 
 
313 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.519171  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57450  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.28 
 
 
313 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00082  hypothetical protein  45.37 
 
 
313 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0542  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.58 
 
 
297 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.770048  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>