More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3077 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU3077  S-adenosyl-methyltransferase MraW  100 
 
 
311 aa  621  1e-177  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0404  S-adenosyl-methyltransferase MraW  76.77 
 
 
313 aa  475  1e-133  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3982  S-adenosyl-methyltransferase MraW  67.99 
 
 
303 aa  436  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0500  S-adenosyl-methyltransferase MraW  68.28 
 
 
312 aa  428  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.214758 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3297  S-adenosyl-methyltransferase MraW  68.39 
 
 
313 aa  420  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0483  S-adenosyl-methyltransferase MraW  69.26 
 
 
312 aa  414  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0678  S-adenosyl-methyltransferase MraW  61.81 
 
 
313 aa  367  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1046  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.95 
 
 
311 aa  345  4e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2210  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  60.32 
 
 
314 aa  339  5e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0172475  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0667  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.02 
 
 
313 aa  332  5e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08780  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.57 
 
 
318 aa  327  2.0000000000000001e-88  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000136527 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1269  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.66 
 
 
316 aa  325  7e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2017  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50.16 
 
 
308 aa  324  1e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1296  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50.16 
 
 
315 aa  323  2e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2119  S-adenosyl-methyltransferase MraW  52.41 
 
 
310 aa  321  9.999999999999999e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1833  S-adenosyl-methyltransferase MraW  52.41 
 
 
310 aa  321  9.999999999999999e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09010  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.51 
 
 
311 aa  315  8e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09570  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53 
 
 
321 aa  313  1.9999999999999998e-84  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.142549 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0981  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50.48 
 
 
313 aa  313  2.9999999999999996e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.575492  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0476  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.56 
 
 
313 aa  313  2.9999999999999996e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00757887  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1444  S-adenosyl-methyltransferase MraW  58.44 
 
 
324 aa  311  1e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0770792  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0733  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.1 
 
 
323 aa  310  2e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0144586  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0478  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.27 
 
 
327 aa  297  1e-79  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2103  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.27 
 
 
318 aa  295  7e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.871693  hitchhiker  0.00489448 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2479  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.08 
 
 
317 aa  294  2e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00084637  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1572  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.11 
 
 
291 aa  292  4e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0963  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.55 
 
 
361 aa  291  1e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0178075 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2844  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.31 
 
 
301 aa  291  1e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3463  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.62 
 
 
319 aa  291  1e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000923351 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3964  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.7 
 
 
310 aa  287  2e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3971  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.7 
 
 
310 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000219611  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4071  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.28 
 
 
310 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1034  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50.64 
 
 
325 aa  286  4e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0835  methyltransferase  54.34 
 
 
318 aa  286  4e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.591389 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3745  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.05 
 
 
310 aa  285  5e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.627703  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3677  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.38 
 
 
310 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3933  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.38 
 
 
310 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0745363 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4057  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.38 
 
 
310 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1222  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.05 
 
 
310 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000949855  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4019  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.05 
 
 
310 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.219657  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3769  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.38 
 
 
310 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.865675  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0770  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.93 
 
 
307 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.910807  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2795  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.4 
 
 
312 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000553872  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2568  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.05 
 
 
310 aa  282  6.000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3660  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.05 
 
 
310 aa  281  7.000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3519  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.66 
 
 
337 aa  281  1e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2086  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.92 
 
 
334 aa  280  3e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.926608 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1616  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50.16 
 
 
304 aa  279  4e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3763  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.16 
 
 
310 aa  279  5e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.290741  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0738  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.87 
 
 
332 aa  279  5e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0462605  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3819  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.52 
 
 
310 aa  279  6e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.45289  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3903  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.52 
 
 
310 aa  278  6e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0787  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.03 
 
 
309 aa  278  1e-73  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0320  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.23 
 
 
349 aa  277  2e-73  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000221131  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3778  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.7 
 
 
313 aa  277  2e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00382948  hitchhiker  0.000103872 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1105  S-adenosyl-methyltransferase MraW  52.41 
 
 
327 aa  277  2e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1207  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.02 
 
 
306 aa  275  6e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0341  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.9 
 
 
349 aa  275  9e-73  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000642562  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4681  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.28 
 
 
315 aa  275  9e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0572625 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_282  S-adenosyl-methyltransferase  48.54 
 
 
349 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000442175  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3777  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50.8 
 
 
314 aa  273  3e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0880861  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0914  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.12 
 
 
314 aa  273  3e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357676  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4992  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50.48 
 
 
313 aa  273  3e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1103  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.55 
 
 
312 aa  272  4.0000000000000004e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000544385  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4416  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50 
 
 
313 aa  271  1e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0799414  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57450  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50.16 
 
 
313 aa  270  2e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1012  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.22 
 
 
310 aa  270  2e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1985  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.06 
 
 
308 aa  269  4e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000115812  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0761  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.83 
 
 
313 aa  269  5.9999999999999995e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2614  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.08 
 
 
320 aa  268  8.999999999999999e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.624613  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3196  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50.16 
 
 
305 aa  267  2e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.421638  decreased coverage  0.00000374346 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0744  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.95 
 
 
311 aa  266  2.9999999999999995e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.33376  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3876  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.72 
 
 
310 aa  266  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1238  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.31 
 
 
311 aa  266  4e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1263  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.31 
 
 
311 aa  266  4e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4110  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.68 
 
 
313 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0936286  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1209  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.38 
 
 
315 aa  264  1e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.034127  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0766  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.98 
 
 
308 aa  263  2e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4056  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.67 
 
 
332 aa  263  4e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00662143  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1884  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.19 
 
 
310 aa  262  6e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2663  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.52 
 
 
336 aa  261  1e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0936  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.36 
 
 
315 aa  257  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0585  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.83 
 
 
318 aa  257  2e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4520  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.04 
 
 
315 aa  256  3e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2418  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.04 
 
 
333 aa  255  8e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0532516 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13170  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.04 
 
 
313 aa  254  1.0000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.916249  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1329  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.72 
 
 
315 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95493  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4395  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.72 
 
 
315 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.216905  normal  0.387462 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2365  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50.65 
 
 
353 aa  253  3e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0749986 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0840  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.16 
 
 
312 aa  252  4.0000000000000004e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3402  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.37 
 
 
398 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.160139  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2460  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.43 
 
 
319 aa  252  7e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2436  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.29 
 
 
301 aa  251  1e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3600  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.03 
 
 
314 aa  249  3e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1986  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.06 
 
 
337 aa  250  3e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.376194  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1653  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.87 
 
 
316 aa  250  3e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.489649 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3518  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.89 
 
 
313 aa  249  4e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0084  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.89 
 
 
313 aa  249  4e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.796275  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0090  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.89 
 
 
313 aa  249  4e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.929573 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0087  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.89 
 
 
313 aa  249  4e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.519171  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>