More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3220 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_3220  S-adenosyl-methyltransferase MraW  100 
 
 
371 aa  727    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0668029 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3446  S-adenosyl-methyltransferase MraW  91.62 
 
 
372 aa  639    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.597717  normal  0.0548232 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2663  S-adenosyl-methyltransferase MraW  60.3 
 
 
336 aa  378  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5106  S-adenosyl-methyltransferase MraW  63.34 
 
 
327 aa  366  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0516888  normal  0.108536 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2934  S-adenosyl-methyltransferase MraW  63.91 
 
 
337 aa  360  2e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00284592  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5774  S-adenosyl-methyltransferase MraW  62.1 
 
 
316 aa  357  9.999999999999999e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.752734  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1407  S-adenosyl-methyltransferase MraW  62.07 
 
 
321 aa  355  1e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00650999  hitchhiker  0.00170065 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2654  S-adenosyl-methyltransferase MraW  59.01 
 
 
331 aa  353  2e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0888  S-adenosyl-methyltransferase MraW  62.78 
 
 
357 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127807  normal  0.556593 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1102  methyltransferase  62.33 
 
 
330 aa  352  5e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.498999  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1653  S-adenosyl-methyltransferase MraW  60.26 
 
 
316 aa  352  5e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.489649 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3071  S-adenosyl-methyltransferase MraW  61.86 
 
 
319 aa  352  5e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0302613  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24970  S-adenosyl-methyltransferase MraW  60.26 
 
 
327 aa  351  1e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.886239 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3270  S-adenosyl-methyltransferase MraW  63.61 
 
 
330 aa  345  6e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000287987  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1562  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.87 
 
 
332 aa  345  1e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3025  S-adenosyl-methyltransferase MraW  59.29 
 
 
336 aa  342  5.999999999999999e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.106729  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3207  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.14 
 
 
391 aa  341  2e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00627417  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12195  S-adenosyl-methyltransferase MraW  58.33 
 
 
396 aa  339  4e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0705243  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1588  S-adenosyl-methyltransferase MraW  61.59 
 
 
333 aa  335  7e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.120607  normal  0.39264 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1563  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56 
 
 
330 aa  333  3e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3531  S-adenosyl-methyltransferase MraW  58.1 
 
 
378 aa  332  5e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0334223  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3933  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.24 
 
 
348 aa  331  1e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00956615  normal  0.253817 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2980  S-adenosyl-methyltransferase MraW  58.65 
 
 
371 aa  331  1e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.540896  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16640  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.56 
 
 
335 aa  329  4e-89  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0807568  normal  0.0139402 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2862  S-adenosylmethionine-dependentmethyltransferase  63.12 
 
 
330 aa  330  4e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22880  S-adenosyl-methyltransferase MraW  58.46 
 
 
346 aa  325  6e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.555108  normal  0.0421378 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2418  S-adenosyl-methyltransferase MraW  58.33 
 
 
333 aa  321  9.999999999999999e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0532516 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1276  S-adenosyl-methyltransferase MraW  58.54 
 
 
351 aa  319  6e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.462146  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1399  S-adenosyl-methyltransferase MraW  63.28 
 
 
327 aa  318  1e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.466335  normal  0.0101144 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3275  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.97 
 
 
324 aa  315  7e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1002  S-adenosyl-methyltransferase MraW  58.99 
 
 
329 aa  311  1e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.173656  normal  0.35272 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1066  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.29 
 
 
334 aa  303  2.0000000000000002e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10730  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.75 
 
 
331 aa  303  3.0000000000000004e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.101108  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3264  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.97 
 
 
324 aa  300  2e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.345832  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3326  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.97 
 
 
324 aa  300  2e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.33134  normal  0.0930873 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13680  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50.48 
 
 
331 aa  283  2.0000000000000002e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.381584  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0173  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.53 
 
 
359 aa  282  5.000000000000001e-75  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09010  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.31 
 
 
311 aa  266  2.9999999999999995e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1034  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.58 
 
 
325 aa  261  2e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08780  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.34 
 
 
318 aa  258  1e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000136527 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1296  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.63 
 
 
315 aa  258  1e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09570  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.34 
 
 
321 aa  258  2e-67  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.142549 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2017  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.09 
 
 
308 aa  257  2e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1572  S-adenosyl-methyltransferase MraW  52.26 
 
 
291 aa  256  5e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1269  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.84 
 
 
316 aa  254  2.0000000000000002e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1444  S-adenosyl-methyltransferase MraW  52.08 
 
 
324 aa  253  4.0000000000000004e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0770792  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2119  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.35 
 
 
310 aa  253  4.0000000000000004e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1833  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.35 
 
 
310 aa  253  4.0000000000000004e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2103  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.94 
 
 
318 aa  251  1e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.871693  hitchhiker  0.00489448 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1046  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.71 
 
 
311 aa  250  4e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2479  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.85 
 
 
317 aa  249  7e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00084637  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0404  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.9 
 
 
313 aa  249  8e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0738  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.52 
 
 
332 aa  248  9e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0462605  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0500  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.54 
 
 
312 aa  247  2e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.214758 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3982  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.24 
 
 
303 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4019  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.13 
 
 
310 aa  245  8e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.219657  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0733  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.42 
 
 
323 aa  245  8e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0144586  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3660  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.81 
 
 
310 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1222  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.13 
 
 
310 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000949855  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2568  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.81 
 
 
310 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1884  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.21 
 
 
310 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3933  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.81 
 
 
310 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0745363 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3677  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.81 
 
 
310 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4057  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.81 
 
 
310 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3964  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.99 
 
 
310 aa  241  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3769  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.49 
 
 
310 aa  241  2e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.865675  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3971  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.99 
 
 
310 aa  241  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000219611  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3745  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.49 
 
 
310 aa  241  2e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.627703  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0770  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.76 
 
 
307 aa  241  2e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.910807  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1109  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.89 
 
 
345 aa  240  4e-62  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.694577 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1012  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.13 
 
 
310 aa  239  5e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0483  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.18 
 
 
312 aa  237  2e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3077  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.63 
 
 
311 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3777  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.6 
 
 
314 aa  233  3e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0880861  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3297  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.08 
 
 
313 aa  232  7.000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0667  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.6 
 
 
313 aa  232  8.000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1238  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.69 
 
 
311 aa  232  9e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1263  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.69 
 
 
311 aa  232  9e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0285  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40 
 
 
315 aa  230  2e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0585  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.8 
 
 
318 aa  230  2e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0744  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.69 
 
 
311 aa  230  3e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.33376  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1668  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.63 
 
 
316 aa  230  3e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0835  methyltransferase  46.69 
 
 
318 aa  230  4e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.591389 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1500  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.49 
 
 
312 aa  229  5e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1105  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.71 
 
 
327 aa  228  9e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0935  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.51 
 
 
298 aa  227  2e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0478  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.99 
 
 
327 aa  227  3e-58  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0981  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.82 
 
 
313 aa  226  4e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.575492  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2210  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  48.09 
 
 
314 aa  226  7e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0172475  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2614  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.16 
 
 
320 aa  225  1e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.624613  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0476  S-adenosyl-methyltransferase MraW  38.92 
 
 
313 aa  222  6e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00757887  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0963  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.95 
 
 
361 aa  222  7e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0178075 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2795  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.63 
 
 
312 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000553872  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4520  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.51 
 
 
315 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1209  S-adenosyl-methyltransferase MraW  38.82 
 
 
315 aa  220  3.9999999999999997e-56  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.034127  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1329  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.82 
 
 
315 aa  219  5e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95493  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0787  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40 
 
 
309 aa  219  7e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4395  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.51 
 
 
315 aa  219  7e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.216905  normal  0.387462 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0936  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.82 
 
 
315 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0341  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.76 
 
 
349 aa  216  5.9999999999999996e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000642562  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>