More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3270 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_3270  S-adenosyl-methyltransferase MraW  100 
 
 
330 aa  634    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000287987  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1653  S-adenosyl-methyltransferase MraW  63.38 
 
 
316 aa  375  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.489649 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1102  methyltransferase  63.58 
 
 
330 aa  367  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.498999  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2934  S-adenosyl-methyltransferase MraW  64.5 
 
 
337 aa  362  5.0000000000000005e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00284592  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3446  S-adenosyl-methyltransferase MraW  65.59 
 
 
372 aa  361  1e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.597717  normal  0.0548232 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24970  S-adenosyl-methyltransferase MraW  61.17 
 
 
327 aa  358  6e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.886239 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3220  S-adenosyl-methyltransferase MraW  63.69 
 
 
371 aa  356  1.9999999999999998e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0668029 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0888  S-adenosyl-methyltransferase MraW  64.1 
 
 
357 aa  355  8.999999999999999e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127807  normal  0.556593 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3207  S-adenosyl-methyltransferase MraW  62.58 
 
 
391 aa  351  1e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00627417  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3933  S-adenosyl-methyltransferase MraW  61.68 
 
 
348 aa  350  2e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00956615  normal  0.253817 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1002  S-adenosyl-methyltransferase MraW  63.49 
 
 
329 aa  350  2e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.173656  normal  0.35272 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5774  S-adenosyl-methyltransferase MraW  62.15 
 
 
316 aa  347  1e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.752734  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2663  S-adenosyl-methyltransferase MraW  58.41 
 
 
336 aa  344  1e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5106  S-adenosyl-methyltransferase MraW  60.84 
 
 
327 aa  343  2e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0516888  normal  0.108536 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3071  S-adenosyl-methyltransferase MraW  61.15 
 
 
319 aa  342  7e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0302613  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1562  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.43 
 
 
332 aa  337  9.999999999999999e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1588  S-adenosyl-methyltransferase MraW  64.63 
 
 
333 aa  336  2.9999999999999997e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.120607  normal  0.39264 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1407  S-adenosyl-methyltransferase MraW  61.89 
 
 
321 aa  333  2e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00650999  hitchhiker  0.00170065 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16640  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.31 
 
 
335 aa  333  3e-90  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0807568  normal  0.0139402 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22880  S-adenosyl-methyltransferase MraW  59.13 
 
 
346 aa  328  9e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.555108  normal  0.0421378 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2654  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.74 
 
 
331 aa  325  8.000000000000001e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3025  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.88 
 
 
336 aa  323  2e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.106729  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1276  S-adenosyl-methyltransferase MraW  59.29 
 
 
351 aa  323  2e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.462146  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2980  S-adenosyl-methyltransferase MraW  59.03 
 
 
371 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.540896  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1399  S-adenosyl-methyltransferase MraW  63.3 
 
 
327 aa  315  6e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.466335  normal  0.0101144 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3531  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.1 
 
 
378 aa  315  7e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0334223  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2862  S-adenosylmethionine-dependentmethyltransferase  64.22 
 
 
330 aa  314  9.999999999999999e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1563  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.3 
 
 
330 aa  313  1.9999999999999998e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2418  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.83 
 
 
333 aa  313  1.9999999999999998e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0532516 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3275  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.19 
 
 
324 aa  310  2e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12195  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.6 
 
 
396 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0705243  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10730  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.53 
 
 
331 aa  298  1e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.101108  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13680  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.88 
 
 
331 aa  298  1e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.381584  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1066  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.66 
 
 
334 aa  295  1e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3264  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.19 
 
 
324 aa  294  2e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.345832  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3326  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.19 
 
 
324 aa  294  2e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.33134  normal  0.0930873 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0173  S-adenosyl-methyltransferase MraW  52.1 
 
 
359 aa  292  6e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1296  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.67 
 
 
315 aa  267  2e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3964  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.59 
 
 
310 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2568  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.59 
 
 
310 aa  266  5e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3677  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.91 
 
 
310 aa  265  7e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3971  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.59 
 
 
310 aa  265  7e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000219611  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4057  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.91 
 
 
310 aa  265  7e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3933  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.91 
 
 
310 aa  265  7e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0745363 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4019  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.27 
 
 
310 aa  264  1e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.219657  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1222  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.27 
 
 
310 aa  263  2e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000949855  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3769  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.59 
 
 
310 aa  263  3e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.865675  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3660  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.59 
 
 
310 aa  262  4.999999999999999e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1269  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50 
 
 
316 aa  260  2e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3745  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.62 
 
 
310 aa  260  3e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.627703  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1046  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.5 
 
 
311 aa  256  4e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1668  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.9 
 
 
316 aa  255  6e-67  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2119  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.55 
 
 
310 aa  253  3e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1833  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.55 
 
 
310 aa  253  3e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1444  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50.8 
 
 
324 aa  252  6e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0770792  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09010  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.49 
 
 
311 aa  251  8.000000000000001e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2017  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.77 
 
 
308 aa  251  1e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0667  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.05 
 
 
313 aa  249  5e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0936  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.42 
 
 
315 aa  249  7e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4520  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.42 
 
 
315 aa  248  9e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1329  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.42 
 
 
315 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95493  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4395  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.42 
 
 
315 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.216905  normal  0.387462 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0935  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.64 
 
 
298 aa  246  3e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0585  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.94 
 
 
318 aa  246  4e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2479  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.41 
 
 
317 aa  245  9e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00084637  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0285  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.27 
 
 
315 aa  243  3e-63  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1572  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.36 
 
 
291 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09570  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.35 
 
 
321 aa  242  5e-63  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.142549 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1034  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.84 
 
 
325 aa  242  7e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1109  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.9 
 
 
345 aa  242  7e-63  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.694577 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0500  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.47 
 
 
312 aa  241  9e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.214758 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4110  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.84 
 
 
313 aa  240  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0936286  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0770  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.17 
 
 
307 aa  239  2.9999999999999997e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.910807  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4681  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.15 
 
 
315 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0572625 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0914  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.42 
 
 
314 aa  239  4e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357676  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4416  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.57 
 
 
313 aa  238  8e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0799414  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2103  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.18 
 
 
318 aa  238  9e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.871693  hitchhiker  0.00489448 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0404  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.92 
 
 
313 aa  237  2e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0476  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.53 
 
 
313 aa  237  2e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00757887  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3777  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.89 
 
 
314 aa  236  4e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0880861  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1238  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.04 
 
 
311 aa  235  7e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1263  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.04 
 
 
311 aa  235  7e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0478  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.65 
 
 
327 aa  234  2.0000000000000002e-60  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08780  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.08 
 
 
318 aa  233  3e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000136527 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4071  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.39 
 
 
310 aa  232  5e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0733  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.98 
 
 
323 aa  231  9e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0144586  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0744  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.36 
 
 
311 aa  231  1e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.33376  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57450  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.84 
 
 
313 aa  231  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3463  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.15 
 
 
319 aa  231  1e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000923351 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0483  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.79 
 
 
312 aa  230  2e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4992  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.52 
 
 
313 aa  230  3e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1012  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.27 
 
 
310 aa  229  4e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3077  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.76 
 
 
311 aa  229  5e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1500  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.55 
 
 
312 aa  229  6e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2844  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.27 
 
 
301 aa  228  9e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3982  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.72 
 
 
303 aa  227  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1991  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.81 
 
 
307 aa  227  2e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.105239  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0341  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.95 
 
 
349 aa  226  3e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000642562  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_282  S-adenosyl-methyltransferase  43.63 
 
 
349 aa  226  3e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000442175  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1151  SAM-dependent methyltransferase for cell envelope biogenesis  40.97 
 
 
314 aa  226  3e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>